8yt8

Cryo-EM structure of the dystrophin glycoprotein complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-sarcoglycan

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SGCA_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–291； UniProt 24–314

Beta-sarcoglycan

物种未注明

UniProt P82349

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SGCB_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–263； UniProt 55–317

Dystrobrevin alpha

物种未注明

UniProt Q9D2N4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DTNA_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–206； UniProt 32–237

Delta-sarcoglycan

物种未注明

UniProt P82347

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SGCD_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–263； UniProt 27–289

Dystrophin

物种未注明

UniProt P11531

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DMD_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–331； UniProt 3065–3395

Gamma-sarcoglycan

物种未注明

UniProt P82348

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SGCG_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–265； UniProt 27–291

Beta-dystroglycan

物种未注明

UniProt Q62165

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Sarcospan × 1 （Q62147） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DAG1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–289； UniProt 492–780

Sarcospan

物种未注明

UniProt Q62147

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 9	Alpha-sarcoglycan × 1 （P82350） Beta-sarcoglycan × 1 （P82349） Dystrobrevin alpha × 1 （Q9D2N4） Delta-sarcoglycan × 1 （P82347） Dystrophin × 1 （P11531） Gamma-sarcoglycan × 1 （P82348） unknown segment × 1 Beta-dystroglycan × 1 （Q62165） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CHOLESTEROL × 3 ZINC ION × 1 O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 1 CALCIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SSPN_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–179； UniProt 23–201

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8yt8
沉积日期 deposition_date	2024-03-25
结构标题 title	Cryo-EM structure of the dystrophin glycoprotein complex
关键词 keywords	complex membrane stability signaling, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8yt8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8yt8__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8yt8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	75.93 Å
Rg（电子密度）	75.86 Å
总 Rg	75.08 Å
原子数	16309
残基数	2092
排除体积	291600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8yt8__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Alpha-sarcoglycan
分子量 formula_weight	32539.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	16309

QQTTLHLLVGRVFVHPLEHATFLRLPEHVAVPPTVRLTYHAHLQGHPDLPRWLHYTQRSPYNPGFLYGSPTPEDRGYQVIEVTAYNRDSFDTTRQRLLLLIGDPEGPRLPYQAEFLVRSHDVEEVLPTTPANRFLTALGGLWEPGELQLLNITSALDRGGRVPLPIEGRKEGVYIKVGSATPFSTCLKMVASPDSYARCAQGQPPLLSCYDTLAPHFRVDWCNVSLVDKSVPEPLDEVPTPGDGILEHDPFFCPPTEATDRDFLTDALVTLLVPLLVALLLTLLLAYIMCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-sarcoglycan
分子量 formula_weight	28730.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

HKTGLRGRKGNLAICVIVLLFILAVINLLITLVIWAVIRIGPNGCDSMEFHESGLLRFKQVSDMGVIHPLYKSTVGGRRNENLVITGNNQPIVFQQGTTKLSVEKNKTSITSDIGMQFFDPRTHNILFSTDYETHEFHLPSGVKSLNVQKASTERITSNATSDLNIKVDGRAIVRGNEGVFIMGKTIEFHMGGDVELKAENSIILNGTVMVSPTRLPSSSSGDQSGSGDWVRYKLCMCADGTLFKVQVTGHNMGCQVSDNPCG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Dystrobrevin alpha
分子量 formula_weight	23363.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

LSTYRTACKLRFVQKKCNLHLVDIWNVIEALRENALNNLDPNIELNVARLEAVLSTIFYQLNKRMPTTHQIHVEQSISLLLNFLLAAFDPEGHGKISVFAVKMALATLCGGKIMDKLRYIFSMISDSSGVMVYGRYDQFLREVLKLPTAVFEGPSFGYTEQSARSCFSQQKKVTLNGFLDTLMSDPPPQCLVWLPLLHRLANVENV

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Delta-sarcoglycan
分子量 formula_weight	29191.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

YGWRKRCLYFFVLLLMILILVNLAMTIWILKVMNFTIDGMGNLRITEKGLKLEGDSEFLQPLYAKEIKSRPGNALYFKSARNVTVNILNDQTKVLTQLVTGPKAVEAYGKRFEVKTVSGKLLFSADDSEVVVGAERLRVLGAEGTVFPKSIETPNVRADPFKELRLESPTRSLVMEAPKGVEINAEAGNMEAICRSELRLESKDGEIKLDAAKIKLPRLPRGSYTPTGTRQKVFEVCVCANGRLFLSQAGTGSTCQINTSVCL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Dystrophin
分子量 formula_weight	38371.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

YYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Gamma-sarcoglycan
分子量 formula_weight	28956.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

GIYGWRKRCLYLFVLLLLAILVVNLALTIWILKVMWFSPIGMGHLHVTADGLRLEGESEFLFPLYAKEIRSRVDSSLLLQSTQNVTVSARNSEGEVTGRVKVGAQMVEVQSQHFQINSEDGKPLFSAEEQDVVVGTGRLRVTGPEGALFEHSVETPLVRADPFQDLRLESPTRSLSMDAPRGVHVKANAGKLEALSQMDIILQSSEGVLVLDAETVGLTKLKQGTQGPAGSSNGFYEICACPDGKLYLSMAGEVTTCEEHSHVCL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	unknown segment
分子量 formula_weight	559.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

ALPKM

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Beta-dystroglycan
分子量 formula_weight	31934.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

NQRPELKNHIDRVDAWVGTYFEVKIPSDTFYDNEDTTTDKLKLTLKLREQQLVGEKSWVQFNSNSQLMYGLPDSSHVGKHEYFMHATDKGGLSAVDAFEIHVHKRPQGDKAPARFKARLAGDPAPVVNDIHKKIALVKKLAFAFGDRNCSSITLQNITRGSIVVEWTNNTLPLEPCPKEQIIGLSRRIADENGKPRPAFSNALEPDFKALSIAVTGSGSCRHLQFIPVAPPSPGSSAAPATEVPDRDPEKSSEDDVYLHTVIPAVVVAAILLIAGIIAMICYRKKRKGK

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Sarcospan
分子量 formula_weight	19918.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

CRFPLLLALLQLALGIAVTVLGFLMASISPSLLVRDTPFWAGSIVCVVAYLGLFMLCVSYQVDERTCVQFSMKVFYFLLSALGLMVCMLAVAFAAHHYSLLAQFTCETSLDSCQCKLPSSEPLSRAFVYRDVTDCTSVTGTFKLFLIIQMVLNLVCGLVCLLACFVMWKHRYQVFYVGV

实体 10 Entity 10 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

实体 11 Entity 11 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine
分子量 formula_weight	792.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	499658

Cryo-EM structure of the dystrophin glycoprotein complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-sarcoglycan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-sarcoglycan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dystrobrevin alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Delta-sarcoglycan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dystrophin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gamma-sarcoglycan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-dystroglycan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sarcospan

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8yt8__assembly_1__model_1

8yt8__assembly_1__model_1 | I(q)

8yt8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer