8vq8

Immune receptor complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	T cell receptor - LCK1-1 TRAV6-5 alpha chain × 1 T cell receptor - LCK1-1 TRBV1 Beta chain × 1 Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain × 1 （P14483,P69296） 1,2-ETHANEDIOL × 15 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HA2B_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–180； UniProt 26–205

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

Mus musculus

UniProt P14483

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	T cell receptor - LCK1-1 TRAV6-5 alpha chain × 1 T cell receptor - LCK1-1 TRBV1 Beta chain × 1 H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain × 1 （P14434） 1,2-ETHANEDIOL × 15 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HB2A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 31–219； UniProt 28–216

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

Mus musculus

UniProt P69296

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 4	T cell receptor - LCK1-1 TRAV6-5 alpha chain × 1 T cell receptor - LCK1-1 TRBV1 Beta chain × 1 H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain × 1 （P14434） 1,2-ETHANEDIOL × 15 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NCAP_I89A4
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–15； UniProt 311–325

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8vq8
沉积日期 deposition_date	2024-01-17
结构标题 title	Immune receptor complex
关键词 keywords	peptide HLA complex, IMMUNE SYSTEM-VIRAL peptide complex, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8vq8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8vq8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8vq8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.37 Å
Rg（电子密度）	34.23 Å
总 Rg	34.51 Å
原子数	6175
残基数	777
排除体积	108740 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8vq8__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	T cell receptor - LCK1-1 TRAV6-5 alpha chain
分子量 formula_weight	22889.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6625

GDSVTQTEGPVTLSEGTSLTVNCSYETKQYPTLFWYVQYPGEGPQLLFKVPKANEKGSSRGFEATYNKEATSFHLQKASVQESDSAVYYCALRISSGSWQLIFGSGTQLTVMPHIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFPSPESS

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	T cell receptor - LCK1-1 TRBV1 Beta chain
分子量 formula_weight	27806.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

VTLLEQNPRWRLVPRGQAVNLRCILKNSQYPWMSWYQQDLQKQLQWLFTLRSPGDKEVKSLPGADYLATRVTDTELRLQVANMSQGRTLYCTCSAELGGDTQYFGPGTRLLVLEDLNKVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALNDSRYALSSRLRVSATFWQNPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRAD

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain
分子量 formula_weight	21204.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

DIEADHVGTYGISVYQSPGDIGQYTFEFDGDELFYVDLDKKETVWMLPEFGQLASFDPQGGLQNIAVVKHNLGVLTKRSNSTPATNEAPQATVFPKSPVLLGQPNTLICFVDNIFPPVINITWLRNSKSVADGVYETSFFVNRDYSFHKLSYLTFIPSDDDIYDCKVEHWGLEEPVLKHWTSGLEVLF

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain
分子量 formula_weight	26266.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

QVYSLIRPNENPAHKGSGGSIEGRGGSGASGDSERHFVYQFMGECYFTNGTQRIRYVTRYIYNREEYVRYDSDVGEHRAVTELGRPDAEYWNSQPEILERTRAELDTVCRHNYEGPETHTSLRRLEQPNVVISLSRTEALNHHNTLVCSVTDFYPAKIKVRWFRNGQEETVGVSSTQLIRNGDWTFQVLVMLEMTPRRGEVYTCHVEHPSLKSPITVEWTGGLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	359

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晶胞边长 a length_a	197.604 Å
晶胞边长 b length_b	197.604 Å
晶胞边长 c length_c	79.331 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	9

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	trigonal

分辨率 resolution	2.010 Å
最低分辨率 resolution_low	49.400 Å
R 因子 r_factor	0.1881
R_work r_work	0.1866
R_free r_free	0.2151

Immune receptor complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8vq8__assembly_1__model_1

8vq8__assembly_1__model_1 | I(q)

8vq8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)

Immune receptor complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class II histocompatibility antigen, A-B alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Nucleoprotein,H-2 class II histocompatibility antigen, A beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8vq8__assembly_1__model_1

8vq8__assembly_1__model_1 | I(q)

8vq8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)