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8sig

Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-288

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone-arginine methyltransferase CARM1

Homo sapiens

UniProt Q86X55

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 140–480 片段：methyltransferase domain GWU 5'-{(3-aminopropyl)[2-(benzylcarbamamido)ethyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400 分辨率 1.78 Å R-free 0.199

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8SIG Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2Y1W CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 B 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 C 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 D 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SFG SINEFUNGIN × 4 849 2-{4-[3-FLUORO-2-(2-METHOXYPHENYL)-1H-INDOL-5-YL] PIPERIDIN-1-YL}-N-METHYLETHANAMINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE.
分辨率 2.10 Å R-free 0.244
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 D 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
2Y1X CRYSTAL STRUCTURE OF COACTIVATOR ASSOCIATED ARGININE METHYLTRANSFERASE 1 (CARM1) IN COMPLEX WITH SINEFUNGIN AND INDOLE INHIBITOR 提交 2010-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
链 C 135–482（348 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 135-482
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 845 N-(3-{5-[5-(1H-INDOL-4-YL)-1,3,4-OXADIAZOL-2-YL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-1H-PYRAZOL-1-YL}BENZYL)-L-ALANINAMIDE × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 2000K, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 0.2 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE DIHYDRATE
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 B 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 25 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
4IKP Crystal structure of coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with methylenesinefungin 提交 2012-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 D 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 4IK (2S,5S)-2,6-diamino-5-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl}hexanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Di-AMMONIUM TARTRATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
突变：aa 134-479 突变：aa 134-479 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
突变：aa 134-479 突变：aa 134-479 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX1 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.93 Å R-free 0.238
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DX8 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R455) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.94 Å R-free 0.246
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXA Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated PABP1 peptide (R460) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.244
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
5DXJ Crystal structure of CARM1 and sinefungin 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.231
5U4X Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064 提交 2016-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 B 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5
分辨率 1.88 Å R-free 0.215
5U4X Coactivator-associated arginine methyltransferase 1 with TP-064 提交 2016-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
链 D 140–480（341 aa） 片段：UNP residues 140-480
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 7VM N-methyl-N-[(2-{1-[2-(methylamino)ethyl]piperidin-4-yl}pyridin-4-yl)methyl]-3-phenoxybenzamide × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M AmSO4, 0.1 M Tris pH8.5
分辨率 1.88 Å R-free 0.215
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARJ Crystal structure of CARM1 with EPZ022302 and SAH 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW4 methyl 2-[2-{2-chloro-5-[(2R)-2-hydroxy-3-(methylamino)propoxy]phenyl}-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methylpyrimidin-4-yl]-2,7-diazaspiro[3.5]nonane-7-carboxylate × 2 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.212
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 B 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6ARV Crystal structure of CARM1 with Compound 2 and SAH 提交 2017-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
链 D 134–479（346 aa） 片段：Catalytic domain (UNP residues 134-479)
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 BW7 (2R)-1-amino-3-{3-[4-(morpholin-4-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridin-6-yl]phenoxy}propan-2-ol × 2 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.232
6D2L Crystal structure of human CARM1 with (S)-SKI-72 提交 2018-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
链 C 146–489（344 aa）
链 D 146–489（344 aa）
链 E 146–489（344 aa）
链 F 146–489（344 aa）
未记录 FTG (2S,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]hexanamide × 6 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.236
6DVR Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 2 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 1.54 Å R-free 0.215
6DVR Crystal structure of human CARM1 with (R)-SKI-72 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 HDG (2R,5S)-2-amino-6-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-5-[(benzylamino)methyl]-N-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]hexanamide (non-preferred name) × 8 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4SO4, 0.1 M HEPES pH7.5
分辨率 1.54 Å R-free 0.215
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 145–477（333 aa）
未记录 XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 145–477（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6IZQ PRMT4 bound with a bicyclic compound 提交 2018-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 145–477（333 aa）
链 B 145–477（333 aa）
链 C 145–477（333 aa）
链 D 145–477（333 aa）
未记录 XJ2 (2R)-1-(methylamino)-3-(1,3,4,5-tetrahydro-2-benzazepin-2-yl)propan-2-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S70 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM251 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYB 1-[5-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]pentyl]guanidine × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 24 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.211
