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Cryo-EM structure of human TRPV4 intracellular domain in complex with GTPase RhoA

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 96.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4

Homo sapiens

UniProt Q9HBA0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 148–787 链 C； UniProt 148–787 未记录 Transforming protein RhoA × 1 （P61586） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.16 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9IQY Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4DX1 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 149–397（249 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；0.35M sodium potassium phosphate, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.279
4DX1 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 149–397（249 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；0.35M sodium potassium phosphate, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.279
4DX2 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 149–397（249 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
未记录 BGC beta-D-glucopyranose × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；3.5% PEG4000, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.220
4DX2 Crystal structure of the human TRPV4 ankyrin repeat domain 提交 2012-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 149–397（249 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 149-397)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；3.5% PEG4000, 0.1M HEPES, 10% glycerol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.220
7AA5 Human TRPV4 structure in presence of 4a-PDD 提交 2020-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 148–787（640 aa）
链 B 148–787（640 aa）
链 C 148–787（640 aa）
链 D 148–787（640 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
分辨率 4.18 Å
8FC7 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK2798745 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XPW 1-({(5S,7S)-3-[5-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrazin-2-yl]-7-methyl-2-oxo-1-oxa-3-azaspiro[4.5]decan-7-yl}methyl)-1H-benzimidazole-6-carbonitrile × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8FC8 Cryo-EM structure of the human TRPV4 in complex with GSK1016790A 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XQ3 N-[(2S)-1-{4-[N-(2,4-dichlorobenzene-1-sulfonyl)-L-seryl]piperazin-1-yl}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
8FC9 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA, apo condition 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8FCA Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with 4alpha-Phorbol 12,13-didecanoate 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XS9 (1aR,1bS,4aS,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-9a-(decanoyloxy)-4a,7b-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-5-oxo-1a,1b,4,4a,5,7a,7b,8,9,9a-decahydro-1H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-9-yl decanoate × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8FCB Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK1016790A 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XQ3 N-[(2S)-1-{4-[N-(2,4-dichlorobenzene-1-sulfonyl)-L-seryl]piperazin-1-yl}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8JU5 Structure of human TRPV4 with antagonist A1 提交 2023-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 F3L 4-[(3~{S},4~{S})-4-(aminomethyl)-1-(5-chloranylpyridin-2-yl)sulfonyl-4-oxidanyl-pyrrolidin-3-yl]oxy-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8JU6 Structure of human TRPV4 with antagonist GSK279 提交 2023-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XPW 1-({(5S,7S)-3-[5-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrazin-2-yl]-7-methyl-2-oxo-1-oxa-3-azaspiro[4.5]decan-7-yl}methyl)-1H-benzimidazole-6-carbonitrile × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8JVI Structure of human TRPV4 with antagonist A2 提交 2023-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 F9M [6-[[4-(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino]pyridin-3-yl]-[(1~{S},5~{R})-3-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]methanone × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8JVJ Structure of human TRPV4 with antagonist A2 and RhoA 提交 2023-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 F9M [6-[[4-(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino]pyridin-3-yl]-[(1~{S},5~{R})-3-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]methanone × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8T1B Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in apo state 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 40 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8T1C Cryo-EM structure of human TRPV4 ankyrin repeat domain in complex with GTPase RhoA 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–871（871 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8T1D Open-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with agonist 4a-PDD 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 XS9 (1aR,1bS,4aS,7aS,7bS,8R,9R,9aS)-9a-(decanoyloxy)-4a,7b-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)-1,1,6,8-tetramethyl-5-oxo-1a,1b,4,4a,5,7a,7b,8,9,9a-decahydro-1H-cyclopropa[3,4]benzo[1,2-e]azulen-9-yl decanoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8T1E Closed-state cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in the presence of 4a-PDD 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 9ZR [(2~{R})-2-[(~{Z})-hexadec-9-enoyl]oxy-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] (~{Z})-docos-13-enoate × 32 YJ0 (2R)-2-{[(4-O-hexopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]methyl}-4-{[(25R)-5beta,14beta,17beta-spirostan-3beta-yl]oxy}butyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-beta-D-glucopyranoside × 8 NA SODIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8T1F Cryo-EM structure of full-length human TRPV4 in complex with antagonist HC-067047 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–871（871 aa）
链 B 1–871（871 aa）
链 C 1–871（871 aa）
链 D 1–871（871 aa）
