← 返回搜索
8vhv

Transmembrane AMPA Receptor Regulatory Protein Subunit Gamma 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 77.6 Å Quality: REASONABLE
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit

Mus musculus

UniProt O88602

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–208 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8VHV Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JXT Crystal structure of the third PDZ domain of SAP-102 in complex with a fluorogenic peptide-based ligand 提交 2009-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 318–323（6 aa） 片段：C-terminal motif of Stargazin: UNP O88602 residues 318-323
突变：R318(4DB) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.0 M Sodium citrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
3JXT Crystal structure of the third PDZ domain of SAP-102 in complex with a fluorogenic peptide-based ligand 提交 2009-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 318–323（6 aa） 片段：C-terminal motif of Stargazin: UNP O88602 residues 318-323
突变：R318(4DB) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.0 M Sodium citrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
5KBS Cryo-EM structure of GluA2-0xSTZ at 8.7 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–208（207 aa）
链 B 2–208（207 aa）
链 C 2–208（207 aa）
链 D 2–208（207 aa）
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
分辨率 8.70 Å
5KBT Cryo-EM structure of GluA2-1xSTZ complex at 6.4 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–208（207 aa）
链 B 2–208（207 aa）
链 C 2–208（207 aa）
链 D 2–208（207 aa）
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
分辨率 6.40 Å
5KBU Cryo-EM structure of GluA2-2xSTZ complex at 7.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–208（207 aa）
链 B 2–208（207 aa）
链 C 2–208（207 aa）
链 D 2–208（207 aa）
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
分辨率 7.80 Å
5WEO Activated GluA2 complex bound to glutamate, cyclothiazide, and STZ in digitonin 提交 2017-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–208（207 aa） 片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 B 2–208（207 aa） 片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 C 2–208（207 aa） 片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 D 2–208（207 aa） 片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8FP4 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 500mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na610) 提交 2023-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8FP9 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg) 提交 2023-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing. The 1 M L-glutamic acid stock solution was adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.44 Å
8FPG GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100uM CNQX (Closed-CaNaMg) 提交 2023-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；6-cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX, 0.1 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.32 Å
8FPS GluA2 flip Q isoform N619K mutant of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg/N619K) 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
8FQ1 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 150mM CaCl2, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca150) 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CA CALCIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.59 Å
8FQ5 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Na110) 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CL CHLORIDE ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.34 Å
8FQB GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 10mM CaCl2, 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca10) 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8FQF GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 150mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na260) 提交 2023-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E 突变：K52E, K53E CL CHLORIDE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.29 Å
9B5Z GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, consensus structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
9B60 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, consensus structure of TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.57 Å
9B61 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, consensus structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl. 4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
9B63 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, consensus structure of TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl. 4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
9B64 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, class23, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl. 4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9B67 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class1, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9B6A GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class12, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
链 G 1–323（323 aa）
链 H 1–323（323 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9DHP Resting state 1 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 6–208（203 aa）
链 F 6–208（203 aa）
链 G 6–208（203 aa）
链 H 6–208（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
9DHQ Resting state 2 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 6–208（203 aa）
链 F 6–208（203 aa）
链 G 6–208（203 aa）
链 H 6–208（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.78 Å
9DHR Glutamate activated state of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 6–208（203 aa）
链 F 6–208（203 aa）
链 G 6–208（203 aa）
链 H 6–208（203 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9DHS Desensitized state 1 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 6–208（203 aa）
链 F 6–208（203 aa）
链 G 6–208（203 aa）
链 H 6–208（203 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.48 Å
9DHT Desensitized state 2 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 6–208（203 aa）
链 F 6–208（203 aa）
链 G 6–208（203 aa）
链 H 6–208（203 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.31 Å
9E4Y GluA2-gamma2 complex bound to memantine, glutamate, and cyclothiazide 提交 2024-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 3–208（206 aa）
链 F 3–208（206 aa）
链 G 3–208（206 aa）
链 H 3–208（206 aa）
未记录 377 Memantine × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9E4Z GluA2-gamma2 complex bound glutamate and cyclothiazide 提交 2024-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 3–208（206 aa）
链 F 3–208（206 aa）
链 G 3–208（206 aa）
链 H 3–208（206 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9P9B Activated GluA4 homotetrameric AMPAR. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9P9C Active substate 1 of the GluA4 homotetramer. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
9P9D Active substate 2 of the GluA4 homotetramer. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9P9E Active substate 3 of the GluA4 homotetramer. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9P9F Active substate 4 of the GluA4 homotetramer. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
9P9G Active substate 5 of the GluA4 homotetramer. 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–208（207 aa）
链 F 2–208（207 aa）
链 G 2–208（207 aa）
链 H 2–208（207 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.06 Å
9ZKM The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 12 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
9ZKN The TMD structure of native mouse AMPAR with 4 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–323（323 aa）
链 F 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 11 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9ZKQ The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9ZKR The TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9ZKU The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 1 CNIH and PRRT1/SynDIG4 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 F 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 7 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9ZKW The LBD-TMD structure of native mouse AMPAR with 3 TARPs 提交 2025-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–323（323 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å

共 39 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CCG2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–208； UniProt 1–208

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8vhv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8vhv
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8vhv
沉积日期 deposition_date2024-01-02
结构标题 titleTransmembrane AMPA Receptor Regulatory Protein Subunit Gamma 2
关键词 keywordstetraspanin, glutamate receptor regulator protein, Claudin-like, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.77 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron20.01 Å
零角强度 I(0) i05965010.00
分子量 molecular_weight18954.0 kDa
排除体积 excluded_volume24234 ų
包络体积 envelope_volume29489 ų
水化壳体积 shell_volume13687 ų
包络直径 envelope_diameter76.7 Å
壳层 Rg shell_rg24.55 Å
包络 Rg envelope_rg20.84 Å
形状 Rg shape_rg19.97 Å
总 Rg total_rg20.93 Å
总原子数 total_atoms1335
残基数 n_residues172
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax77.6 Å
Rg (实空间) rg_real21.08 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.92 Å
I(0) (实空间) i0_real5.9650e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.5470e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal21.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal5965000.0000
解质量估计 total_estimate0.7291
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary16.9 Å
偏度 Skewness skewness0.603
峰度 Kurtosis kurtosis-0.316
角度范围 angular_range— – 0.3850 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1759000.0000
实空间数据点数 n_real_points70
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.420; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.221; Smooth: 0.992
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▶

8. 引用文献 (2)

▶

9. 文件与曲线 (10)