SAXSdb — 8r7p

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gap junction delta-2 protein

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–321 链 B； UniProt 1–321 链 C； UniProt 1–321 链 D； UniProt 1–321 链 E； UniProt 1–321 链 F； UniProt 1–321 链 G； UniProt 1–321 链 H； UniProt 1–321 链 I； UniProt 1–321 链 J； UniProt 1–321 链 K； UniProt 1–321 链 L； UniProt 1–321	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.53 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8R7P	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2N6A NMR structure of a human calmodulin/connexin-36 peptide hybrid 提交 2015-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 276–292（17 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25；压力 ambient NMR样品组成 2.0 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein, 0.0005 w/v sodium azide, 25 mM sodium chloride, 5 mM Tris, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
7XKI Human Cx36/GJD2 (N-terminal deletion BRIL-fused mutant) gap junction channel in soybean lipids (D6 symmetry) 提交 2022-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）链 G 1–108（108 aa）链 G 188–321（134 aa）链 H 1–108（108 aa）链 H 188–321（134 aa）链 I 1–108（108 aa）链 I 188–321（134 aa）链 J 1–108（108 aa）链 J 188–321（134 aa）链 K 1–108（108 aa）链 K 188–321（134 aa）链 L 1–108（108 aa）链 L 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 48	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7XKK Human Cx36/GJD2 gap junction channel in detergents 提交 2022-04-19	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7XKT Human Cx36/GJD2 (BRIL-fused mutant) gap junction channel in detergents at 2.2 Angstroms resolution 提交 2022-04-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）链 G 1–108（108 aa）链 G 188–321（134 aa）链 H 1–108（108 aa）链 H 188–321（134 aa）链 I 1–108（108 aa）链 I 188–321（134 aa）链 J 1–108（108 aa）链 J 188–321（134 aa）链 K 1–108（108 aa）链 K 188–321（134 aa）链 L 1–108（108 aa）链 L 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 72 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 24 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.20 Å
7XL8 Human Cx36/GJD2 (N-terminal deletion mutant) gap junction channel in soybean lipids (D6 symmetry) 提交 2022-04-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 9–321（313 aa）链 B 9–321（313 aa）链 C 9–321（313 aa）链 D 9–321（313 aa）链 E 9–321（313 aa）链 F 9–321（313 aa）链 G 9–321（313 aa）链 H 9–321（313 aa）链 I 9–321（313 aa）链 J 9–321（313 aa）链 K 9–321（313 aa）链 L 9–321（313 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 84	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7XNH Human Cx36/GJD2 gap junction channel with pore-lining N-terminal helices in soybean lipids 提交 2022-04-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 132	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7XNV Structurally hetero-junctional human Cx36/GJD2 gap junction channel in soybean lipids (C6 symmetry) 提交 2022-04-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 114	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8HKP Structurally hetero-junctional human Cx36/GJD2 gap junction channel in detergents (C6 symmetry) 提交 2022-11-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8IYG Human neuronal gap junction channel connexin 36 提交 2023-04-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 48 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 84	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4	分辨率 2.69 Å
8QOJ human connexin-36 gap junction channel in complex with mefloquine 提交 2023-09-29	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	YMZ (11R,12S)- Mefloquine × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.13 Å
8R7Q human connexin-36 gap junction channel in complex with quinine 提交 2023-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	QI9 Quinine × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
8R7R human connexin36 gap junction channel in complex with quinidine 提交 2023-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	QDN Quinidine × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
8XGD Human Cx36/GJD2 gap junction channel with pore-lining N-terminal helices in porcine brain lipids. 提交 2023-12-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 60 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8XGE Human Cx36/GJD2 gap junction channel in porcine brain lipids. 提交 2023-12-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 48	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.89 Å
8XGF Human Cx36/GJD2 gap junction channel in complex with arachidonic acid. 提交 2023-12-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 84 ACD ARACHIDONIC ACID × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8XGG Human Cx36/GJD2 gap junction channel in complex with 1-hexanol. 提交 2023-12-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 60 HE2 HEXAN-1-OL × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8XGJ Human Cx36/GJD2 gap junction channel in complex with mefloquine. 提交 2023-12-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	YMZ (11R,12S)- Mefloquine × 12 MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 84	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8XH8 Human Cx36/GJD2 (Ala14-deleted mutant) gap junction channel in porcine brain lipids 提交 2023-12-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 72	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8XH9 Human Cx36/GJD2 (Ala14 deletion mutant) gap junction channel prepared with mefloquine, showing no bound mefloquine 提交 2023-12-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–321（321 aa）链 B 1–321（321 aa）链 C 1–321（321 aa）链 D 1–321（321 aa）链 E 1–321（321 aa）链 F 1–321（321 aa）链 G 1–321（321 aa）链 H 1–321（321 aa）链 I 1–321（321 aa）链 J 1–321（321 aa）链 K 1–321（321 aa）链 L 1–321（321 aa）	未记录	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 60	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9IP5 Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in brain polar lipid nanodiscs, treated with a 14-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	C14 TETRADECANE × 18	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.52 Å
9IPM Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 20-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 12 C14 TETRADECANE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9IPN Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 10-fold molar excess of carbenoxolone and incubated shortly 提交 2024-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 6 C14 TETRADECANE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.46 Å
9IPO Hemichannel sub-structure of Cx36/GJD2 gap junction intercellular channel (FN conformation) in soybean polar lipid nanodiscs, treated with a 10-fold molar excess of carbenoxolone 提交 2024-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–108（108 aa）链 A 188–321（134 aa）链 B 1–108（108 aa）链 B 188–321（134 aa）链 C 1–108（108 aa）链 C 188–321（134 aa）链 D 1–108（108 aa）链 D 188–321（134 aa）链 E 1–108（108 aa）链 E 188–321（134 aa）链 F 1–108（108 aa）链 F 188–321（134 aa）	突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L 突变：M29W,H124I,R128L	MC3 1,2-DIMYRISTOYL-RAC-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 12 C14 TETRADECANE × 18	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES(pH 7.5), 150mM KCl, 2mM beta-mercaptoethanol cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.41 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CXD2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 B； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 C； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 D； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 E； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 F； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 G； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 H； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 I； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 J； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 K； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321 作者链 L； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8r7p
沉积日期 deposition_date	2023-11-27
结构标题 title	human connexin-36 gap junction channel
关键词 keywords	MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	45.65 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.68 Å
零角强度 I(0) i0	700007000.00
分子量 molecular_weight	237880.0 kDa
排除体积 excluded_volume	305180 Å³
包络体积 envelope_volume	415680 Å³
水化壳体积 shell_volume	74735 Å³
包络直径 envelope_diameter	152.3 Å
壳层 Rg shell_rg	49.40 Å
包络 Rg envelope_rg	47.52 Å
形状 Rg shape_rg	46.69 Å
总 Rg total_rg	46.79 Å
总原子数 total_atoms	33636
残基数 n_residues	2076
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	143.8 Å
Rg (实空间) rg_real	45.85 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.29 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.0000e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2860e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	45.65 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	699800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8154
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	49.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.505
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.245
角度范围 angular_range	— – 0.1750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	78910000.0000
实空间数据点数 n_real_points	36
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.836; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.089

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.53 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	99341

描述 description	Gap junction delta-2 protein
分子量 formula_weight	37078.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K
原子数 atom_count	33726

human connexin-36 gap junction channel

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gap junction delta-2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	90

fit	/app/data/saxs_computation/r7/8r7p/8r7p.fit
pddf	/app/data/pr_computation/r7/8r7p/8r7p.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/r7/8r7p/8r7p.dat