未记录 X7N 2-methyl-1-[3-(morpholin-4-yl)propyl]-5-phenyl-N-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9IQX Cryo-EM structure of the human TRPV4-RhoA in complex with AH001 提交 2024-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 148–787（640 aa）
链 B 148–787（640 aa）
链 C 148–787（640 aa）
链 D 148–787（640 aa）
未记录 P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 2 U6L (1~{R})-1-(3-ethylphenyl)ethane-1,2-diol × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å

共 18 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRPV4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–640； UniProt 148–787 作者链 C； PDB构建体 1–640； UniProt 148–787

Transforming protein RhoA

Homo sapiens

UniProt P61586

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–193 未记录 Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4 × 2 （Q9HBA0） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.16 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9IQY Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A2B HUMAN RHOA COMPLEXED WITH GTP ANALOGUE 提交 1997-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：RESIDUES 1 - 181
突变：G14V, RESIDUES 1 - 181 WERE CLONED, THE N-TERMINUS CONTAINS A HIS-TAG MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；CRYSTALS WERE OBTAINED AT 277 K BY THE HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD FROM SOLUTIONS CONTAINING 10 MG/ML(PROTEIN,GTPGAMMAS,MG2+ MIXTURE), 10% PEG 8000,7.5% 14-DIOXANE, 50 MM TRIS-HCL PH 8.5, EQUILIBRATED AGAINST 20% PEG 8000,15% 14-DIOXANE, 100 MM TRIS-HCL PH 8.5, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.40 Å R-free 0.268
1CC0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHOA.GDP-RHOGDI COMPLEX 提交 1999-03-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION IN A SITTING DROP USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR. CRYSTALLIZATION OCCURED OVER A PERIOD OF SEVERAL DAYS AT 20 DEGREE CELSIUS. PROTEIN (15 MG/ML) WAS IN 25MM TRIS-HCL, PH=8.0, 100MM NACL, 5MM MGCL2. RESERVOIR CONTAINED: 51% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE, PH=5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 5.00 Å
1CC0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHOA.GDP-RHOGDI COMPLEX 提交 1999-03-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION IN A SITTING DROP USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR. CRYSTALLIZATION OCCURED OVER A PERIOD OF SEVERAL DAYS AT 20 DEGREE CELSIUS. PROTEIN (15 MG/ML) WAS IN 25MM TRIS-HCL, PH=8.0, 100MM NACL, 5MM MGCL2. RESERVOIR CONTAINED: 51% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE, PH=5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 5.00 Å
1CXZ CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN RHOA COMPLEXED WITH THE EFFECTOR DOMAIN OF THE PROTEIN KINASE PKN/PRK1 提交 1999-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：RESIDUES 1 - 181
突变：G14V MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.5；277 K；PEG 300, pH 6.5, MICROBATCH, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1DPF CRYSTAL STRUCTURE OF A MG-FREE FORM OF RHOA COMPLEXED WITH GDP 提交 1999-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–180（180 aa）
突变：G14V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG400, citrate, Lithium sulfate, magnesium chloride,, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
1FTN CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN RHOA/GDP COMPLEX 提交 1997-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa）
突变：F25N MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.304
1KMQ Crystal Structure of a Constitutively Activated RhoA Mutant (Q63L) 提交 2001-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–181（178 aa）
突变：Q63L, F25N MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.9；282 K；PEG 8000, HEPES, dioxane, magnesium chloride, 2-mercaptoethanol, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 282K
分辨率 1.55 Å R-free 0.190
1LB1 Crystal Structure of the Dbl and Pleckstrin homology domains of Dbs in complex with RhoA 提交 2002-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–190（190 aa） 片段：residues 1-190
突变：C190S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；292 K；PEG 3350, lithium citrate, Inositol 1,4,5-trisphosphate, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.81 Å R-free 0.266
1LB1 Crystal Structure of the Dbl and Pleckstrin homology domains of Dbs in complex with RhoA 提交 2002-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–190（190 aa） 片段：residues 1-190
突变：C190S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；292 K；PEG 3350, lithium citrate, Inositol 1,4,5-trisphosphate, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.81 Å R-free 0.266
1LB1 Crystal Structure of the Dbl and Pleckstrin homology domains of Dbs in complex with RhoA 提交 2002-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–190（190 aa） 片段：residues 1-190
突变：C190S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；292 K；PEG 3350, lithium citrate, Inositol 1,4,5-trisphosphate, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.81 Å R-free 0.266
1LB1 Crystal Structure of the Dbl and Pleckstrin homology domains of Dbs in complex with RhoA 提交 2002-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–190（190 aa） 片段：residues 1-190
突变：C190S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；292 K；PEG 3350, lithium citrate, Inositol 1,4,5-trisphosphate, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.81 Å R-free 0.266
1OW3 Crystal Structure of RhoA.GDP.MgF3-in Complex with RhoGAP 提交 2003-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–193（193 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；18% PEG2KMME, 100mM MES, 10mM MgCl2, 10mM NaF, 2mM deferoxamine, 114mM (NH4)2SO4, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.219
1S1C Crystal structure of the complex between the human RhoA and Rho-binding domain of human ROCKI 提交 2004-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–181（181 aa） 片段：RhoA
链 B 1–181（181 aa） 片段：RhoA
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；TRIS, PEG 3350, isopropyl alcohol, pH 7.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1TX4 RHO/RHOGAP/GDP(DOT)ALF4 COMPLEX 提交 1997-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–179（177 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 18% PEG 2000 MME 100MM MES PH6.0 10MM MGCL2, 3MM DTT, 3MM NAN3, 114MM AMMONIUM SULFATE 400UM PROTEIN COMPLEX WITH 1MM ALCL3 AND 10MM NAF.
