SAXSdb — 8tux

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maturation protein A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 180 RNA 1	;3'end of PP7 genomic RNA ; × 1 Capsid protein × 178 （P03630）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MATA_BPPP7
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–448； UniProt 2–449 作者链 m； PDB构建体 1–448； UniProt 2–449

Capsid protein

物种未注明

UniProt P03630

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 180 RNA 1	;3'end of PP7 genomic RNA ; × 1 Maturation protein A × 2 （Q38061）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAPSD_BPPP7
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 01； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 02； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 11； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 12； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 21； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 22； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2A； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2B； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2C； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2D； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2E； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2F； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2G； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2H； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2I； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2J； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2K； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2L； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2M； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2N； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2O； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2P； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2Q； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2R； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2S； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2T； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2U； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2V； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2W； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2X； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2Y； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2Z； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2a； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2b； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2c； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2d； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2e； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2f； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2g； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2h； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2i； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2j； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2k； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2l； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2m； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2n； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2o； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2p； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2q； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2r； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2s； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2t； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2u； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2v； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2w； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2x； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2y； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 2z； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 31； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 32； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 41； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 42； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 51； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 52； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 61； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 62； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 71； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 72； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 82； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 92； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 A1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 A2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 B1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 B2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 C1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 C2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 D1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 D2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 E1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 E2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 F1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 F2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 G1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 G2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 H1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 H2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 I1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 I2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 J1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 J2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 K1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 K2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 L1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 L2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 M1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 M2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 N1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 N2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 O1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 O2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 P1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 P2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Q1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Q2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 R1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 R2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 S1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 S2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 T1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 T2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 U1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 U2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 V1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 V2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 W1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 W2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 X1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 X2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Y1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Y2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Z1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Z2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 a1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 a2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 aa； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ab； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ac； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ad； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 b1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 b2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 c1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 c2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 d1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 d2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 e1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 e2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 f1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 f2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 g1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 g2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 h1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 h2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 i1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 i2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 j1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 j2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 k1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 k2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 l1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 l2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 m1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 m2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 n1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 n2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 o1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 o2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 p1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 p2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 q1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 q2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 r1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 r2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 s1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 s2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 t1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 t2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 u1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 u2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 v1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 v2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 w1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 w2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 x1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 x2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 y1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 y2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 z1； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 z2； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8tux
沉积日期 deposition_date	2023-08-17
结构标题 title	Capsid of mature PP7 virion with 3'end region of PP7 genomic RNA
关键词 keywords	Maturation protein, PP7, pepevirus, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8tux__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8tux__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8tux__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	131.70 Å
总 Rg	131.80 Å
原子数	188513
残基数	23597
排除体积	3235200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8tux__assembly_1__model_1`	181-meric （181）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;3'end of PP7 genomic RNA ;
分子量 formula_weight	30456.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R
原子数 atom_count	188513

GGGGCGAAAUGGCCUAGACCAUGCCCCUUGGCAAACCCAUUCGACCGGGUUUGGGUCUUCUGACCUCGUAGUCCGCGCUCAGCGGACUUCGACCA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Maturation protein A
分子量 formula_weight	50763.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,M

LEEHYYSRKTCGSGGGLSVQRTGYPQTDPPVFKAVNSFERAPLIVGDHVHSLPYWSRKITLECTPYPFTLRWEGGVHKDGIPDKVPHPSCDPGSELVSYTHSREVDCERFIGPVPSSFTDPKVTSAQWKFLEDMADMKALADLNKSLVNLPMLYKERRETLKMVGNRLGGLVRVAHAAQDRDLKRYFKARRKDRRKVAEEVANGHLELIFGWLPLIGELEGAIEYAELPDLDFIRCHGLHTLVLQSTPWDNSVDVRSYPNWERAAGTRITGSVRTRGVVESRASVRTALRFNLETSLAGDARRLGFEPISTTYDMIPLSFVVGWFSNFDKYVRTLAPLIGVTFETGSQNRRTTCELVGCTRFYPRTVSPPSGWFARWKDFPDGSLSEVSGLRRTDIRSVLSTLPDPDVRFHADVGLFEISAGISLLAQRYLKPLQRLLKRKSFFYGRT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Capsid protein
分子量 formula_weight	13906.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	178

聚合物 Polymer

聚合物类型 type

polypeptide(L)

链编号 strand_id

;a1,b1,c1,d1,e1,f1,g1,h1,i1,j1,k1,l1,m1,n1,o1,p1,q1,r1,s1,t1,u1,v1,w1,x1,y1,z1,A1,B1,C1,D1,E1,F1,G1,H1,I1,J1,K1,L1,M1,N1,O1,P1,Q1,R1,S1,T1,U1,V1,W1,X1,Y1,Z1,01,11,21,31,41,51,61,71,A2,B2,C2,D2,E2,F2,G2,H2,I2,J2,K2,L2,M2,N2,O2,P2,Q2,R2,S2,T2,U2,V2,W2,X2,Y2,Z2,a2,b2,c2,d2,e2,f2,g2,h2,i2,j2,k2,l2,m2,n2,o2,p2,q2,r2,s2,t2,u2,v2,w2,x2,y2,z2,02,12,22,32,42,52,62,72,82,92,2a,2b,2c,2d,2e,2f,2g,2h,2i,2j,2k,2l,2m,2n,2o,2p,2q,2r,2s,2t,2u,2v,2w,2x,2y,2z,2A,2B,2C,2D,2E,2F,2G,2H,2I,2J,2K,2L,2M,2N,2O,2P,2Q,2R,2S,2T,2U,2V,2W,2X,2Y,2Z,aa,ab,ac,ad ;

SKTIVLSVGEATRTLTEIQSTADRQIFEEKVGPLVGRLRLTASLRQNGAKTAYRVNLKLDQADVVDCSTSVCGELPKVRYTQVWSHDVTIVANSTEASRKSLYDLTKSLVATSQVEDLVVNLVPLGR

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分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	644601

Capsid of mature PP7 virion with 3'end region of PP7 genomic RNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maturation protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8tux__assembly_1__model_1

8tux__assembly_1__model_1 | I(q)

8tux__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Capsid of mature PP7 virion with 3'end region of PP7 genomic RNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maturation protein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8tux__assembly_1__model_1

8tux__assembly_1__model_1 | I(q)

8tux__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)