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8t9l

Pom34-Pom152 membrane attachment site yeast NPC

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 130.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8t9l

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8t9l
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8t9l
沉积日期 deposition_date2023-06-24
最后修订 last_revision2023-10-11
结构标题 titlePom34-Pom152 membrane attachment site yeast NPC
关键词 keywordsnuclear pore complex, nucleocytoplasmic transport, nucleoporin, membrane protein, translocase, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.60 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron42.00 Å
零角强度 I(0) i034163600.00
分子量 molecular_weight52407.0 kDa
排除体积 excluded_volume68691 ų
包络体积 envelope_volume157510 ų
水化壳体积 shell_volume34889 ų
包络直径 envelope_diameter140.7 Å
壳层 Rg shell_rg42.36 Å
包络 Rg envelope_rg39.64 Å
形状 Rg shape_rg42.02 Å
总 Rg total_rg41.97 Å
总原子数 total_atoms3718
残基数 n_residues436
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax130.2 Å
Rg (实空间) rg_real41.77 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real3.4160e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.2070e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.60 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal34160000.0000
解质量估计 total_estimate0.7858
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary48.0 Å
偏度 Skewness skewness0.491
峰度 Kurtosis kurtosis-0.052
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha9850000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.739; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (2)

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7. 引用文献 (1)

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8. 文件与曲线 (10)