分辨率 1.65 Å R-free 0.215
1X86 Crystal Structure of the DH/PH domains of Leukemia-associated RhoGEF in complex with RhoA 提交 2004-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–193（193 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG8K, sodium phosphate, sodium chloride, EDTA, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.22 Å R-free 0.279
1X86 Crystal Structure of the DH/PH domains of Leukemia-associated RhoGEF in complex with RhoA 提交 2004-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–193（193 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG8K, sodium phosphate, sodium chloride, EDTA, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.22 Å R-free 0.279
1X86 Crystal Structure of the DH/PH domains of Leukemia-associated RhoGEF in complex with RhoA 提交 2004-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–193（193 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG8K, sodium phosphate, sodium chloride, EDTA, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.22 Å R-free 0.279
1X86 Crystal Structure of the DH/PH domains of Leukemia-associated RhoGEF in complex with RhoA 提交 2004-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–193（193 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG8K, sodium phosphate, sodium chloride, EDTA, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.22 Å R-free 0.279
1XCG Crystal Structure of Human RhoA in complex with DH/PH fragment of PDZRHOGEF 提交 2004-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–180（178 aa） 片段：RhoA
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；PEG, Hepes, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.281
1XCG Crystal Structure of Human RhoA in complex with DH/PH fragment of PDZRHOGEF 提交 2004-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 3–180（178 aa） 片段：RhoA
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；PEG, Hepes, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.281
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–193（193 aa）
未记录 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.299
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–193（193 aa）
未记录 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.299
3KZ1 Crystal Structure of the Complex of PDZ-RhoGEF DH/PH domains with GTP-gamma-S Activated RhoA 提交 2009-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；14-16% PEG 10000, 0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
3KZ1 Crystal Structure of the Complex of PDZ-RhoGEF DH/PH domains with GTP-gamma-S Activated RhoA 提交 2009-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；14-16% PEG 10000, 0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.283
3LW8 Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex A) 提交 2010-02-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.233
3LW8 Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex A) 提交 2010-02-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.233
3LW8 Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex A) 提交 2010-02-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.233
3LW8 Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex A) 提交 2010-02-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.233
3LWN Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex B) 提交 2010-02-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350; protein was treated with EDTA prior to crystallization, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.28 Å R-free 0.291
3LWN Shigella IpgB2 in complex with human RhoA, GDP and Mg2+ (complex B) 提交 2010-02-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350; protein was treated with EDTA prior to crystallization, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.28 Å R-free 0.291
3LXR Shigella IpgB2 in complex with human RhoA and GDP (complex C) 提交 2010-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–181（180 aa） 片段：residues 2-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20% (w/v) PEG 3350; post-crystallization treatment: EDTA, LiSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.68 Å R-free 0.219
3MSX Crystal structure of RhoA.GDP.MgF3 in complex with GAP domain of ArhGAP20 提交 2010-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–180（180 aa）
突变：F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Crystallization drop was 1:1 mixture of protein dissolved in 20 mM Tris, pH 8.5, 100 mM NaCl, 5 mM NaF, 5 mM MgCl2, 5mM 2-mercaptoethanol and 20 w/v% PEG 8000, 0.2 M NaCl, 0.17 M NH4Cl, 0.1 M phosphate citrate buffer. The crystallization reservoir was 20 w/v% PEG 8000, 0.2 M NaCl, 0.17 M NH4Cl, 0.1 M phosphate citrate buffer, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.219
3T06 Crystal Structure of the DH/PH fragment of PDZRHOGEF with N-terminal regulatory elements in complex with Human RhoA 提交 2011-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–180（178 aa）
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.15 M DL-malic acid, 20 % w/v PEG 3350, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
分辨率 2.84 Å R-free 0.257
3T06 Crystal Structure of the DH/PH fragment of PDZRHOGEF with N-terminal regulatory elements in complex with Human RhoA 提交 2011-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 3–180（178 aa）
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.15 M DL-malic acid, 20 % w/v PEG 3350, pH 7.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
分辨率 2.84 Å R-free 0.257
4D0N AKAP13 (AKAP-Lbc) RhoGEF domain in complex with RhoA 提交 2014-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa） 片段：RESIDUES 1-184
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 25% (W/V) PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
4XH9 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN RHOA IN COMPLEX WITH DH/PH FRAGMENT OF THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR NET1 提交 2015-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–180（179 aa） 片段：UNP residues 2-180
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M bisTris propane pH7.5, 20% PEG3350, 0.2M Tripotassium phosphate
分辨率 2.00 Å R-free 0.217
4XH9 CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN RHOA IN COMPLEX WITH DH/PH FRAGMENT OF THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE FACTOR NET1 提交 2015-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–180（179 aa） 片段：UNP residues 2-180
突变：F25N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M bisTris propane pH7.5, 20% PEG3350, 0.2M Tripotassium phosphate
分辨率 2.00 Å R-free 0.217
4XOI Structure of hsAnillin bound with RhoA(Q63L) at 2.1 Angstroms resolution 提交 2015-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–180（180 aa） 片段：UNP residues 1-180
突变：Q63L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；12% PEG 3,350, 3% PEG 10000, 0.2 M sodium malonate, 5 mM DTT
分辨率 2.09 Å R-free 0.206
4XOI Structure of hsAnillin bound with RhoA(Q63L) at 2.1 Angstroms resolution 提交 2015-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–180（180 aa） 片段：UNP residues 1-180
突变：Q63L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；12% PEG 3,350, 3% PEG 10000, 0.2 M sodium malonate, 5 mM DTT
分辨率 2.09 Å R-free 0.206
4XSG The complex structure of C3cer exoenzyme and GTP bound RhoA (NADH-free state) 提交 2015-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–179（179 aa） 片段：UNP residues 1-179
突变：F25N GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES (pH 6.4), 20% PEG1500
分辨率 1.80 Å R-free 0.223
4XSH The complex structure of C3cer exoenzyme and GTP bound RhoA (NADH-bound state) 提交 2015-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–179（179 aa） 片段：UNP residues 1-179
突变：F25N GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES (pH 6.4), 20% PEG1500
分辨率 2.50 Å R-free 0.254
5A0F Crystal structure of Yersinia Afp18-modified RhoA 提交 2015-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：RESIDUES 1-181
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M SODIUM ACETATE, PH 5 AND 1.5 M AMMONIUM SULFATE; SITTING-DROP VAPOR-DIFFUSION AT 293.15 K
分辨率 2.00 Å R-free 0.213
5BWM The complex structure of C3cer exoenzyme and GDP bound RhoA (NADH-bound state) 提交 2015-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–179（179 aa） 片段：UNP residues 1-179
