9iz2

Focus refinement dmCTPS bound with dATP dUTP dGTP and DON

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 80.0 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9iz2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9iz2
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9iz2
沉积日期 deposition_date2024-07-31
最后修订 last_revision2024-11-27
结构标题 titleFocus refinement dmCTPS bound with dATP dUTP dGTP and DON
关键词 keywordsCTPS, filament, inhibitor, substrates, intermediate, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier26.88
回转半径 Rg (电子) rg_electron25.92
零角强度 I(0) i095168500.00
分子量 molecular_weight75273.0 kDa
排除体积 excluded_volume93885 ų
包络体积 envelope_volume113290 ų
水化壳体积 shell_volume35272 ų
包络直径 envelope_diameter82.2
壳层 Rg shell_rg34.36
包络 Rg envelope_rg26.06
形状 Rg shape_rg25.93
总 Rg total_rg26.76
总原子数 total_atoms5274
残基数 n_residues657
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax80.0
Rg (实空间) rg_real26.74
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.46
I(0) (实空间) i0_real9.5170e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4680e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal26.79
I(0) (倒空间) i0_reciprocal95170000.0000
解质量估计 total_estimate0.9084
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.5
偏度 Skewness skewness0.181
峰度 Kurtosis kurtosis-0.517
角度范围 angular_range— – 0.2950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha15950000.0000
实空间数据点数 n_real_points60
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.965; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.919

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (6)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)