8tut

Merkel Cell Polyomavirus LTA NLSct bound to importin alpha 2

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 97.2 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Importin subunit alpha-1

Mus musculus

UniProt P52293

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 70–529 未记录 PRO-PRO-LYS-PRO-LYS-LYS-ASN-ARG-GLU × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.70 M sodium citrate, 0.10 M HEPES pH 7.0, 0.01 M DTT 分辨率 2.55 Å R-free 0.225

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 150 个其他 PDB 条目、151 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IMA1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 51–510; UniProt 70–529

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8tut

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8tut
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8tut
沉积日期 deposition_date2023-08-17
结构标题 titleMerkel Cell Polyomavirus LTA NLSct bound to importin alpha 2
关键词 keywordsimportin, karyopherin, nuclear, nls, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.36
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.11
零角强度 I(0) i033819900.00
分子量 molecular_weight46892.0 kDa
排除体积 excluded_volume59397 ų
包络体积 envelope_volume71524 ų
水化壳体积 shell_volume22887 ų
包络直径 envelope_diameter100.9
壳层 Rg shell_rg33.00
包络 Rg envelope_rg28.16
形状 Rg shape_rg28.11
总 Rg total_rg28.60
总原子数 total_atoms6687
残基数 n_residues434
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax97.2
Rg (实空间) rg_real28.73
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.86
I(0) (实空间) i0_real3.3820e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5020e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.62
I(0) (倒空间) i0_reciprocal33820000.0000
解质量估计 total_estimate0.6262
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.6
偏度 Skewness skewness0.524
峰度 Kurtosis kurtosis-0.438
角度范围 angular_range— – 0.2800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha12470000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.684; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 0.532; Smooth: 0.826

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)