突变：F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES (pH 6.4), 20% PEG1500
分辨率 2.50 Å R-free 0.246
5C2K Crystal structure of the fusion protein linked by RhoA and the GAP domain of MgcRacGAP 提交 2015-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa） 片段：GAP domain, UNP residues 346-546
突变：S249D MG MAGNESIUM ION × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；PEG3350, Bis-Tris
分辨率 1.42 Å R-free 0.206
5C4M RhoA GDP with novel switch II conformation 提交 2015-06-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa）
突变：F25N MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；24% (w/v) PEG 3350, 0.3 NaCl
分辨率 1.30 Å R-free 0.200
5EZ6 Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of a small GTPase RhoA 提交 2015-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–181（181 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-181
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium citrate dibasic, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
5FR1 Double acetylated RhoGDI-alpha in complex with RhoA-GDP 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；4 M SODIUM FORMATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.256
5FR2 Farnesylated RhoA-GDP in complex with RhoGDI-alpha, lysine acetylated at K178 提交 2015-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–193（193 aa）
未记录 FAR FARNESYL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M LITHIUMSULFATE 0.1 M BIS-TRIS PH5.5 25% PEG3350 30% DEXTROSE
分辨率 3.35 Å R-free 0.258
5HPY Crystal Structure of RhoA.GDP.MgF3-in complex with human Myosin 9b RhoGAP domain 提交 2016-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–181（179 aa） 片段：UNP residues 3-181
突变：F25N MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M sodium malonate pH 7.0.
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
5HPY Crystal Structure of RhoA.GDP.MgF3-in complex with human Myosin 9b RhoGAP domain 提交 2016-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 3–181（179 aa） 片段：UNP residues 3-181
突变：F25N MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M sodium malonate pH 7.0.
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
5IRC p190A GAP domain complex with RhoA 提交 2016-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–181（180 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；30% PEG 2000MME 150mM KCSN 100mM MES, pH 6.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.213
5IRC p190A GAP domain complex with RhoA 提交 2016-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–181（180 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；30% PEG 2000MME 150mM KCSN 100mM MES, pH 6.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.213
5IRC p190A GAP domain complex with RhoA 提交 2016-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 2–181（180 aa）
链 F 2–181（180 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；30% PEG 2000MME 150mM KCSN 100mM MES, pH 6.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.213
5JCP RhoGAP domain of ARAP3 in complex with RhoA in the transition state 提交 2016-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–181（180 aa） 片段：UNP residues 906-1107,UNP residues 2-181
突变：F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100 mM MES, 15%(v/v) PEG 550 MME, 4%(v/v) Acetone
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
5JCP RhoGAP domain of ARAP3 in complex with RhoA in the transition state 提交 2016-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–181（180 aa） 片段：UNP residues 906-1107,UNP residues 2-181
突变：F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；100 mM MES, 15%(v/v) PEG 550 MME, 4%(v/v) Acetone
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
5JHG Crystal structure of the complex between the human RhoA and the DH/PH domain of human ARHGEF11 提交 2016-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；2% v/v Tacsimate pH 5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 16% PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
5JHG Crystal structure of the complex between the human RhoA and the DH/PH domain of human ARHGEF11 提交 2016-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；2% v/v Tacsimate pH 5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 16% PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
5JHH Crystal structure of the ternary complex between the human RhoA, its inhibitor and the DH/PH domain of human ARHGEF11 提交 2016-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 GOL GLYCEROL × 2 RA0 3-{3-[ethyl(quinolin-2-yl)amino]phenyl}propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；2% v/v Tacsimate pH 5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 16% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
5JHH Crystal structure of the ternary complex between the human RhoA, its inhibitor and the DH/PH domain of human ARHGEF11 提交 2016-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa） 片段：UNP residues 1-181
未记录 GOL GLYCEROL × 1 RA0 3-{3-[ethyl(quinolin-2-yl)amino]phenyl}propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；2% v/v Tacsimate pH 5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 16% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
5M6X Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginine finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.MgF3- human 提交 2016-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–193（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；293 K；100 mM Bis Tris pH 5.5-6.5 20-25% (w/v) PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.272
5M6X Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginine finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.MgF3- human 提交 2016-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 2–193（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；293 K；100 mM Bis Tris pH 5.5-6.5 20-25% (w/v) PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.272
5M70 Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginin finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.AlF4- human 提交 2016-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–193（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；293 K；100 mM Bis/Tris pH 5.8-6 PEG3350 23-26%
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
5M70 Crystal Structure of human RhoGAP mutated in its arginin finger (R85A) in complex with RhoA.GDP.AlF4- human 提交 2016-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 2–193（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；293 K；100 mM Bis/Tris pH 5.8-6 PEG3350 23-26%
分辨率 2.20 Å R-free 0.277
5ZHX Crystal structure of SmgGDS-558 and farnesylated RhoA complex 提交 2018-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 e 1–193（193 aa）
突变：L193A FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.2M Sodium malonate, 20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
5ZHX Crystal structure of SmgGDS-558 and farnesylated RhoA complex 提交 2018-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 f 1–193（193 aa）
突变：L193A FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.2M Sodium malonate, 20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
5ZHX Crystal structure of SmgGDS-558 and farnesylated RhoA complex 提交 2018-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 g 1–193（193 aa）
突变：L193A FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.2M Sodium malonate, 20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
5ZHX Crystal structure of SmgGDS-558 and farnesylated RhoA complex 提交 2018-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 h 1–193（193 aa）
突变：L193A FAR FARNESYL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283 K；0.2M Sodium malonate, 20% PEG 3350
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
6BC0 A Complex between PH Domain of p190RhoGEF and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-24% PEG 3350, 100mM TrisCl, 200mM NaCl
分辨率 2.20 Å R-free 0.281
6BCA A Complex between PH Domain of LbcRhoGEF (AKAP-Lbc) and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；24-26% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, 200mM ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
