8olt

Mitochondrial complex I from Mus musculus in the active state bound with piericidin A

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 218.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	8olt
沉积日期 deposition_date	2023-03-30
结构标题 title	Mitochondrial complex I from Mus musculus in the active state bound with piericidin A
关键词 keywords	Mitochondrial complex I, Respiratory complex I, NADH:ubiquinone oxidoreductase, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	80.03 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	80.02 Å
零角强度 I(0) i0	11885000000.00
分子量 molecular_weight	966510.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1224700 Å³
包络体积 envelope_volume	1693600 Å³
水化壳体积 shell_volume	179320 Å³
包络直径 envelope_diameter	294.0 Å
壳层 Rg shell_rg	74.87 Å
包络 Rg envelope_rg	79.39 Å
形状 Rg shape_rg	80.05 Å
总 Rg total_rg	79.82 Å
总原子数 total_atoms	67795
残基数 n_residues	8202
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	218.2 Å
Rg (实空间) rg_real	77.13 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.02 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1610e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4720e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	78.05 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11820000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8675
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	80.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.339
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.693
角度范围 angular_range	— – 0.0950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0855
最高正则化参数 α highest_alpha	590500000.0000
实空间数据点数 n_real_points	20
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.957; Stabil: 0.983; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (60)

Entity 1 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
分子量 formula_weight	13251.8 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	68075

MNLYTVIFINILLSLTLILVAFWLPQMNLYSEKANPYECGFDPTSSARLPFSMKFFLVAITFLLFDLEIALLLPLPWAIQTIKTSTMMIMAFILVTILSLGLAYEWTQKGLEWTE

Entity 2 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
分子量 formula_weight	24715.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAALAAPGLLSVRILGLRTAQVQLRRVHQSVATEGPSPSPSPSLSSTQSAVSKAGAGAVVPKLSHLPRSRAEYVVTKLDDLINWARRSSLWPMTFGLACCAVEMMHMAAPRYDMDRFGVVFRASPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRKVYDQMPEPRYVVSMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDRIVPVDIYVPGCPPTAEALLYGILQLQRKIKREQKLKIWYRR

Entity 3 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
分子量 formula_weight	30191.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAAAAARVWCRGLLGAASVGRGAGRPSVLWQHVRRESAAADKRPTVRPRSDVTHKQLSAFGEYVAEILPKYVQQVQVSCLDELEICIHPDGVIPTLTFLRDHTNAQFKSLADLTAVDVPTRQNRFEIVYNLLSLRFNSRIRVKTYADELTPIDSIVSVHIAANWYEREVWDMFGVFFFNHPDLRRILTDYGFEGHPFRKDFPLTGYVELRYDDEVKRVVAEPVELAQEFRKFDLNSPWEAFPAYRQPPESLKLEAGDKKPETK

Entity 4 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
分子量 formula_weight	52720.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAALRALRCLRGVGAPVLRPGSGIRLPSQPSRGARQWQPDIEWAEQFSGAVMYPSKETAHWKPPPWNDVDILKEKAVTNMTLNFGPQHPAAHGVLRLVLELSGEMVRKCDPHIGLLHRGTEKLIEYKTYLQALPYFDRLDYVSMMCNEQAYSIAVEKLLNIQPPPRAQWIRVLFGEITRILNHIMAVTTHALDIGAMTPFFWMFEEREKMFEFYERVSGARMHAAYIRPGGVHQDLPLGLLDDIYEFSKNFSLRIDEVEEMLTNNRIWRNRTVDIGVVTAEDALNYGFSGVMLRGSGIQWDLRKTQPYDVYDQVEFDVPIGSRGDCYDRYLCRVEEMRQSLRIIEQCLNKMPPGEIKVDDAKVSPPKRAEMKTSMESLIHHFKLYTEGYQVPPGATYTAIEAPKGEFGVYLVSDGSSRPYRCKIKAPGFAHLAGLDKMSKGHMLADVVAIIGTQDIVFGEIDR

Entity 5 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
分子量 formula_weight	27318.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MFSLALRARATGLAAQWGRHARNLHKTAVHNGAGGALFVHRDTPENNPDTPFDFTPENYKRIEAIVKNYPEGHQAAAVLPVLDLAQRQNGWLPISAMNKVAEVLQVPPMRVYEVATFYTMYNRKPVGKYHIQVCTTTPCMLRDSDSILETLQRKLGIKVGETTPDKLFTLIEVECLGACVNAPMVQINDNYYEDLTPKDIEEIIDELKAGKVPKPGPRSGRFCCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGVQAGL

