9e97

L-allo-threonine aldolase from Thermotoga maritima N308E-Y87A-R122G-P121D Mutant with a 2-(aminomethyl)pyridine PLP modification

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 91.9 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9e97

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9e97
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9e97
沉积日期 deposition_date2024-11-07
结构标题 titleL-allo-threonine aldolase from Thermotoga maritima N308E-Y87A-R122G-P121D Mutant with a 2-(aminomethyl)pyridine PLP modification
关键词 keywordsPYRIDOXAL-5-PHOSPHATE, PLP, ENZYME, INHIBITOR COMPLEX, LYASE; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier29.42
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.00
零角强度 I(0) i0188312000.00
分子量 molecular_weight71239.0 kDa
排除体积 excluded_volume67906 ų
包络体积 envelope_volume115700 ų
水化壳体积 shell_volume33804 ų
包络直径 envelope_diameter97.5
壳层 Rg shell_rg35.78
包络 Rg envelope_rg28.97
形状 Rg shape_rg29.00
总 Rg total_rg29.44
总原子数 total_atoms5363
残基数 n_residues688
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax91.9
Rg (实空间) rg_real29.42
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.76
I(0) (实空间) i0_real1.8830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2510e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal29.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal188300000.0000
解质量估计 total_estimate0.9044
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary30.6
偏度 Skewness skewness0.309
峰度 Kurtosis kurtosis-0.549
角度范围 angular_range— – 0.2700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha55650000.0000
实空间数据点数 n_real_points55
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.951; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.912

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (7)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)