6BCA A Complex between PH Domain of LbcRhoGEF (AKAP-Lbc) and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；24-26% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, 200mM ammonium sulfate
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
6BCB A Complex between PH Domain of p114RhoGEF and Activated RhoA Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22-24% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, 200mM NaCl
分辨率 1.40 Å R-free 0.165
6KX2 Crystal structure of GDP bound RhoA protein 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：C16V, C20S, C83V, C159T GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；289 K；10 mg/mL mutant, 0.2M NaCl; 0.1M acetate Na (pH 4.5) and 1.26M ammonium sulfate
分辨率 1.45 Å R-free 0.210
6KX3 Crystal structure of RhoA protein with covalent inhibitor DC-Rhoin 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：C16V, C20S, C83V, C159T GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 8ZO prop-2-enyl (3R)-1,1-bis(oxidanylidene)-2,3-dihydro-1-benzothiophene-3-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；289 K；10 mg/mL mutant, 0.2M NaCl, 0.1M acetate Na (pH 4.5), 1.26M ammonium sulfate
分辨率 1.98 Å R-free 0.268
6R3V Crystal Structure of RhoA-GDP-Pi in Complex with RhoGAP 提交 2019-03-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–193（193 aa）
突变：YES [F25N] PO4 PHOSPHATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Equal amounts of reservoir solution containing 18% PEG2000 MME, 100 mM MES, pH 6.0, 10 mM MgCl2, 3 mM DTT, 3 mM NaN3, 120 mM ammonium sulphate and stock solution of the RhoA/RhoGAP protein complex at 800 mM in 20 mM Tris.HCl, pH 7.4, with 2 mM AlCl3, 10 mM MgCl2, and 20 mM NaF.
分辨率 1.75 Å R-free 0.207
6V6M Crystal structure of an inactive state of GMPPNP-bound RhoA 提交 2019-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：F25N GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；20-24% PEG8K, 15% Dioxane, 0.1M Tris pH8.0
分辨率 1.39 Å R-free 0.236
6V6U Crystal structure of RhoA-GDP with novel Switch I conformation 提交 2019-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：C-terminal trancated at residue 181
突变：F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；20-24% PEG8K, 15% Dioxane, 0.1M Tris pH8.0
分辨率 1.16 Å R-free 0.185
6V6V Crystal structure of oncogenic RhoA mutant G14V complexed with GDP 提交 2019-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：C-terminal trancated at residue 181
突变：G14V, F25N GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；20-24% PEG8K, 15% Dioxane, 0.1M Tris pH8.0
分辨率 1.40 Å R-free 0.223
7G80 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1041785508 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 K34 5-(1,3-thiazol-2-yl)-1H-1,2,4-triazole × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.67 Å R-free 0.230
7G81 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z104474512 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 H04 1-(2-ethoxyphenyl)piperazine × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.51 Å R-free 0.216
7G82 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1079512010 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 UWS 6-methyl-2-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)methyl]pyridazin-3(2H)-one × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.41 Å R-free 0.209
7G83 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z108545814 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YX2 3-propanamido-1-benzofuran-2-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.31 Å R-free 0.205
7G84 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1102357527 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YX6 N-[(3R)-6-oxopiperidin-3-yl]-1,3-thiazole-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.81 Å R-free 0.232
7G85 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z111529496 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 LXA ~{N}-(1~{H}-benzimidazol-2-ylmethyl)-2-methoxy-ethanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.74 Å R-free 0.223
7G86 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1137725943 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YXB N-[(1H-indol-4-yl)methyl]ethanamine × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
7G87 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1148165337 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YG5 2-(1H-indazol-1-yl)-N,N-dimethylacetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.05 Å R-free 0.241
7G88 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1148747945 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 WKY N-(3-methylpyridin-4-yl)acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.87 Å R-free 0.244
7G89 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1192341021 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZT7 1-(5-amino-2H-isoindol-2-yl)ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
7G8A ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z100642432 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 WJ7 2-bromo-4-fluoro-N,N-dimethylbenzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.50 Å R-free 0.211
7G8B ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z100643660 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 LFO N,1-dimethyl-1H-indole-3-carboxamide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.42 Å R-free 0.216
7G8C ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1037511924 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YXO 1-(difluoromethyl)-1H-indol-5-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.18 Å R-free 0.255
7G8D ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z104474228 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 12 60P 3-methylthiophene-2-carboxylic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.94 Å R-free 0.236
7G8E ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z104479710 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 12 YXH 1-(1H-benzimidazol-2-yl)methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.79 Å R-free 0.223
7G8F ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1079168976 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YXK [1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-imidazol-2-yl]acetonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.42 Å R-free 0.215
7G8G ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z111529496 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 LXA ~{N}-(1~{H}-benzimidazol-2-ylmethyl)-2-methoxy-ethanamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.92 Å R-free 0.251
7G8H ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1198180782 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YXU 5-methoxy-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 8 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.67 Å R-free 0.218
7G8I ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1198316457 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YXY 4,4-difluorocyclohexane-1-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.47 Å R-free 0.273
7G8J ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1216861874 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YYI 5-(difluoromethoxy)pyridin-2(3H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.99 Å R-free 0.281
7G8K ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1217131798 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 YZK (3M)-3-(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)pyridine × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.49 Å R-free 0.216
7G8L ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1251207602 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 RWS 1-(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)piperidine × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.60 Å R-free 0.229
7G8M ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1255459547 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z0I N-(1H-indol-7-yl)acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.03 Å R-free 0.260
7G8N ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1262549981 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z1L 1-anilinocyclopropane-1-carboxylic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.32 Å R-free 0.283