Entity 6 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
分子量 formula_weight	50904.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MLAARHFLGGLVPVRVSVRFSSGTTAPKKTSFGSLKDEDRIFTNLYGRHDWRLKGALRRGDWYKTKEILLKGPDWILGEMKTSGLRGRGGAGFPTGLKWSFMNKPSDGRPKYLVVNADEGEPGTCKDREIMRHDPHKLVEGCLVGGRAMGARAAYIYIRGEFYNEASNLQVAIREAYEAGLIGKNACGSDYDFDVFVVRGAGAYICGEETALIESIEGKQGKPRLKPPFPADVGVFGCPTTVANVETVAVSPTICRRGGTWFAGFGRERNSGTKLFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIEKHAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPKSVCETVLMDFDALVQAQTGLGTAAVIVMDRSTDIVKAIARLIEFYKHESCGQCTPCREGVDWMNKVMARFVKGDARPAEIDSLWEISKQIEGHTICALGDGAAWPVQGLIRHFRPELEDRMQRFAQQHRAWQAAS

Entity 7 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
分子量 formula_weight	79866.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MLRIPIKRALIGLSNSPKGYVRTTGTAASNLIEVFVDGQSVMVEPGTTVLQACEKVGMQIPRFCYHERLSVAGNCRMCLVEIEKAPKVVAACAMPVMKGWNILTNSEKSKKAREGVMEFLLANHPLDCPICDQGGECDLQDQSMMFGSDRSRFLEGKRAVEDKNIGPLVKTIMTRCIQCTRCIRFASEIAGVDDLGTTGRGNDMQVGTYIEKMFMSELSGNVIDICPVGALTSKPYAFTARPWETRKTESIDVMDAVGSNIVVSTRTGEVMRILPRMHEDINEEWISDKTRFAYDGLKRQRLTEPMVRNEKGLLTYTSWEDALSRVAGMLQNFEGNAVAAIAGGLVDAEALVALKDLLNKVDSDNLCTEEIFPTEGAGTDLRSNYLLNTTIAGVEEADVVLLVGTNPRFEAPLFNARIRKSWLHNDLKVALIGSPVDLTYRYDHLGDSPKILQDIASGRHSFCEVLKDAKKPMVVLGSSALQRDDGAAILVAVSNMVQKIRVTTGVAAEWKVMNILHRIASQVAALDLGYKPGVEAIRKNPPKMLFLLGADGGCITRQDLPKDCFIVYQGHHGDVGAPMADVILPGAAYTEKSATYVNTEGRAQQTKVAVTPPGLAREDWKIIRALSEIAGITLPYDTLDQVRNRLEEVSPNLVRYDDIEETNYFQQASELAKLVNQEVLADPLVPPQLTIKDFYMTDSISRASQTMAKCVKAVTEGAQAVEEPSIC

Entity 8 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
分子量 formula_weight	36105.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MFFINILTLLVPILIAMAFLTLVERKILGYMQLRKGPNIVGPYGILQPFADAMKLFMKEPMRPLTTSMSLFIIAPTLSLTLALSLWVPLPMPHPLINLNLGILFILATSSLSVYSILWSGWASNSKYSLFGALRAVAQTISYEVTMAIILLSVLLMNGSYSLQTLITTQEHMWLLLPAWPMAMMWFISTLAETNRAPFDLTEGESELVSGFNVEYAAGPFALFFMAEYTNIILMNALTTIIFLGPLYYINLPELYSTNFMMEALLLSSTFLWIRASYPRFRYDQLMHLLWKNFLPLTLALCMWHISLPIFTAGVPPYM

Entity 9 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
分子量 formula_weight	24068.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MYRLSSSMLPRALAQAMRTGHLNGQSLHSSAVAATYKYVNKKEQESEVDMKSATDNAARILMWTELIRGLGMTLSYLFREPATINYPFEKGPLSPRFRGEHALRRYPSGEERCIACKLCEAICPAQAITIEAEPRADGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFSTETHEELLYNKEKLLNNGDKWEAEIAANIQADYLYR

