SAXSdb — 8r3x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 241–596	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	LLGL scribble cell polarity complex component 2 × 1 （Q6P1M3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 241–596	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	LLGL scribble cell polarity complex component 2 × 1 （Q6P1M3）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R3X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1VD2 Solution Structure of the PB1 domain of PKCiota 提交 2004-03-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride；压力 ambient NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM PKCiota PB1 U-15N, U-13C; 50mM phosphate buffer; 150mM sodium chloride; 5mM ditiothreitol; 0.05%(w/v) sodium azide; 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
1WMH Crystal structure of a PB1 domain complex of Protein kinase c iota and Par6 alpha 提交 2004-07-09	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–99（84 aa）片段：PB1 domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；sodium formate, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.224
1ZRZ Crystal Structure of the Catalytic Domain of Atypical Protein Kinase C-iota 提交 2005-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 224–587（364 aa）片段：catalytic domain, residues 224-587	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BI1 3-{1-[3-(DIMETHYLAMINO)PROPYL]-1H-INDOL-3-YL}-4-(1H-INDOL-3-YL)-1H-PYRROLE-2,5-DIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 400, sodium acetate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.333
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8W Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；PEG3350, ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.301
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3A8X Crystal Structure of PKCiota kinase domain 提交 2009-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588 链 B 249–588（340 aa）片段：UNP residues 249-588	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；HEPES, ammonium sulfate, PEG400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.271
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
3ZH8 A novel small molecule aPKC inhibitor 提交 2012-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 248–596（349 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 248-596	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	IOD IODIDE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 C58 (2S)-3-phenyl-N~1~-[2-(pyridin-4-yl)-5,6,7,8-tetrahydro[1]benzothieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]propane-1,2-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.2M AMMONIUM IODIDE AND 20%(W/V) PEG3350.	分辨率 2.74 Å R-free 0.257
5LI1 Structure of a Par3-inhibitory peptide bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）片段：UNP residues 246-589	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 K POTASSIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 2.00 Å R-free 0.217
5LI9 Structure of a nucleotide-bound form of PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 FMT FORMIC ACID × 7 IMD IMIDAZOLE × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；25% Morpheus precipitant mix 4, 10% Morpheus Carboxylic acids, Morpheus Buffer system 1	分辨率 1.79 Å R-free 0.231
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
5LIH Structure of a peptide-substrate bound to PKCiota core kinase domain 提交 2016-07-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 248–596（349 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 SCN THIOCYANATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；32% Peg 2000 MME, 0.08 M KSCN	分辨率 3.25 Å R-free 0.284
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
6ILZ Crystal structure of PKCiota in complex with inhibitor 提交 2018-10-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 249–588（340 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	AFU 2-amino-5-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]-N-(pyridin-4-yl)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5, 28 % w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000	分辨率 3.26 Å R-free 0.348
8R3Y Cryo EM structure of a stable LGL/aPKC Iota/Par-6 complex 提交 2023-11-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 248–585（338 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；4 ul of aPKCiota-Par6-Llgl1 complex at a concentration of 0.4 mg/ml was applied to R1.2/1.3 Quantifoil 300 mesh copper grids which had been glow-discharged for 45 s at 45 mA . Grids were blotted for 2.5 s at 100% humidity using an FEI Vitrobot MK IV.	分辨率 3.68 Å
9EJK Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6b complex in nucleotide-free form. Head sub-complex region subtracted 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9EJL Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in nucleotide-free form. Conformation with visible head sub-complex. 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9EJM Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in its ADP-bound form 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–596（596 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å

共 14 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KPCI_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–356； UniProt 241–596 作者链 B； PDB构建体 1–356； UniProt 241–596

LLGL scribble cell polarity complex component 2

物种未注明

UniProt Q6P1M3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 641–660	未记录	Protein kinase C iota type × 1 （P41743）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 641–660	未记录	Protein kinase C iota type × 1 （P41743）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；Morpheus Condition: 25% (v/v) MPD, 25% (v/v) PEG 1000, 25% (v/v) PEG 3350, 0.3 M NaNO3, 0.3 M Na2HPO4, 0.3 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES/imidazole pH 6.5	分辨率 2.59 Å R-free 0.269