7G8O ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1267800292 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 O2A N-methyl-1H-indole-7-carboxamide × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.58 Å R-free 0.230
7G8P ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1269184613 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z2F 1,3-benzothiazole-6-sulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.21 Å R-free 0.324
7G8Q ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1269220427 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z2Z 8-(methanesulfonyl)quinoline × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.56 Å R-free 0.207
7G8R ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1270087714 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z5Z (2R,6S)-2,6-dimethyl-4-(3-methyl-1,2,4-thiadiazol-5-yl)morpholine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.44 Å R-free 0.207
7G8S ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1270393711 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z5C 5-(methoxymethyl)-1,2-oxazole-3-carboxamide × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.60 Å R-free 0.222
7G8T ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1273312142 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 14 Z4X 2-ethoxy-3-fluoro-N,N-dimethylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.39 Å R-free 0.198
7G8U ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z131833926 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 6 Z3O (3S)-3-{[(4R)-4-methyl-3,4-dihydropyridin-1(2H)-yl]methyl}-3H-indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.44 Å R-free 0.294
7G8V ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z133716556 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z3H N-[(4R)-3,4-dihydro-2H-1-benzopyran-4-yl]methanesulfonamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.45 Å R-free 0.219
7G8W ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1416193393 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z6I 4-(5-methyl-1H-pyrazol-4-yl)piperidine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.94 Å R-free 0.250
7G8X ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1416571195 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 Z7T 2-(cyclopentylamino)pyridine-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.71 Å R-free 0.227
7G8Y ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1449748885 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 WZY N-(4-methoxyphenyl)glycinamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.75 Å R-free 0.222
7G8Z ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1493056027 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 FMT FORMIC ACID × 14 Z9I 1-[(2R)-1-(methanesulfonyl)pyrrolidin-2-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.51 Å R-free 0.221
7G90 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1509195674 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZA9 4-[(3S)-piperidin-3-yl]-1H-indole × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.91 Å R-free 0.249
7G91 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1509257513 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZBH (4S)-N,2-dimethyl-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazole-4-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.29 Å R-free 0.253
7G92 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1545313172 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 LWA (2~{S})-~{N}-(4-aminocarbonylphenyl)oxolane-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.87 Å R-free 0.237
7G93 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1565771450 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 VW7 N-(8-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-5-yl)acetamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.69 Å R-free 0.225
7G94 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1575337975 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZC9 (2P)-5-fluoro-2-(1H-pyrazol-5-yl)pyridine × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.47 Å R-free 0.224
7G95 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z165170770 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 W0Y N-methyl-4-sulfamoylbenzamide × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.55 Å R-free 0.218
7G96 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z1203730981 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZCI 2-bromo-1H-imidazole × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
7G97 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z57899718 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 APY 2-AMINOMETHYL-PYRIDINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
7G98 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with Z4605084898 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 FMT FORMIC ACID × 4 ZDL 1,3-dimethylimidazolidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.88 Å R-free 0.295
7G99 ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102102-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZE9 1-[(3R,5R)-5-(furan-2-yl)-3-(5-methylfuran-2-yl)pyrazolidin-1-yl]ethan-1-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.78 Å R-free 0.237
7G9A ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102113-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 FMT FORMIC ACID × 11 ZEK 3-acetamido-N-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.58 Å R-free 0.295
7G9B ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102116-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 FMT FORMIC ACID × 7 ZG0 N-(3-methylphenyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.55 Å R-free 0.298
7G9C ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102141-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 8 ZFI N-[2-(methanesulfonyl)phenyl]acetamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.69 Å R-free 0.274
7G9D ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102179-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 FMT FORMIC ACID × 9 T7Y N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.66 Å R-free 0.286
7G9E ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102197-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 10 ZG6 N-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.15 Å R-free 0.292
7G9F ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102209-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 10 ZGF N-(6-chloro-2H-1,3-benzodioxol-5-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.94 Å R-free 0.260
7G9G ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102236-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 FMT FORMIC ACID × 11 ZGK N-(2-methoxyphenyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.08 Å R-free 0.286
7G9H ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102245-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 FMT FORMIC ACID × 7 KLU (2S)-4-(chloroacetyl)-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.75 Å R-free 0.274
7G9I ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102253-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZGQ N-[(2-methylphenyl)methyl]acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
7G9J ARHGEF2 PanDDA analysis group deposition -- ARHGEF2 and RhoA in complex with PCM-0102281-001 提交 2023-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 ZGX 1-(3,4-dihydropyrazin-1(2H)-yl)ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 2.6M sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.245
7QSC GTPase IN COMPLEX WITH GDP.MGF3- 提交 2022-01-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–193（192 aa）
链 D 2–193（192 aa）
突变：Y34(F3Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y34(F3Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；Protein stock of RhoA-Y34F3Y 0.7 mM, RhoGAP-R85A 0.7 mM in a buffer of BisTris-HCl, pH 6.0, NaCl 150 mM, MgCl2 5 mM, NaF 10 mM, DTT 1 mM mixed 1:1.2 ratio with the precipitant solution of 0.1 M BisTris-HCl, pH 5.8, PEG3350 26% (w/v).