Entity 10 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
分子量 formula_weight	18656.1 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MNNYIFVLSSLFLVGCLGLALKPSPIYGGLGLIVSGFVGCLMVLGFGGSFLGLMVFLIYLGGMLVVFGYTTAMATEEYPETWGSNWLILGFLVLGVIMEVFLICVLNYYDEVGVINLDGLGDWLMYEVDDVGVMLEGGIGVAAMYSCATWMMVVAGWSLFAGIFIIIEITRD

Entity 11 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
分子量 formula_weight	10637.6 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MPSTFFNLTMAFSLSLLGTLMFRSHLMSTLLCLEGMVLSLFIMTSVTSLNSNSMSSMPIPITILVFAACEAAVGLALLVKVSNTYGTDYVQNLNLLQC

Entity 12 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
分子量 formula_weight	68547.3 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MNIFTTSILLIFILLLSPILISMSNLIKHINFPLYTTTSIKFSFIISLLPLLMFFHNNMEYMITTWHWVTMNSMELKMSFKTDFFSILFTSVALFVTWSIMQFSSWYMHSDPNINRFIKYLTLFLITMLILTSANNMFQLFIGWEGVGIMSFLLIGWWYGRTDANTAALQAILYNRIGDIGFILAMVWFSLNMNSWELQQIMFSNNNDNLIPLMGLLIAATGKSAQFGLHPWLPSAMEGPTPVSALLHSSTMVVAGIFLLVRFHPLTTNNNFILTTMLCLGALTTLFTAICALTQNDIKKIIAFSTSSQLGLMMVTLGMNQPHLAFLHICTHAFFKAMLFMCSGSIIHSLADEQDIRKMGNITKIMPFTSSCLVIGSLALTGMPFLTGFYSKDLIIEAINTCNTNAWALLITLIATSMTAMYSMRIIYFVTMTKPRFPPLISINENDPDLMNPIKRLAFGSIFAGFVISYNIPPTSIPVLTMPWFLKTTALIISVLGFLIALELNNLTMKLSMNKANPYSSFSTLLGFFPSIIHRITPMKSLNLSLKTSLTLLDLIWLEKTIPKSTSTLHTNMTTLTTNQKGLIKLYFMSFLINIILIIILYSINLE

Entity 13 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
分子量 formula_weight	51943.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MLKIILPSLMLLPLTWLSSPKKTWTNVTSYSFLISLTSLTLLWQTDENYKNFSNMFSSDPLSTPLIILTAWLLPLMLMASQNHLKKDNNVLQKLYISMLISLQILLIMTFSATELIMFYILFEATLIPTLIIITRWGNQTERLNAGIYFLFYTLIGSIPLLIALILIQNHVGTLNLMILSFTTHTLDASWSNNLLWLACMMAFLIKMPLYGVHLWLPKAHVEAPIAGSMILAAILLKLGSYGMIRISIILDPLTKYMAYPFILLSLWGMIMTSSICLRQTDLKSLIAYSSVSHMALVIASIMIQTPWSFMGATMLMIAHGLTSSLLFCLANSNYERIHSRTMIMARGLQMVFPLMATWWLMASLANLALPPSINLMGELFITMSLFSWSNFTIILMGINIIITGMYSMYMIITTQRGKLTNHMINLQPSHTRELTLMALHMIPLILLTTSPKLITGLTM

Entity 14 polymer

描述 description	NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
分子量 formula_weight	38800.2 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MNPITLAIIYFTIFLGPVITMSSTNLMLMWVGLEFSLLAIIPMLINKKNPRSTEAATKYFVTQATASMIILLAIVLNYKQLGTWMFQQQTNGLILNMTLMALSMKLGLAPFHFWLPEVTQGIPLHMGLILLTWQKIAPLSILIQIYPLLNSTIILMLAITSIFMGAWGGLNQTQMRKIMAYSSIAHMGWMLAILPYNPSLTLLNLMIYIILTAPMFMALMLNNSMTINSISLLWNKTPAMLTMISLMLLSLGGLPPLTGFLPKWIIITELMKNNCLIMATLMAMMALLNLFFYTRLIYSTSLTMFPTNNNSKMMTHQTKTKPNLMFSTLAIMSTMTLPLAPQLIT

