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9c1p

Structure of Calcium-Sensing Receptor in complex with positive allosteric modulator '6218

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 165.5 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Extracellular calcium-sensing receptor

Homo sapiens

UniProt P41180

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 19–894 链 B； UniProt 19–894 未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 8 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1ATP (5R)-N-[2-(1,2-benzothiazol-3-yl)ethyl]-1-methyl-2,3,4,5-tetrahydro-1H-1-benzazepin-5-amine × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9C1P Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5FBH Crystal structure of the extracellular domain of human calcium sensing receptor with bound Gd3+ 提交 2015-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–541（522 aa） 片段：UNP residues 20-541
链 B 20–541（522 aa） 片段：UNP residues 20-541
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GD3 GADOLINIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 BCT BICARBONATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；10% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 10 mM CaCl2 and 100 mM Tris-HCl, 0.5 mM GdCl3
分辨率 2.70 Å R-free 0.236
5FBK Crystal structure of the extracellular domain of human calcium sensing receptor 提交 2015-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–541（522 aa） 片段：UNP residues 20-541
链 B 20–541（522 aa） 片段：UNP residues 20-541
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 6 BCT BICARBONATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；10% PEG 8000, 200 mM MgCl2, 10 mM CaCl2 and 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
5K5S Crystal structure of the active form of human calcium-sensing receptor extracellular domain 提交 2016-05-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–607（588 aa）
链 B 20–607（588 aa）
未记录 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M NaH2PO4, 0.4 M K2HPO4, 100 mM Na2HPO4/citric acid pH 4.2, 10 mM CaCl2, 10 mM L-Trp
分辨率 2.60 Å R-free 0.222
5K5T Crystal structure of the inactive form of human calcium-sensing receptor extracellular domain 提交 2016-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–607（588 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 2 mM CaCl2
分辨率 3.10 Å R-free 0.239
5K5T Crystal structure of the inactive form of human calcium-sensing receptor extracellular domain 提交 2016-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–607（588 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 2 mM CaCl2
分辨率 3.10 Å R-free 0.239
5K5T Crystal structure of the inactive form of human calcium-sensing receptor extracellular domain 提交 2016-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–607（588 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 12 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5 M Li2SO4, 100 mM Tris pH 8.5, 2 mM CaCl2
分辨率 3.10 Å R-free 0.239
7DTT Human Calcium-Sensing Receptor bound with calcium ions 提交 2021-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–1078（1059 aa）
链 B 20–1078（1059 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7DTU Human Calcium-Sensing Receptor bound with L-Trp 提交 2021-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–1078（1059 aa）
链 B 20–1078（1059 aa）
未记录 TRP TRYPTOPHAN × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7DTV Human Calcium-Sensing Receptor bound with L-Trp and calcium ions 提交 2021-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–1078（1059 aa）
链 B 20–1078（1059 aa）
未记录 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DTW Human Calcium-Sensing Receptor in the inactive close-close conformation 提交 2021-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–1078（1059 aa）
链 B 20–1078（1059 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7E6T Structural insights into the activation of human calcium-sensing receptor 提交 2021-02-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–870（851 aa）
链 B 20–870（851 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
7E6U the complex of inactive CaSR and NB2D11 提交 2021-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–870（851 aa）
链 C 20–870（851 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 6.00 Å
7M3E Asymmetric Activation of the Calcium Sensing Receptor Homodimer 提交 2021-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–894（875 aa）
链 B 20–894（875 aa）
未记录 YP1 2-chloro-6-[(2R)-2-hydroxy-3-{[2-methyl-1-(naphthalen-2-yl)propan-2-yl]amino}propoxy]benzonitrile × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7M3F Asymmetric Activation of the Calcium Sensing Receptor Homodimer 提交 2021-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–894（875 aa）
链 B 20–894（875 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7M3G Asymmetric Activation of the Calcium Sensing Receptor Homodimer 提交 2021-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 20–894（875 aa）
链 B 20–894（875 aa）
未记录 H43 2-[4-[(3S)-3-[[(1R)-1-naphthalen-1-ylethyl]amino]pyrrolidin-1-yl]phenyl]ethanoic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7M3J Asymmetric Activation of the Calcium Sensing Receptor Homodimer 提交 2021-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–894（875 aa）
链 B 20–894（875 aa）
未记录 YP1 2-chloro-6-[(2R)-2-hydroxy-3-{[2-methyl-1-(naphthalen-2-yl)propan-2-yl]amino}propoxy]benzonitrile × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8SZF Cryo-EM structure of cinacalcet-bound active-state human calcium-sensing receptor CaSR in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 19–894（876 aa）
链 B 19–894（876 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 SPM SPERMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8SZG Cryo-EM structure of cinacalcet-bound human calcium-sensing receptor CaSR-Gq complex in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–894（876 aa）
链 B 19–894（876 aa）
未记录 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 SPM SPERMINE × 3 CA CALCIUM ION × 3 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8SZH Cryo-EM structure of cinacalcet-bound human calcium-sensing receptor CaSR-Gi complex in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–894（876 aa）
链 B 19–894（876 aa）
未记录 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 SPM SPERMINE × 4 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8SZI Cryo-EM structure of PAM-free human calcium-sensing receptor CaSR-Gi complex in lipid nanodiscs 提交 2023-05-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–894（876 aa）
链 B 19–894（876 aa）
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8WPG Human calcium-sensing receptor bound with cinacalcet in detergent 提交 2023-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–892（873 aa）
链 B 20–892（873 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8WPU Human calcium-sensing receptor(CaSR) bound to cinacalcet in complex with Gq protein 提交 2023-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 20–892（873 aa）
链 B 20–892（873 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 YP4 N-[(1R)-1-(naphthalen-1-yl)ethyl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propan-1-amine × 2 TRP TRYPTOPHAN × 2 CA CALCIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9ASB Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gq (miniGisq) protein in nanodiscs 提交 2024-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 1–903（903 aa）
链 R 1–903（903 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 A1AF7 (19R,22S,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.
分辨率 3.40 Å
9AVG Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gs (miniGis) protein in nanodiscs 提交 2024-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 1–903（903 aa）
链 R 1–903（903 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 A1AF7 (19R,22S,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.
分辨率 3.60 Å
9AVL Structure of human calcium-sensing receptor in complex with Gi3 protein in nanodiscs 提交 2024-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 1–903（903 aa）
链 R 1–903（903 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 A1AF7 (19R,22S,25R)-22,25,26-trihydroxy-16,22-dioxo-17,21,23-trioxa-22lambda~5~-phosphahexacosan-19-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.
分辨率 3.80 Å
9AXF Structure of human calcium-sensing receptor in complex with chimeric Gq (miniGisq) protein in detergent 提交 2024-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 Q 1–903（903 aa）
链 R 1–903（903 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 7 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 CLR CHOLESTEROL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.
分辨率 3.50 Å
9AYF Structure of human calcium-sensing receptor in complex with Gi1 (miniGi1) protein in detergent 提交 2024-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Q 1–903（903 aa）
链 R 1–903（903 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 TCR CYCLOMETHYLTRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 9IG 3-(2-chlorophenyl)-N-[(1R)-1-(3-methoxyphenyl)ethyl]propan-1-amine × 2 AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was blotted for 6s before plunge-frozen.
分辨率 3.60 Å
9C2F Structure of Calcium-Sensing Receptor in complex with positive allosteric modulator '54149 提交 2024-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 19–894（876 aa）
链 B 19–894（876 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 8 TRP TRYPTOPHAN × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 A1ATX (1R)-1-(2H-1,3-benzodioxol-4-yl)-N-[2-(1,2-benzothiazol-3-yl)ethyl]ethan-1-amine × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9J7I Cryo-EM Structure of calcium sensing receptor in complex gamma-glutamyl-valyl-glycine as a kokumi substance 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 19–894（876 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9J7I Cryo-EM Structure of calcium sensing receptor in complex gamma-glutamyl-valyl-glycine as a kokumi substance 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 19–894（876 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9J7I Cryo-EM Structure of calcium sensing receptor in complex gamma-glutamyl-valyl-glycine as a kokumi substance 提交 2024-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 19–894（876 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å