分辨率 1.91 Å R-free 0.294
7QTM Transition state analogue of small G protein in complex with relevant GAP 提交 2022-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–193（192 aa）
链 I 2–193（192 aa）
突变：Y34(F2Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y34(F2Y) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；A 1:1 ratio of protein buffer (RhoA 0.7 mM, RhoGAP-R85A 0.7 M, BisTris-HCl pH = 6.0, NaCl 150 mM, MgCl2 5 mM, NaF 10 mM, DTT 1 mM) to precipitant (0.1 M BisTris-HCl pH = 5.8, PEG3350 25% (w/v)) was used
分辨率 2.25 Å R-free 0.304
7WZA An open conformation Form 1 of switch II for RhoA 提交 2022-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：C16V,C20S,C83V,C159T GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；20% PEG 3350, 0.2M potassium formate
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
7WZC An open conformation Form2 of switch II for RhoA GDP-bound state 提交 2022-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa） 片段：C16V,C20S,C83V,C159T
未记录 GOL GLYCEROL × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1M MES, pH6.0, 30% PEG 600, 5% PEG 1000, 10% glycerol
分辨率 1.80 Å R-free 0.264
8BNT The DH domain of ARHGEF2 bound to RhoA 提交 2022-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 FMT FORMIC ACID × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；2.6 M sodium formate, 100 mM Tris
分辨率 1.40 Å R-free 0.175
8FC7 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK2798745 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–193（193 aa）
链 F 1–193（193 aa）
链 G 1–193（193 aa）
链 H 1–193（193 aa）
未记录 XPW 1-({(5S,7S)-3-[5-(2-hydroxypropan-2-yl)pyrazin-2-yl]-7-methyl-2-oxo-1-oxa-3-azaspiro[4.5]decan-7-yl}methyl)-1H-benzimidazole-6-carbonitrile × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8FC9 Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA, apo condition 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–193（193 aa）
链 F 1–193（193 aa）
链 G 1–193（193 aa）
链 H 1–193（193 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
8FCB Cryo-EM structure of the human TRPV4 - RhoA in complex with GSK1016790A 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–193（193 aa）
链 F 1–193（193 aa）
链 G 1–193（193 aa）
链 H 1–193（193 aa）
未记录 XQ3 N-[(2S)-1-{4-[N-(2,4-dichlorobenzene-1-sulfonyl)-L-seryl]piperazin-1-yl}-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-1-benzothiophene-2-carboxamide × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 4 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
8FPW Crystal structure of tumor related RhoA mutant A161V in complex with GDP 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：F25N, A161V GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20-24% PEG8K, 15% Dioxane, 0.1M Tris pH8.0
分辨率 1.40 Å R-free 0.208
8FPX Crystal structure of tumor related RhoA mutant A161P in complex with GDP 提交 2023-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：F25N, A161P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20-24% PEG8K, 15% Dioxane, 0.1M Tris pH8.0
分辨率 1.47 Å R-free 0.225
8GI3 Crystal structure of RhoA mutant L69P complexed with GDP 提交 2023-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa）
突变：L69P GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.1；293.2 K；0.2 M Ammonium citrate dibasic (pH 5.1), 20% PEG3350
分辨率 1.52 Å R-free 0.209
8GI6 Crystal structure of RhoA mutant L69R complexed with GDP 提交 2023-03-13 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa）
突变：L69R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 5.7；293.15 K；0.1 M Na acetate (pH 5.7), 0.5 mM Na citrate, 26% PEG4000, 5% glycerol
分辨率 1.40 Å R-free 0.182
8JVJ Structure of human TRPV4 with antagonist A2 and RhoA 提交 2023-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–193（193 aa）
链 F 1–193（193 aa）
链 G 1–193（193 aa）
链 H 1–193（193 aa）
未记录 F9M [6-[[4-(2,4-dimethyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,3-thiazol-2-yl]amino]pyridin-3-yl]-[(1~{S},5~{R})-3-[5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]methanone × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8T1C Cryo-EM structure of human TRPV4 ankyrin repeat domain in complex with GTPase RhoA 提交 2023-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8ZNY Small GTPase RhoA Y42C mutant in complex with GDP 提交 2024-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：Y42C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Ammonium acetate, o.1 M Sodium acetate trihydrate (pH 4.6), 30% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.217
8ZO0 Samll GTPase RhoA Y42C mutant in complex with GTP analogue 提交 2024-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：Y42C GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), 25% PEG3350
分辨率 2.21 Å R-free 0.240
9AX5 Cryo-EM structure of Phospholipase C epsilon PH-C terminus in complex with RhoA-GTP 提交 2024-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–193（192 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9IQX Cryo-EM structure of the human TRPV4-RhoA in complex with AH001 提交 2024-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–193（193 aa）
链 F 1–193（193 aa）
未记录 P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 2 U6L (1~{R})-1-(3-ethylphenyl)ethane-1,2-diol × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9J0G Crystal structure of RhoA-TP1001 complex 提交 2024-08-02 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；0.5 M Lithium sulfate monohydrate,0.1 M HEPES pH 7.5,30% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.10 Å R-free 0.354
9J0G Crystal structure of RhoA-TP1001 complex 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；0.5 M Lithium sulfate monohydrate,0.1 M HEPES pH 7.5,30% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.10 Å R-free 0.354
