|
4BK0
Crystal structure of the KIX domain of human RECQL5 (domain-swapped dimer)
提交 2013-04-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
515–620(106 aa)
片段:KIX DOMAIN, RESIDUES 515-620
链 B
515–620(106 aa)
片段:KIX DOMAIN, RESIDUES 515-620
|
未记录
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.2;0.2 M NACL, 0.1 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE PH 6.2, 50% PEG 200
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.234
|
|
5LB3
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;23% PEG6K, 0.15M lithium chloride, 2.5% ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
|
5LB3
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 E
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;23% PEG6K, 0.15M lithium chloride, 2.5% ethylene glycol
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.234
|
|
5LB5
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form).
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
10–453(444 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
5LB5
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form).
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
10–453(444 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
5LB5
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form).
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
10–453(444 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
5LB5
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with ADP/Mg (tricilinc form).
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
10–453(444 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M tris pH 7.5, 23% PEG3350, 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.282
|
|
5LB8
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
11–526(516 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;17.5% Peg 3350, 0.2M Potassium Thiocyanate, 0.1M Hepes pH 7.0, 10% ethelene glycol
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.322
|
|
5LB8
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
11–526(516 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;17.5% Peg 3350, 0.2M Potassium Thiocyanate, 0.1M Hepes pH 7.0, 10% ethelene glycol
|
分辨率 3.40 Å
R-free 0.322
|
|
5LBA
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
6SV 1-cyclohexyl-3-[[(2~{R})-oxolan-2-yl]methyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.303
|
|
5LBA
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.303
|
|
5LBA
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
11–453(443 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.303
|
|
5LBA
Crystal structure of human RECQL5 helicase in complex with DSPL fragment(1-cyclohexyl-3-(oxolan-2-ylmethyl)urea, SGC - Diamond XChem I04-1 fragment screening.
提交 2016-06-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
11–453(443 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M tris pH 9.0 -- 29% PEG3350 -- 0.1M sodium chloride
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.303
|
|
7ZML
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;293 K;0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.261
|
|
7ZML
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;293 K;0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.261
|
|
7ZML
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;293 K;0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.261
|
|
7ZML
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G1-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.9;293 K;0.1M bis-tris pH 5.9 -- 0.1M lithium sulfate -- 30% PEG3350
|
分辨率 2.79 Å
R-free 0.261
|
|
7ZMM
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
7ZMM
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
7ZMM
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
7ZMM
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2-001
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
7ZMN
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-048
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;2M ammonium sulfate -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å
R-free 0.275
|
|
7ZMN
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-048
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;2M ammonium sulfate -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å
R-free 0.275
|
|
7ZMO
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-052
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1M ammonium sulfate -- 0.5% PEG8000 -- 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 3.75 Å
R-free 0.306
|
|
7ZMO
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-052
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1M ammonium sulfate -- 0.5% PEG8000 -- 0.1M HEPES pH 7.0
|
分辨率 3.75 Å
R-free 0.306
|
|
7ZMP
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-055
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;2.4M sodium malonate
|
分辨率 3.63 Å
R-free 0.359
|
|
7ZMP
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G3-055
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;2.4M sodium malonate
|
分辨率 3.63 Å
R-free 0.359
|
|
7ZMQ
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M tris pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.258
|
|
7ZMQ
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M tris pH 8.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.258
|
|
7ZMR
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-011
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.292
|
|
7ZMR
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G2*-011
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M lithium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.292
|
|
7ZMS
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G4-043
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
12–453(442 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M sodium chloride -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.276
|
|
7ZMT
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M sodium formate -- 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.291
|
|
7ZMT
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2M sodium formate -- 20% PEG3350
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.291
|
|
7ZMV
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.275
|
|
7ZMV
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.275
|
|
7ZMV
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.275
|
|
7ZMV
Crystal structure of human RECQL5 helicase APO form in complex with engineered nanobody (Gluebody) G5-006
提交 2022-04-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
11–453(443 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.2M ammonium sulfate -- 25% PEG3350 -- 0.1M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.275
|
|
8QQ2
RNAPII elongation complex bound to RECQ5
提交 2023-10-03
|
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 R
1–650(650 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
8QW9
RNAPII elongation complex bound to RECQ5_R502E
提交 2023-10-19
|
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 R
1–650(650 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 7
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
8RL5
DNA helicase RECQL5 in complex with homo Di-Gluebody G5-006
提交 2024-01-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
12–453(442 aa)
链 B
12–453(442 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.79 Å
|
|
8RL6
DNA helicase RECQL5 in complex with homo Di-Gluebody G5-006 - RECQL5 local refinement
提交 2024-01-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
12–453(442 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å
|
|
8RL9
RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody
提交 2024-01-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
12–453(442 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å
|
|
8RLA
RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - RECQL5 local refinement
提交 2024-01-02
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
12–453(442 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å
|
|
9EI1
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide
提交 2024-11-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 U
1–991(991 aa)
|
突变:D157A
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9EI2
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to an apo RECQL5 helicase (RECQL5 IRI Module focused-classified)
提交 2024-11-25
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 U
1–991(991 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9EI3
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP
提交 2024-11-25
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 U
1–991(991 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å
|
|
9EI4
Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP
提交 2024-11-25
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:hexadecameric
|
链 U
1–991(991 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9HVO
Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex
提交 2024-12-31
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 13
PDB 声明:16-meric
|
链 O
1–991(991 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9HVQ
Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex
提交 2024-12-31
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 21
PDB 声明:24-meric
|
链 O
1–991(991 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 8
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å
|
|
9HWG
Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex
提交 2025-01-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:21-meric
|
链 O
1–991(991 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 10
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|