SAXSdb — 9hi0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-glucose 4-epimerase

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	1,2-ETHANEDIOL × 2 NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 3-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbamoylamino]-~{N}-pyridin-4-yl-propanamide × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	1,2-ETHANEDIOL × 3 NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 3-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbamoylamino]-~{N}-pyridin-4-yl-propanamide × 1 D-MALATE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GALE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–344； UniProt 2–345 作者链 B； PDB构建体 1–344； UniProt 2–345

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9hi0
沉积日期 deposition_date	2024-11-22
最后修订 last_revision	2025-12-03
结构标题 title	STRUCTURE OF HUMAN UDP-GALACTOSE 4-EPIMERASE IN COMPLEX WITH COMPOUND WBX04
关键词 keywords	glycosylation, metabolism, nucleotide-sugar, ISOMERASE; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9hi0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9hi0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9hi0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.47 Å
Rg（电子密度）	19.48 Å
总 Rg	20.38 Å
原子数	5338
残基数	344
排除体积	48320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9hi0__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`9hi0__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	UDP-glucose 4-epimerase
分子量 formula_weight	37980.2 kDa
EC 编号 ec_number	5.1.3.2,5.1.3.7
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A
原子数 atom_count	11346

AEKVLVTGGAGYIGSHTVLELLEAGYLPVVIDNFHNAFRGGGSLPESLRRVQELTGRSVEFEEMDILDQGALQRLFKKYSFMAVIHFAGLKAVGESVQKPLDYYRVNLTGTIQLLEIMKAHGVKNLVFSSSATVYGNPQYLPLDEAHPTGGCTNPYGKSKFFIEEMIRDLCQADKTWNAVLLRYFNPTGAHASGCIGEDPQGIPNNLMPYVSQVAIGRREALNVFGNDYDTEDGTGVRDYIHVVDLAKGHIAALRKLKEQCGCRIYNLGTGTGYSVLQMVQAMEKASGKKIPYKVVARREGDVAACYANPSLAQEELGWTAALGLDRMCEDLWRWQKQNPSGFGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	663.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	3-[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbamoylamino]-~{N}-pyridin-4-yl-propanamide
分子量 formula_weight	289.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	D-MALATE
分子量 formula_weight	134.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	524

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晶胞边长 a length_a	136.358 Å
晶胞边长 b length_b	46.300 Å
晶胞边长 c length_c	110.727 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.370 Å
最低分辨率 resolution_low	68.272 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1538
R_free r_free	0.1897

STRUCTURE OF HUMAN UDP-GALACTOSE 4-EPIMERASE IN COMPLEX WITH COMPOUND WBX04

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-glucose 4-epimerase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9hi0__assembly_1__model_1

9hi0__assembly_1__model_1 | I(q)

9hi0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)

STRUCTURE OF HUMAN UDP-GALACTOSE 4-EPIMERASE IN COMPLEX WITH COMPOUND WBX04

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-glucose 4-epimerase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9hi0__assembly_1__model_1

9hi0__assembly_1__model_1 | I(q)

9hi0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)