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R3X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3WP0 Crystal structure of Dlg GK in complex with a phosphor-Lgl2 peptide 提交 2014-01-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 640–654（15 aa）片段：UNP residues 640-654	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.2M lithium chloride, 20% PEG3350, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.04 Å R-free 0.202
3WP1 Phosphorylation-dependent interaction between tumor suppressors Dlg and Lgl 提交 2014-01-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 646–657（12 aa）片段：UNP residues 646-657	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å R-free 0.268
6N8P Crystal structure of the human cell polarity protein Lethal Giant Larvae 2 (Lgl2). Unphosphorylated, crystal form 1. 提交 2018-11-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295.15 K；19.8 % PEG 3350, 0.29 M Na2SO4, 0.1 M bis-tris propane pH 7.5, 3% methanol	分辨率 3.19 Å R-free 0.250
6N8Q Crystal structure of the human cell polarity protein Lethal Giant Larvae 2 (Lgl2). Unphosphorylated, crystal form 2. 提交 2018-11-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295.15 K；18-21 % PEG 2000 MME, 80-100 mM SPG pH 6.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.226
6N8R Crystal structure of the human cell polarity protein Lethal Giant Larvae 2 (Lgl2). aPKC phosphorylated, crystal form 2. 提交 2018-11-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295.15 K；25% PEG 1500, 100 mM SPG pH 8.0	分辨率 1.91 Å R-free 0.219
6N8S Crystal structure of the human cell polarity protein Lethal Giant Larvae 2 (Lgl2). aPKC phosphorylated, crystal form 3. 提交 2018-11-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295.15 K；1.4 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1.07% 1,6-hexanediol	分辨率 3.90 Å R-free 0.298
6N8S Crystal structure of the human cell polarity protein Lethal Giant Larvae 2 (Lgl2). aPKC phosphorylated, crystal form 3. 提交 2018-11-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 13–978（966 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295.15 K；1.4 M ammonium sulfate, 100 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 1.07% 1,6-hexanediol	分辨率 3.90 Å R-free 0.298
9EJK Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6b complex in nucleotide-free form. Head sub-complex region subtracted 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9EJL Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in nucleotide-free form. Conformation with visible head sub-complex. 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9EJM Lgl2 bound to the aPKCiota-Par6B complex in its ADP-bound form 提交 2024-11-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 13–978（966 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å

共 9 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	L2GL2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–20； UniProt 641–660 作者链 D； PDB构建体 1–20； UniProt 641–660

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8r3x
沉积日期 deposition_date	2023-11-10
结构标题 title	Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide
关键词 keywords	Kinase, Polarity, Kinase substrate complex., CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.02 Å
零角强度 I(0) i0	106057000.00
分子量 molecular_weight	81039.0 kDa
排除体积 excluded_volume	101230 Å³
包络体积 envelope_volume	130050 Å³
水化壳体积 shell_volume	36095 Å³
包络直径 envelope_diameter	99.4 Å
壳层 Rg shell_rg	37.20 Å
包络 Rg envelope_rg	29.79 Å
形状 Rg shape_rg	30.01 Å
总 Rg total_rg	30.69 Å
总原子数 total_atoms	5710
残基数 n_residues	696
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	97.9 Å
Rg (实空间) rg_real	30.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.79 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0610e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6280e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.79 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	106100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9018
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.281
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.600
角度范围 angular_range	— – 0.2550 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	35080000.0000
实空间数据点数 n_real_points	52
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.958

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein kinase C iota type
分子量 formula_weight	40981.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5721

ESGKASSSLGLQDFDLLRVIGRGSYAKVLLVRLKKTDRIYAMKVVKKELVNDDEDIDWVQTEKHVFEQASNHPFLVGLHSCFQTESRLFFVIEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYSAEISLALNYLHERGIIYRDLKLDNVLLDSEGHIKLTDYGMCKEGLRPGDTTSTFCGTPNYIAPEILRGEDYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRSPFDIVGSSDNPDQNTEDYLFQVILEKQIRIPRSLSVKAASVLKSFLNKDPKERLGCHPQTGFADIQGHPFFRNVDWDMMEQKQVVPPFKPNISGEFGLDNFDSQFTNEPVQLTPDDDDIVRKIDQSEFEGFEYINPLLMSAEECV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	LLGL scribble cell polarity complex component 2
分子量 formula_weight	2488.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

SRVKSLKKSLRQSFRRMRKS

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	78.418 Å
晶胞边长 b length_b	86.324 Å
晶胞边长 c length_c	114.803 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	2.591 Å
最低分辨率 resolution_low	68.995 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2319
R_free r_free	0.2692

fit	/app/data/saxs_computation/r3/8r3x/8r3x.fit
pddf	/app/data/pr_computation/r3/8r3x/8r3x.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/r3/8r3x/8r3x.dat

Crystal structure of aPKC Iota kinase domain with LLGL2 peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein kinase C iota type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

LLGL scribble cell polarity complex component 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)