← 返回搜索
9iol

Cryo-EM structure of the complex of DNA, Ku70/80, and laXLF.

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

X-ray repair cross-complementing protein 5

Homo sapiens

UniProt P13010

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 X-ray repair cross-complementing protein 6 × 1 （P12956） ;DNA (5'-D(P*CP*GP*CP*TP*GP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*CP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*CP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*GP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*CP*AP*GP*CP*G)-3') ; × 1 Peptide from Non-homologous end-joining factor 1 × 1 （Q9H9Q4） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1q2z 1rw2

共 2 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1jeq 1jey 3rz9 5y3r 6erf 6erf 6erf 6erf 6erg 6erg 6erh 6erh

共 67 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 XRCC5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–732； UniProt 1–732

X-ray repair cross-complementing protein 6

Homo sapiens

UniProt P12956

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 X-ray repair cross-complementing protein 5 × 1 （P13010） ;DNA (5'-D(P*CP*GP*CP*TP*GP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*CP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*CP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*GP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*CP*AP*GP*CP*G)-3') ; × 1 Peptide from Non-homologous end-joining factor 1 × 1 （Q9H9Q4） INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1jeq 1jey 3rzx 5y3r 6erf 6erf 6erf 6erf 6erg 6erg 6erh 6erh

共 63 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 XRCC6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–609； UniProt 1–609

Peptide from Non-homologous end-joining factor 1

物种未注明

UniProt Q9H9Q4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 X-ray repair cross-complementing protein 5 × 1 （P13010） X-ray repair cross-complementing protein 6 × 1 （P12956） ;DNA (5'-D(P*CP*GP*CP*TP*GP*CP*CP*GP*AP*TP*TP*CP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*CP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*GP*GP*TP*CP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*TP*CP*GP*GP*CP*AP*GP*CP*G)-3') ; × 1 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
2qm4 2qm4 2r9a 3sr2 3sr2 3w03

共 6 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3q4f 3q4f 3rwr 3sr2 6erg 6erg 6erh 6erh 7lsy 7lt3 7nfc 7nfe

共 26 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NHEJ1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–13； UniProt 287–299

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9iol
沉积日期 deposition_date2024-07-09
结构标题 titleCryo-EM structure of the complex of DNA, Ku70/80, and laXLF.
关键词 keywordsDNA repair, NHEJ, Complex, Lactylation, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9iol__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9iol__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9iol__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）35.76 Å
Rg（电子密度）35.65 Å
总 Rg35.96 Å
原子数9036
残基数1059
排除体积159480 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9iol__assembly_1__model_1 pentameric （5） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

▶

7. 引用文献 (1)