9im4

Crystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein AF-9

Homo sapiens

UniProt P42568

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H3.3C × 1 (Q6NXT2) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H3.3C × 1 (Q6NXT2) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AF9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 21–158; UniProt 1–138 作者链 B; PDB构建体 21–158; UniProt 1–138

Histone H3.3C

物种未注明

UniProt Q6NXT2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Protein AF-9 × 1 (P42568) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Protein AF-9 × 1 (P42568) water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H3C_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–10; UniProt 2–11 作者链 P; PDB构建体 1–10; UniProt 2–11

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9im4
沉积日期 deposition_date2024-07-02
最后修订 last_revision2025-07-09
结构标题 titleCrystal Structure of AF9 YEATS domain F28R mutant in complex with histone H3K9la
关键词 keywordsYEATS domain, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9im4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9im4__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9im4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)19.34 Å
Rg(电子密度)18.32 Å
总 Rg19.30 Å
原子数1252
残基数149
排除体积22147 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9im4__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 9im4__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (1)