8xli

Structure of the Vo sector of V-ATPase in the adult cortex and hippocampus

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 143.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 4–831	未记录	ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 （B0K022） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （O54715） V-type proton ATPase subunit × 1 V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 （Q5EB76） Ribonuclease K × 1 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c × 9 （P63081） Renin receptor cytoplasmic fragment × 1 （Q6AXS4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
6VQI Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.30 Å
6VQJ Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
6VQK Mammalian V-ATPase from rat brain collar and peripheral stalks rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.70 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 a 1–826（826 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9B8Q Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, peripheral stalks 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 1–838（838 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 a 1–832（832 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VPP1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–828； UniProt 4–831

ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a

物种未注明

UniProt B0K022

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 2–204	未记录	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1 × 1 （P25286） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （O54715） V-type proton ATPase subunit × 1 V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 （Q5EB76） Ribonuclease K × 1 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c × 9 （P63081） Renin receptor cytoplasmic fragment × 1 （Q6AXS4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 b 1–205（205 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B0K022_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–203； UniProt 2–204

V-type proton ATPase subunit S1

物种未注明

UniProt O54715

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 c； UniProt 248–451	未记录	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1 × 1 （P25286） ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 （B0K022） V-type proton ATPase subunit × 1 V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 （Q5EB76） Ribonuclease K × 1 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c × 9 （P63081） Renin receptor cytoplasmic fragment × 1 （Q6AXS4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 c 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 P 1–463（463 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 P 1–463（463 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 P 1–463（463 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 P 1–463（463 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VAS1_RAT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–204； UniProt 248–451

V-type proton ATPase subunit e 2

物种未注明

UniProt Q5EB76

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 e； UniProt 3–79	未记录	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1 × 1 （P25286） ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 （B0K022） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （O54715） V-type proton ATPase subunit × 1 Ribonuclease K × 1 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c × 9 （P63081） Renin receptor cytoplasmic fragment × 1 （Q6AXS4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 e 1–81（81 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VA0E2_RAT
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–77； UniProt 3–79

V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c

物种未注明

UniProt P63081

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 g； UniProt 6–155 链 h； UniProt 6–155 链 i； UniProt 6–155 链 j； UniProt 6–155 链 k； UniProt 6–155 链 l； UniProt 6–155 链 m； UniProt 6–155 链 n； UniProt 6–155 链 o； UniProt 6–155	未记录	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1 × 1 （P25286） ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 （B0K022） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （O54715） V-type proton ATPase subunit × 1 V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 （Q5EB76） Ribonuclease K × 1 Renin receptor cytoplasmic fragment × 1 （Q6AXS4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 g 1–155（155 aa）链 h 1–155（155 aa）链 i 1–155（155 aa）链 j 1–155（155 aa）链 k 1–155（155 aa）链 l 1–155（155 aa）链 m 1–155（155 aa）链 n 1–155（155 aa）链 o 1–155（155 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATL_RAT
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 h； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 i； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 j； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 k； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 l； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 m； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 n； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155 作者链 o； PDB构建体 1–150； UniProt 6–155

Renin receptor cytoplasmic fragment

物种未注明

UniProt Q6AXS4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 16 其他聚合物 4 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 p； UniProt 292–340	未记录	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1 × 1 （P25286） ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a × 1 （B0K022） V-type proton ATPase subunit S1 × 1 （O54715） V-type proton ATPase subunit × 1 V-type proton ATPase subunit e 2 × 1 （Q5EB76） Ribonuclease K × 1 V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c × 9 （P63081） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8XLI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6VQ6 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 1 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQ7 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 2 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
6VQ8 Mammalian V-ATPase from rat brain - composite model of rotational state 3 bound to ADP and SidK (built from focused refinement models) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：34-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
6VQC Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 1 (from focused refinement) 提交 2020-02-04	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
6VQG Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 2 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
6VQH Mammalian V-ATPase from rat brain membrane-embedded Vo region rotational state 3 (from focused refinement) 提交 2020-02-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7UZF Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZG Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 1 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7UZH Rat Kidney V-ATPase with SidK, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7UZI Rat Kidney V-ATPase lacking subunit H, with SidK and NCOA7B, State 2 提交 2022-05-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9B8O Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3, Vo 提交 2024-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BRB Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 1 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BRC Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 2 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9BRD Synaptic Vesicle V-ATPase with synaptophysin and SidK, State 3 提交 2024-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 p 1–350（350 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 PTY PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 9 WJP methyl (3R,6Z,10E,14E)-3,7,11,15,19-pentamethylicosa-6,10,14,18-tetraen-1-yl dihydrogen diphosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 LP3 (7R)-4,7-DIHYDROXY-N,N,N-TRIMETHYL-10-OXO-3,5,9-TRIOXA-4-PHOSPHAHEPTACOSAN-1-AMINIUM 4-OXIDE × 1 CLR CHOLESTEROL × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RENR_RAT
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 p； PDB构建体 1–49； UniProt 292–340