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S71 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor WH5C 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYE (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(5-carbamimidamidopentyl)amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium acetate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.06 Å R-free 0.210
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S74 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM305 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY8 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyrimidin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.216
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
突变：N265Y 突变：N265Y KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S77 Crystal structure of CARM1 N265Y mutant in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
突变：N265Y 突变：N265Y KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 26 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S79 Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA183 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KXW (2~{S})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]-2-azanyl-butanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7A Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor AA175 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY5 (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[3-azanylpropyl-[3-(pyridin-2-ylamino)propyl]amino]methyl]oxolane-3,4-diol × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.2 M sodium formate, 20 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.86 Å R-free 0.220
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7B Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM249 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KYH 1-[4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]butyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M potassium phosphate, 22 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.66 Å R-free 0.227
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 135–479（345 aa）
链 C 135–479（345 aa）
未记录 KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
6S7C Crystal structure of CARM1 in complex with inhibitor UM079 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 135–479（345 aa）
链 D 135–479（345 aa）
未记录 KY2 1-[3-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl-(3-azanylpropyl)amino]propyl]guanidine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-tris propane, 0.02 M sodium phosphate, 21 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAI CARM1 bound with compound 9 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 142–477（336 aa）
未记录 XJ3 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-(oxan-4-ylamino)pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7FAJ CARM1 bound with compound 43 提交 2021-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 142–477（336 aa）
未记录 XJ4 N'-[[3-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-methyl-6-phenylazanyl-pyrimidin-2-yl]phenyl]methyl]-N-methyl-ethane-1,2-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；22-27% PEG 3350, 0.15M sodium malate, pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.240
7U9I Co-crystal structure of human CARM1 in complex with MT556 inhibitor 提交 2022-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 146–489（344 aa）
链 B 146–489（344 aa）
未记录 44T 7-[5-S-(4-{[(4-ethylpyridin-3-yl)methyl]amino}butyl)-5-thio-beta-D-ribofuranosyl]-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2M di-Sodium Tartrate
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
8G2H Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1113 提交 2023-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 YVU 5'-S-[2-(benzylcarbamamido)ethyl]-5'-thioadenosine × 2 GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Calcium chloride dihydrate, 0.05 M HEPES sodium pH 7.5, 28% v/v Polyethylene glycol 400, 0.002 M Spermine
分辨率 1.49 Å R-free 0.177
8G2I Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1290 提交 2023-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 I0B 5'-([2-(benzylcarbamamido)ethyl]{3-[N'-(3-bromophenyl)carbamimidamido]propyl}amino)-5'-deoxyadenosine × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1 M BICINE pH 9.0, 2.0 M Magnesium chloride hexahydrate
分辨率 2.17 Å R-free 0.225
8SIH Crystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-289 提交 2023-04-16 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 140–480（341 aa） 片段：methyltransferase domain
未记录 I1K 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl][3-(N'-cyclopentylcarbamimidamido)propyl]amino}-5'-deoxyadenosine × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；3.5 M Ammonium chloride, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.246
8UQH X-ray crystal structure of PRMT4 bound to compound YD-1130 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 139–479（341 aa）
链 B 139–479（341 aa）
链 C 139–479（341 aa）
链 D 139–479（341 aa）
未记录 X9L 5'-S-(2-{[(3-bromophenyl)methyl]amino}ethyl)-5'-thioadenosine × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；7.5% (w/v) PEG 20,000, 0.1M Tris, 0.08M sodium formate, pH 7.5
分辨率 1.87 Å R-free 0.253
9O37 The structure of PRMT4 in complex with YD1305 提交 2025-04-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 145–477（333 aa） 片段：UNP Residues 145-477
未记录 A1B7X 5'-{[2-(benzylcarbamamido)ethyl](3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)amino}-5'-deoxyadenosine × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M calcium acetate hydrate, 0.1M HEPES: NaOH, pH 7.5, 10% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.11 Å R-free 0.233
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269
9O6H The Structure of PRMT4 in complex with SGC8172 提交 2025-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 146–476（331 aa）
未记录 A1B9W 5'-S-(3-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}propyl)-5'-thioadenosine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium tartrate dibasic, 20% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.97 Å R-free 0.269

共 32 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CARM1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 19–359； UniProt 140–480

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8sig
沉积日期 deposition_date2023-04-16
最后修订 last_revision2024-04-24
结构标题 titleCrystal Structure of PRMT4 with Compound YD1-288
关键词 keywords;PRMT4, YD1-288, TRANSFERASE, Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Structural Genomics Consortium, SGC, TRANSFERASE-INHIBITOR complex ;; TRANSFERASE/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (0)