9J0G Crystal structure of RhoA-TP1001 complex 提交 2024-08-02 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；0.5 M Lithium sulfate monohydrate,0.1 M HEPES pH 7.5,30% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.10 Å R-free 0.354
9J0G Crystal structure of RhoA-TP1001 complex 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–193（193 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 U6L (1~{R})-1-(3-ethylphenyl)ethane-1,2-diol × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；0.5 M Lithium sulfate monohydrate,0.1 M HEPES pH 7.5,30% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 3.10 Å R-free 0.354
9N4A Wild-type RhoA GTPase bound to GppNHp 提交 2025-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.18 K；2 uL protein (10 mg/mL RhoA-GppNHp, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 25% dioxane, 17% PEG 8000, and 100 mM HEPES pH 6.9
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
9N4A Wild-type RhoA GTPase bound to GppNHp 提交 2025-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.18 K；2 uL protein (10 mg/mL RhoA-GppNHp, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 25% dioxane, 17% PEG 8000, and 100 mM HEPES pH 6.9
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
9N4B RhoA GTPase R70A bound to GTPgammaS 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–181（179 aa）
突变：R70A MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；2 uL protein (8 mg/mL RhoA R70A bound to GTPgammaS in 25 mM Tris-HCl pH8.0, 2 mM MgCl2, and 10 mM BME) + 2 uL crystallization reagent sitting above 500 uL crystallization reagent. Crystallization reagent: 250 mM ammonium sulfate, 1.50 M lithium sulfate, and 100 mM sodium citrate pH 5.6
分辨率 3.00 Å R-free 0.247
9N4C RhoA GTPase E102A bound to GTPgammaS 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：E102A GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；2 uL protein (8 mg/mL RhoA E102A bound to GTPgammaS, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 0.2 M Ammonium iodide, 20% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
9N4C RhoA GTPase E102A bound to GTPgammaS 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–181（181 aa）
突变：E102A GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 9 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；2 uL protein (8 mg/mL RhoA E102A bound to GTPgammaS, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 0.2 M Ammonium iodide, 20% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
9N4C RhoA GTPase E102A bound to GTPgammaS 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–181（181 aa）
突变：E102A GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 IOD IODIDE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；2 uL protein (8 mg/mL RhoA E102A bound to GTPgammaS, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 0.2 M Ammonium iodide, 20% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
9N4C RhoA GTPase E102A bound to GTPgammaS 提交 2025-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–181（181 aa）
突变：E102A GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IOD IODIDE ION × 12 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；2 uL protein (8 mg/mL RhoA E102A bound to GTPgammaS, 25 mM Tris-HCl pH 8.0, 2 mM MgCl2, 10 mM BME) + 2 uL of crystallization solution over 500 uL reservoir of crystallization solution. Crystallization solution: 0.2 M Ammonium iodide, 20% PEG 3,350
分辨率 2.30 Å R-free 0.220
9VNG Small GTPase RhoA Y42C mutant in complex with covalent inhibitor 提交 2025-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：Y42C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 A1D9L 4-(2-nitroethyl)-1~{H}-indole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；289.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 1.43 Å R-free 0.221
9VNH Structure of wild-type RhoA in complex with GDP and magnesium ion 提交 2025-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289.15 K；0.2 M Ammonium chloride, 0.01 M Calcium chloride dihydrate, 0.05 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 1.79 Å R-free 0.231
9VNI Structure of the RhoA Y42C mutant featuring Thr37 coordination of magnesium ion 提交 2025-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–181（181 aa）
突变：Y42C GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.0, 22% w/v Polyethylene glycol 6000
分辨率 1.83 Å R-free 0.247

共 129 个其他 PDB 条目、165 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RHOA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9iqy

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9iqy
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9iqy
沉积日期 deposition_date2024-07-13
结构标题 titleCryo-EM structure of human TRPV4 intracellular domain in complex with GTPase RhoA
关键词 keywordsComplex, MEMBRANE PROTEIN, Hydrolase; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier29.86 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.19 Å
零角强度 I(0) i072836600.00
分子量 molecular_weight66637.0 kDa
排除体积 excluded_volume83361 ų
包络体积 envelope_volume108550 ų
水化壳体积 shell_volume32018 ų
包络直径 envelope_diameter107.9 Å
壳层 Rg shell_rg35.11 Å
包络 Rg envelope_rg29.45 Å
形状 Rg shape_rg29.19 Å
总 Rg total_rg29.78 Å
总原子数 total_atoms4685
残基数 n_residues589
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax96.8 Å
Rg (实空间) rg_real29.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.89 Å
I(0) (实空间) i0_real7.2840e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1820e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal29.83 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal72840000.0000
解质量估计 total_estimate0.8217
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary36.5 Å
偏度 Skewness skewness0.208
峰度 Kurtosis kurtosis-0.596
角度范围 angular_range— – 0.2650 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha22080000.0000
实空间数据点数 n_real_points54
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.899; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)