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8xli
沉积日期 deposition_date	2023-12-26
结构标题 title	Structure of the Vo sector of V-ATPase in the adult cortex and hippocampus
关键词 keywords	Vo sector of V-ATPase, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	45.47 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.52 Å
零角强度 I(0) i0	1338270000.00
分子量 molecular_weight	327060.0 kDa
排除体积 excluded_volume	418920 Å³
包络体积 envelope_volume	584320 Å³
水化壳体积 shell_volume	103310 Å³
包络直径 envelope_diameter	152.4 Å
壳层 Rg shell_rg	53.80 Å
包络 Rg envelope_rg	43.78 Å
形状 Rg shape_rg	44.54 Å
总 Rg total_rg	44.83 Å
总原子数 total_atoms	23024
残基数 n_residues	3075
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	143.2 Å
Rg (实空间) rg_real	45.18 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.17 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3380e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4150e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	45.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1339000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8804
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	57.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.156
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.376
角度范围 angular_range	— – 0.1750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	143000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	36
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.867; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.872

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1
分子量 formula_weight	95248.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a
原子数 atom_count	23024

LFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELEELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEEMDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKRNFLELTELKFILRKTQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPNEMGRGAPLRLGFVAGVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNRMQTNQTPPTYNKTNKFTHGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTVITFPFLFAVMFGDFGHGILMTLFAVWMVLRESRILSQKNENEMFSMVFSGRYIILLMGLFSIYTGLIYNDCFSKSLNIFGSSWSVRPMFTIGNWTEETLLGSSVLQLNPAIPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMSSLFGYLVILIFYKWTAYDAHSSRNAPSLLIHFINMFLFSYPESGNAMLYSGQKGIQCFLIVVAMLCVPWMLLFKPLILRHQYLRKKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEIIQHDQLSTHSEDAEEPTEDEVFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTMVIHIGLHVRSLAGGLGLFFIFAAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYTGTGFKFLPFSFEHI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a
分子量 formula_weight	21372.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

TGLELLYLGIFVAFWACMIVVGICYTIFDLGFRFDVAWFLTETSPFMWSNLGIGLAISLSVVGAAWGIYITGSSIIGGGVKAPRIKTKNLVSIIFCEAVAIYGIIMAIVISNMAEPFSATDPKAIGHRNYHAGYSMFGAGLTVGLSNLFCGVCVGIVGSGAALADAQNPSLFVKILIVEIFGSAIGLFGVIVAILQTSRVKMG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit S1
分子量 formula_weight	23360.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

IHPPVSYNDTAPRILFWAQNFSVAYKDEWKDLTSLTFGVENLNLTGSFWNDSFAMLSLTYEPLFGATVTFKFILASRFYPVSARYWFTMERLEIHSNGSVAHFNVSQVTGPSIYSFHCEYVSSLSKKGSLLVTNVPSLWQMTLHNFQIQAFNVTGEQFSYASDCAGFFSPGIWMGLLTTLFMLFIFTYGLHMILSLKTMDRFDD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit
分子量 formula_weight	39285.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

SFFPELYFNVDNGYLEGLVRGLKAGVLSQADYLNLVQCETLEDLKLHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDKLKEKMVVEFRHMRNHAYEPLASFLDFITYSYMIDNVILLITGTLHQKCHPLGSFEQMEAVNIAQTPAELYNAILVDTPLAAFFQDCISEQDLDAMNIEIIRNTLYKAYLESFYKFCTLLGGTTADAMCPILEFEADRRAFIITINSFGTELSKEDRAKLFPHCGRLYPEGLAQLARADDYEQVKNVADYYPEYKLLFEGAGSNPGDKTLEDRFFEHEVKLNKLAFLNQFHFGVFYAFVKLKEQECRNIVWIAECIAQRHRAKIDNYIPIF

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit e 2
分子量 formula_weight	8655.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

AHSFALPVIIFTTFWGLIGIAGPWFVPKGPNRGVIITMLVATAVCCYLFWLIAILAQLNPLFGPQLKNETIWYVRFL

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Ribonuclease K
分子量 formula_weight	9933.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

CCGPKLAACGIVLSAWGVIMLIMLGIFFNVHSAVLIEDVPFTEKDFENGPQNIYNLYEQVSYNCFIAAGLYLLLGGFSFCQVRLNKRKE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c
分子量 formula_weight	15256.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,h,i,j,k,l,m,n,o

NNPEYSSFFGVMGASSAMVFSAMGAAYGTAKSGTGIAAMSVMRPELIMKSIIPVVMAGIIAIYGLVVAVLIANSLTDGITLYRSFLQLGAGLSVGLSGLAAGFAIGIVGDAGVRGTAQQPRLFVGMILILIFAEVLGLYGLIVALILSTK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Renin receptor cytoplasmic fragment
分子量 formula_weight	5740.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

PYNLAYKYNLEYSVVFNLVLWIMTGLALAVIITSYNIWNMDPGYDSIIY

实体 9 Entity 9 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	34147

fit	/app/data/saxs_computation/xl/8xli/8xli.fit
pddf	/app/data/pr_computation/xl/8xli/8xli.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/xl/8xli/8xli.dat

Structure of the Vo sector of V-ATPase in the adult cortex and hippocampus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase 116 kDa subunit a 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATPase, H+ transporting, V0 subunit B (Predicted), isoform CRA_a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase subunit S1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase subunit e 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit c

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Renin receptor cytoplasmic fragment

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 branched

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)