Entity 15 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
分子量 formula_weight	40657.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MALRLLRLVPASAPARGLAAGAQRVGRIHTSVHCKLRYGLLAAILGDKTTKKLHEYSRVITVDGNICSGKNKLAKEIAQQLGMKHYPEAGIQYSSTTTGDGRPLDIEFSGSCSLEKFYDDPKSNDGNSYRLQSWLYASRLLQYADALEHLLSTGQGVVLERSIYSDFVFLEAMYNQGYIRKQCVDHYNEIKRLTLPEYLPPHAVIYIDVPVPEVQSRIQKKGDPHEMKVTSAYLQDIENAYKKTFLPKMSEMCEVLVYDSWEAEDPTKVVEDIEYLKYNKGPWLKQDDWTFHYLRMLVQDKTEVLNYTTIPVYLPEITIGAHQGSRIYNSFRELPGRKYAPGYNAEVGDKWIWLK

Entity 16 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
分子量 formula_weight	42588.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MAAAVRFRVVRALPMSRPAITAAATSVFCGSSHRQLHHAVIPHGKGGRSSVSGVVATVFGATGFLGRYVVNHLGRMGSQVIIPYRCDVYDIMHLRLMGDLGQLTFLEWDARDKDSIRKAVQHSNVVINLIGREWETRNFDFEDVFVNIPRAIAQASKEAGVERFIHVSHLNASMKSSSKSLRSKAVGEKEVRSVFPEAIIIRPSDIFGREDRFLNHFANYRWFLAVPLVSLGFKTVKQPVYVADVSKGIVNATKDPDAVGKTFAFTGPNRYLLFHLVKYIFGMTHRTFIPYPLPLFVYSWIGKLFGLSPFEPWTTKDKVERIHISDVMPTDLPGLEDLGVQPTPLELKSIEVLRRHRTYRWLSSEIEETKPAKTVNY

Entity 17 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
分子量 formula_weight	19814.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MAAVSISVSLRQAMLGRRAMATAAVSVCRVPSRLLSTSTWKLADNQTRDTQLITVDEKLDITTLTGVPEEHIKTRKVRIFVPARNNMQSGVNNTKKWKMEFDTRERWENPLMGWASTADPLSNMVLTFSAKEDAIAFAEKNGWSYDVEEKKVPKPKSKSYGANFSWNKRTRVSTK

Entity 18 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
分子量 formula_weight	13041.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MAAVLTFRRLLTLPRAARGFGVQVSPSGEKITHTGQVYDEKDYRRVRFVDRQKEVNENFAIDLIAQQPVNEVEHRIIACDGGGGALGHPKVYINLDKETKTGTCGYCGLQFKQHHH

Entity 19 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
分子量 formula_weight	10932.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MAAAAASRAVGAKLGLREIRVHLCQRSPGSQGVRDFIVQRYVELKKAHPNLPILIRECSEVQPKLWARYAFGQEKTVSLNNLSADEVTRAMQNVLSGKA

Entity 20 polymer

描述 description	Acyl carrier protein, mitochondrial
分子量 formula_weight	17390.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,U

MASRVLCACVRRLPAAFAPLPRLPTLALARPLSTTLCPEGIRRRPGALQSALALAQVPGTVTHLCRQYSDAPPLTLDGIKDRVLYVLKLYDKIDPEKLSVNSHFMKDLGLDSLDQVEIIMAMEDEFGFEIPDIDAEKLMCPQEIVDYIADKKDVYE

Entity 21 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
分子量 formula_weight	13380.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MAGLLKKTTGLVGLAVCDTPHERLTILYTKTLDILKHFPKHAAYRKYTEQITNEKLDMVKAEPDVKKLEALLQGGEVEEVILQAEKELSLARKMLKWKPWEPLVEEPPANQWKWPI

Entity 22 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
分子量 formula_weight	15311.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MAAAATGLRQAAAAAASTSVKPIFSRDLNEAKRRVRELYRAWYREVPNTVHLMQLDITVKQGRDKVREMFMKNAHVTDPRVVDLLVIKGKMELQETIKVWKQRTHVMRFFHETETPRPKDFLSKFYMGHDP

Entity 23 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
分子量 formula_weight	20025.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MPGIVELPTLEELKVEEVKVSSAVLKAAAHHYGAQCDKTNKEFMLCRWEEKDPRRCLKEGKLVNGCALNFFRQIKSHCAEPFTEYWTCLDYSNMQLFRHCRQQQAKFDQCVLDKLGWVRPDLGQLSKVTKVKTDRPLPENPYHSRARPEPNPVIEGDLKPAKHGTRFFFWTV

