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5VTB
Crystal structure of RBBP4 bound to BCL11a peptide
提交 2017-05-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 B
2–16(15 aa)
片段:UNP residues 2-16
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未记录
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GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;25% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.244
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6KI6
Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region
提交 2019-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
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链 A
731–835(105 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.251
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6KI6
Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region
提交 2019-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
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链 B
731–835(105 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.251
|
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6U9Q
Crystal Structure Analysis of DNA-BCL11A Znf domain complex
提交 2019-09-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
PO4 PHOSPHATE ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;NaMalate~8.0
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分辨率 1.83 Å
R-free 0.195
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8DTN
The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
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链 B
797–826(30 aa)
链 D
797–826(30 aa)
链 F
797–826(30 aa)
链 H
797–826(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 4
ZN ZINC ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.232
|
|
8DTN
The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
797–826(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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MG MAGNESIUM ION × 1
ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.232
|
|
8DTN
The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
797–826(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.232
|
|
8DTN
The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 F
797–826(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
MG MAGNESIUM ION × 3
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.232
|
|
8DTN
The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 H
797–826(30 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.232
|
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8DTU
The complex of nanobody 5344N74D with BCL11A ZF6.
提交 2022-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 C
799–826(28 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;281.15 K;0.1 M HEPES, pH 7.5-8.2, 2.2M Li2SO4.
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.288
|
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8THO
Solution structure of the zinc finger repeat domain of BCL11A (ZnF456)
提交 2023-07-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
737–835(99 aa)
片段:residues 737-835
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未记录
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ZN ZINC ION × 3
|
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)163;压力 1
NMR样品组成
137 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 1 mM dithiothreitol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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8TLO
Crystal Structure Analysis of BCL11A in complex with DNA
提交 2023-07-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;30% PEG6K and 0.1M Na Citrate pH 5.0
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.269
|
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9BV0
NMR structure of the Z0 CCHC zinc-finger of transcription repressor Bcl11A
提交 2024-05-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
46–72(27 aa)
片段:B0 atypical C2HC zinc-finger domain, residues 46-72
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.6;压力 1
NMR测量条件
pH 5.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.6;压力 1
NMR样品组成
40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 90% H2O/10% D20 | 90% H2O/10% D20
NMR样品组成
40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 100% D20 | 100% D2O
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分辨率未提供
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9E6R
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA
提交 2024-10-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
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ZN ZINC ION × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;292 K;24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.238
|
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9E6R
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA
提交 2024-10-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;292 K;24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.238
|
|
9E6R
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA
提交 2024-10-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 Y
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.8;292 K;24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å
R-free 0.238
|
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9E6S
BCL11A ZF4-6 with K784T Mutation in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA
提交 2024-10-30
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
链 D
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
突变:K784T
突变:K784T
|
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
ZN ZINC ION × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;292 K;18 % w/v PEG 3350, 17 % v/v PEG 400, 4.8 % v/v 2-Propanol, 0.1 M CAPSO 9.0
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.275
|
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9E6T
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGCCCA
提交 2024-10-30
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
链 B
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 6
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;292 K;15 % w/v PEG 1000, 30 % v/v PEG 300, 0.1 M Bis-Tris Propane 7.0
|
分辨率 2.78 Å
R-free 0.281
|
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9YLL
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (20-mer)
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.9;292 K;20% w/v Polyethylene glycol 3,350
0.2M sodium chloride
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分辨率 2.38 Å
R-free 0.247
|
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9YLM
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (12-mer)
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
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ZN ZINC ION × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;292 K;28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.244
|
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9YLN
BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGGCCA (12-mer)
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
730–835(106 aa)
片段:Zinc finger domains 4-6
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;292 K;28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.247
|
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9YLO
BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (P21212 crystal form)
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
373–433(61 aa)
片段:C2H2 zinc finger domains 2 and 3
|
未记录
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EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
ZN ZINC ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;292 K;10% w/v PEG 20 000, 20% v/v PEG MME 500, 60mM sodium fluoride, 60mM sodium bromide, 60mM sodium iodide, 0.1M Bicine- TRIS-base (pH 8.5)
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分辨率 1.97 Å
R-free 0.241
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9YLP
BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (C2221 Crystal Form)
提交 2025-10-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:trimeric
|
链 A
373–433(61 aa)
片段:C2H2 zinc finger domains 2 and 3
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 4
MG MAGNESIUM ION × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;278 K;28 % w/v PEG 4000,
0.1 M Sodium citrate (pH 6.5), 0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Ammonium sulfate
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分辨率 2.04 Å
R-free 0.245
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