SAXSdb — 9dog

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

glycoprotein E

dengue virus type 2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 144	Protein prM × 72 （P14340）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	G3GAJ4_9FLAV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A000； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A001； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A002； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A003； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A004； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A005； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A006； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A007； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A008； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A009； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A010； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A011； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A012； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A013； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A014； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A015； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A016； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A017； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A018； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A019； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A020； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A021； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A022； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 A023； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B000； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B001； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B002； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B003； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B004； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B005； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B006； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B007； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B008； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B009； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B010； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B011； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B012； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B013； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B014； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B015； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B016； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B017； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B018； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B019； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B020； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B021； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B022； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 B023； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C000； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C001； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C002； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C003； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C004； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C005； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C006； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C007； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C008； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C009； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C010； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C011； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C012； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C013； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C014； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C015； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C016； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C017； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C018； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C019； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C020； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C021； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C022； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495 作者链 C023； PDB构建体 1–495； UniProt 1–495

Protein prM

dengue virus type 2

UniProt P14340

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 144	glycoprotein E × 72 （G3GAJ4）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_DEN2N
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D000； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D001； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D002； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D003； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D004； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D005； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D006； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D007； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D008； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D009； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D010； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D011； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D012； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D013； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D014； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D015； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D016； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D017； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D018； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D019； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D020； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D021； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D022； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 D023； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E000； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E001； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E002； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E003； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E004； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E005； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E006； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E007； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E008； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E009； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E010； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E011； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E012； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E013； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E014； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E015； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E016； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E017； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E018； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E019； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E020； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E021； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E022； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 E023； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F000； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F001； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F002； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F003； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F004； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F005； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F006； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F007； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F008； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F009； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F010； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F011； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F012； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F013； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F014； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F015； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F016； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F017； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F018； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F019； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F020； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F021； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F022； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280 作者链 F023； PDB构建体 1–166； UniProt 115–280

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9dog
沉积日期 deposition_date	2024-09-19
结构标题 title	Octahedral small virus-like particles of dengue virus type 2 (octahedral reconstruction)
关键词 keywords	dengue virus type 2, virus, flavivirus, virus-like particle, prM-E protein, fusion protein, cryoEM, VIRUS LIKE PARTICLE; VIRUS LIKE PARTICLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9dog__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9dog__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9dog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	136.20 Å
总 Rg	136.20 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	6466400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9dog__assembly_1__model_1`	144-meric （144）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	glycoprotein E
分子量 formula_weight	54363.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	72

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	;A000,C004,A005,B005,C005,A006,B006,C006,A007,B007,C007,A008,B008,C008,B000,A009,B009,C009,A010,B010,C010,A011,B011,C011,A012,B012,C012,C000,A013,B013,C013,A014,B014,C014,A015,B015,C015,A016,B016,C016,A017,B017,C017,A018,B018,C018,A019,B019,C019,A020,B020,C020,A021,B021,C021,A022,B022,C022,A023,B023,C023,A001,B001,C001,A002,B002,C002,A003,B003,C003,A004,B004 ;
原子数 atom_count	47592

MRCIGISNRDFVEGVSGGSWVDIVLEHGSCVTTMAKNKPTLDFELIKTEAKQPATLRKYCIEAKLTNTTTDSRCPTQGEPSLNEEQDKRFVCKHSMVDRGWGNGCGLFGKGGIVTCAMFTCKKNMKGKVVQPENLEYTIVITPHSGEEHAVGNDTGKHGKEIKITPQSSITEAELTGYGTVTMECSPRTGLDFNEMVLLQMENKAWLVHRQWFLDLPLPWLPGADTQGSNWIQKETLVTFKNPHAKKQDVVVLGSQEGAMHTALTGATEIQMSSGNLLFTGHLKCRLRMDKLQLKGMSYSMCTGKFKVVKEIAETQHGTIVIRVQYEGDGSPCKIPFEIMDLEKRHVLGRLITVNPIVTEKDSPVNIEAEPPFGDSYIIIGVEPGQLKLNWFKKGSSIGQMIETTMRGAKRMAILGDTAWDFGSLGGVFTSIGKALHQVFGAIYGAAFSGVSWIMKILIGVIITWIGMNSRSTSLSVSLVLVGVVTLYLGVMVQA

来源 Source

来源生物 organism	dengue virus type 2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11060
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein prM
分子量 formula_weight	18851.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	72

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	;D004,E004,F004,D005,E005,F005,D006,E006,F006,D007,E007,F007,D008,E008,F008,D009,E009,F009,D010,E010,F010,D011,E011,F011,D012,E012,F012,D013,E013,F013,D014,E014,F014,D015,E015,F015,D016,E016,F016,D000,D017,E017,F017,D018,E018,F018,D019,E019,F019,D020,E020,F020,D021,E000,E021,F021,D022,E022,F022,D023,E023,F023,F000,D001,E001,F001,D002,E002,F002,D003,E003,F003 ;

FHLTTRNGEPHMIVSRQEKGKSLLFKTEDGVNMCTLMAMDLGELCEDTITYKCPFLKQNEPEDIDCWCNSTSTWVTYGTCTTTGEHRREKRSVALVPHVGMGLETRTETWMSSEGAWKHAQRIETWILRHPGFTIMAAILAYTIGTTHFQRALIFILLTAVAPSMT

来源 Source

来源生物 organism	dengue virus type 2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11060
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

▶

分辨率 resolution	6.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	38934

Octahedral small virus-like particles of dengue virus type 2 (octahedral reconstruction)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

glycoprotein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein prM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9dog__assembly_1__model_1

9dog__assembly_1__model_1 | I(q)

9dog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Octahedral small virus-like particles of dengue virus type 2 (octahedral reconstruction)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

glycoprotein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein prM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9dog__assembly_1__model_1

9dog__assembly_1__model_1 | I(q)

9dog__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)