Entity 24 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
分子量 formula_weight	15130.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MAMVKRFFESYHEVPDGTQCHRKTYITTALGGICGIIGSAYSVSLNPADSTLEAVARVGRYTFTAAAIGAMFGLTTCVSAQVREKPDDPLNYFIGGCAGGLTLGARTHSYGTAAMGCVYMGTAAALFKIGKLEGWELFPTPKV

Entity 25 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
分子量 formula_weight	16881.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MAASKVKQDMPPPGGYGPIDYKRNLPRRGLSGYSMFAVGIGALIFGYWRMMRWNQERRRLLIEDLEARIALMPLFQAEKDRRTLQILRENLEEEAIIMKDVPNWKVGESVFHTTRWVPPLIGEMYGLRTKEEMSNANFGFTWYT

Entity 26 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
分子量 formula_weight	8149.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MWFEILPGLAIMGVCLVIPGVSTAYIHKFTNGGKEKRVARVQYQWYLMERDRRISGVNRYYVSKGLENID

Entity 27 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
分子量 formula_weight	9338.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MAGRISAFLKNAWAKEPVLVVSFSVWGLAIIMPMISPYTKYASMINKATPYNYPVPVRDDGNMPDVPSHPQDPLGPSLDWLKNL

Entity 28 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
分子量 formula_weight	8636.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MAPSVVLRSFSRLLAPARLPSCSSTRSKFYVREPVNAKPNWLAVGLSVGASVFMWIYLIQTHNEDVLEYKRRNGLE

Entity 29 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
分子量 formula_weight	14185.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MMNGRPGHEPLKFLPDEARSLPPPKLNDPRLVYMGLLGYCTGLMDNMLRMRPVMRAGLHRQLLFVTSFVFAGYFYLKRQNYLYAVKDHDMFGYIKLHPEDFPEKEKKTYAEILEPFHPVR

Entity 30 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
分子量 formula_weight	12675.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MPFLDIQKKLGISLDRHFMFLSAEQPYKNAARCHAFEKEWIECAHGIGGTRAKKECKIEFDDFEECLLRYKTMRRMHDIKKQREKLMKEGKYTPPPHHSGREEPRP

Entity 31 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
分子量 formula_weight	6965.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MTLFQLLREHWVHILVPAGFVFGCYLDRKDDEKLTAFRNKSMLFQRELRPNEEVTWK

Entity 32 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
分子量 formula_weight	17463.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

MAARLLSLYGRCLSAAGAMRGLPAARVRWESSRAVIAPSGVEKKRQREPTMQWQEDPEPEDENVYAKNPDFHGYDSDPVVDVWNMRAVFFFGFSIVLVFGTTFVAYVPDYRMQEWARREAERLVKYREVNGLPIMESNYFDPSKIQLPEDD

Entity 33 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
分子量 formula_weight	21742.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MAAMSLLQRASVSALTALSCRRAGPRLGVGSFLTRSFPKTVAPVRHSGDHGKRLFVVKPSLYYDARFLRLMKFYLMLTGIPVIIGITLVNIFIGEAELAEIPEGYIPEHWEYYKHPISRWIARNFYDGPEKNYEKTLAILQIESEKAELRLKEQEVRRLMRARGDGPWYQFPTPEKEFIDHSPKATPDN

Entity 34 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
分子量 formula_weight	15582.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MSGYTPDEKLRLQQLRELRRRWLKDQELSPREPVLPPRRMWPLERFWDNFLRDGAVWKNMVFKAYRSSLFAVSHVLIPMWFVHYYVKYHMATKPYTIVSSKPRIFPGDTILETGEVIPPMRDFPDQHH

Entity 35 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
分子量 formula_weight	11982.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MSALTRLVPFGRVGGRLLRGCRARAAGDSGVRHAGGGVHIQPRYREFPQLTRSQVIQGEFLSSLMWFWILWRFWHDSDAVLGHFSYPDPSQWTDEELGIPPDDED

Entity 36 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
分子量 formula_weight	11714.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

MAAGHGHEHGHEHGHGHGKMELPDYRQWKIEGTPLETVQKKLAARGLRDPWARNEAWRYMGGFAGNITFPSVILKGFKWGFAAFVVALGAEYFLDSQNGDKKHH

Entity 37 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
分子量 formula_weight	21903.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MAAARAAALGVRWLQRTTRGVVPLEARRAFHMTKDMLPGSYPRTPEERAAAAKKYNMRVEDYEPYPDDGMGYGDYPMLPNRSQHERDPWYQWDHSELRMNWGEPIHWDLDMYIRNRVDTSPTPVSWDVMCKHLFGFVAFMVFMFWVGHVFPSYQPVGPKQYPYNNLYLERGGDPTKEPEPVVHYDI