共 27 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CASR_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 33–908； UniProt 19–894 作者链 B； PDB构建体 11–886； UniProt 19–894

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9c1p

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9c1p
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9c1p
沉积日期 deposition_date2024-05-29
结构标题 titleStructure of Calcium-Sensing Receptor in complex with positive allosteric modulator '6218
关键词 keywordsG-protein coupled receptor, calcium-sensing, membrane protein; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier52.56 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron55.13 Å
零角强度 I(0) i0403038000.00
分子量 molecular_weight173720.0 kDa
排除体积 excluded_volume219980 ų
包络体积 envelope_volume321240 ų
水化壳体积 shell_volume53231 ų
包络直径 envelope_diameter177.3 Å
壳层 Rg shell_rg49.63 Å
包络 Rg envelope_rg54.71 Å
形状 Rg shape_rg55.11 Å
总 Rg total_rg54.98 Å
总原子数 total_atoms12240
残基数 n_residues1541
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax165.5 Å
Rg (实空间) rg_real53.22 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.07 Å
I(0) (实空间) i0_real4.0300e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.1400e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal51.97 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal402300000.0000
解质量估计 total_estimate0.7124
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary110.3 Å
偏度 Skewness skewness0.574
峰度 Kurtosis kurtosis-0.688
角度范围 angular_range— – 0.1500 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha33270000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.517; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.708; Smooth: 0.001
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)