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8rzb

IL-1beta in complex with covalent DEL hit

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin-1 beta

Homo sapiens

UniProt P01584

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;8-[4-methyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-2-[[(7S)-7-(2-morpholin-4-ylethylcarbamoyl)-4-(phenylsulfonyl)-1,4-diazepan-1-yl]carbonyl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;8-[4-methyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-2-[[(7S)-7-(2-morpholin-4-ylethylcarbamoyl)-4-(phenylsulfonyl)-1,4-diazepan-1-yl]carbonyl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;8-[4-methyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-2-[[(7S)-7-(2-morpholin-4-ylethylcarbamoyl)-4-(phenylsulfonyl)-1,4-diazepan-1-yl]carbonyl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;8-[4-methyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-2-[[(7S)-7-(2-morpholin-4-ylethylcarbamoyl)-4-(phenylsulfonyl)-1,4-diazepan-1-yl]carbonyl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carboxylic acid ; × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1hib 1i1b 1iob 1l2h 1s0l 1t4q 1too 1tp0 1twe 1twm 21bi 2i1b

共 54 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1itb 2kh2 3o4o 4dep 4dep 4g6j 4g6m 5bvp 7chy 7chz 7z4t 8ryk

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IL1B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–153； UniProt 117–269 作者链 B； PDB构建体 1–153； UniProt 117–269 作者链 C； PDB构建体 1–153； UniProt 117–269 作者链 D； PDB构建体 1–153； UniProt 117–269

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8rzb
沉积日期 deposition_date2024-02-12
结构标题 titleIL-1beta in complex with covalent DEL hit
关键词 keywordsDNA-encoded library, CYTOKINE; CYTOKINE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8rzb__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8rzb__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8rzb__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）16.41 Å
Rg（电子密度）14.88 Å
总 Rg16.15 Å
原子数1246
残基数149
排除体积22281 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8rzb__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 8rzb__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 8rzb__assembly_3__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 8rzb__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (2)