Entity 38 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
分子量 formula_weight	15105.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MSGSKYKPAPLATLPSTLDPAEYDVSPETRRAQVERLSIRARLKREYLLQYNDPKRVSHIEDPALIRWTYARSANIYPNFRPTPKNSLLGAVAGFGPLIFWYYVFKTDRDRKERLIQEGKLDRKFNISY

Entity 39 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
分子量 formula_weight	22020.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	n

MAFCAPPAYLTHQQKVLRLYKRALRHLESWCIHRDKYRYFACLMRARFEEHKNEKDMMRATQLLREAEEEFWQNQHPQPYIFPDSPGGTSFERYECYKVPEWCLDYWHPSEKAMYPDYFSKREQWKKLRMESWDREVKQLQEETSPDGIMTEALPPARREGDLPPLWWHIVTRPRERPT

Entity 40 polymer

描述 description	;NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, METHYLGLYOXAL BIS-(GUANYLHYDRAZONE), NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 ;
分子量 formula_weight	16360.8 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MGAHLTRRYLWDASVEPDPEKIPSFPPDLGFPERKERVMVATQQEMMDAQLTLQQRDYCAHYLIRLLKCKRDSFPNFLACKHEQHDWDYCEHLDYVKRMKEFERERRLLQRKKRRALKEARVAQGQGEGEVGPEVAL

Entity 41 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
分子量 formula_weight	21054.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

MPDSWDKDVYPEPPSRTPAPSPQTSLPNPITYLTKAYDLVVDWPVTLVREFIERQHAKNRTYYYHRQYRRVPDITECKEGDVLCIYEAEMQWRRDFKVDQEIMNIIQERLKACQQREGENYQQNCAKELEQFTKVTKAYQDRYLDLGAYYSARKCLAKQKQRMLEERKAARQEAAA

Entity 42 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
分子量 formula_weight	17154.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	q

MELVEVLKRGVQQVTGHGGLRGLLRVFFRANDIRIGTLVGEDKYGNKYYEDNKQFFGRHRWVIYTTEMNGKNTFWDVDGSMVPPEWHRWLHCMTDDPPTTNPPTARKFIWTNHKFNVSATPEQYVPYSTTRKKIHEWVPPSTPYK

Entity 43 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
分子量 formula_weight	12637.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	r

MASATRVIQKLRNWASGQDLQAKLQLRYQEIAKRTQPPPKLPVGPSHKLSNNYYCTRDGRREVVPPSIIMSSQKALVSGKAAESSAMAATEKKAVTPAPPMKRWELSKDQPYL

Entity 44 polymer

描述 description	NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
分子量 formula_weight	11833.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s

MAVSLLLRGGRIRALKAVLLEARVFPGELVSVVRLSTESEKSAKEKELHPKTQSVLKEPEPTDTTTYKNLQHHDYNTYTFLDLNLDLSKFRLPQPSSGRESPRH

Entity 45 non-polymer

描述 description	DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

Entity 46 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
分子量 formula_weight	790.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 47 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

Entity 48 non-polymer

描述 description	Piericidin A
分子量 formula_weight	415.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 49 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 50 non-polymer

描述 description	FLAVIN MONONUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	456.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 51 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 52 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

Entity 53 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

Entity 54 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 55 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 56 non-polymer

描述 description	NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	745.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 57 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 58 non-polymer

描述 description	;~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate ;
分子量 formula_weight	584.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 59 non-polymer

描述 description	MYRISTIC ACID
分子量 formula_weight	228.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

Entity 60 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	280

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	8oltF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	11540 — NADH-ubiquinone oxidoreductase 51kDa subunit

结构域编号 domain_id	8oltS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

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7. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	2.84 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	41670

fit	/app/data/saxs_computation/ol/8olt/8olt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ol/8olt/8olt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ol/8olt/8olt.dat

Mitochondrial complex I from Mus musculus in the active state bound with piericidin A

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (60)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 polymer

聚合体 Polymer

Entity 33 polymer

聚合体 Polymer

Entity 34 polymer

聚合体 Polymer

Entity 35 polymer

聚合体 Polymer

Entity 36 polymer