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Structural insights into the PSI-FCPI supercomplex from the coccolithophore Emiliania huxleyi

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 267.2 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id	9jj8
沉积日期 deposition_date	2024-09-13
结构标题 title	Structural insights into the PSI-FCPI supercomplex from the coccolithophore Emiliania huxleyi
关键词 keywords	PSI-FCPI supercomplex, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	101.80 Å
零角强度 I(0) i0	48945200000.00
分子量 molecular_weight	1483500.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1560000 Å³
包络体积 envelope_volume	3085600 Å³
水化壳体积 shell_volume	247000 Å³
包络直径 envelope_diameter	325.3 Å
壳层 Rg shell_rg	86.67 Å
包络 Rg envelope_rg	103.30 Å
形状 Rg shape_rg	101.80 Å
总 Rg total_rg	101.80 Å
总原子数 total_atoms	114135
残基数 n_residues	9888
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	267.2 Å
Rg (实空间) rg_real	98.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.86 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.7030e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0270e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal	99.69 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	48540000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9150
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	106.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.180
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.767
角度范围 angular_range	— – 0.0750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.7452
最高正则化参数 α highest_alpha	1127000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	16
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.995; Stabil: 0.974; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.000

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合体信息 (52)

Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83647.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a
原子数 atom_count	114135

MKVGSKELEASKVRVIVDKDPVATSFEKWAQPGHFSRTLAKGPKTTTWIWNLHADAHDFDSQTSSLEDISRKIFSAHFGQLAIIFLWVSQAYFHGARFSNYSAWLLNPTSIKPSAQVVWPVVGQEILNGDVGGGFSGVQITSGVFQMWRASGITNETELYWTAMGGLMMSALMVFAGWFHYHKAAPKLEWFQNVESMMNHHLAGLLGLGCLSWSGHQIHISLPINKLLDAGVAPQEIPLPHELLFNQDLMAQLYPSFKKGLLPFFTLNWGEYSDFLTFKGGLNPITGSLWLSDTAHHHLALAVLFIFAGHMYRTNWGIGHSMKEILEAHKGPLTGEGHKGLYEILTTSWHAQLAINLAMMGSLSIIVAHHMYAMPPYPYIAVDYPTQLSLFTHHMWIGGFCVCGAAAHGAIFMVRDYSPVQSYNNLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGTHSFGLYIHNDTMRALGRPQDMFSDKAIQLQPIFAKWVQSLHTLAPGNTAPNSLATASYAFGGDVVAVNGKIAMMPIQLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHIFLGLFWMYNCISVVIFHFSWKMQSDVWGTISEKGKITHITGGNFANSALTINGWLRDFLWSQASQVIQSYGSALSAYGIIFLGAHFIWAFSLMFLFSGRGYWQELIESVVWAHNKLKLAPAIQPRALSITQGRAVGLAHYLLGGIGTTWSFFLARIISVG

Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82101.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MATKFPKFSQALAQDPATRRIWYGIATAHDLESHDGMTEENLYQKIFASHFGHLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFQQWVLNPLKVKPIAHAIWDPHFGQSAIKAFTRGGVSYPVNIATSGVYHWWYTVGMRTNEDLYFGALGLLVLSTTLLFAGWLHLQPKFRPGIAWFKNNESRLNHHLSGLFGVSSLAWSGHLIHVAIPESRGQHIRWNNFTSTLPHPEGLTPFFTGNWGLYAENPDTAQHIFGTSEGAGTAILTFLGGFHPQTQSMWLTDIAHHHLAIAVVFIFAGHMYRTNWGIGHSMKEILDAHVPPKGRLGAGHRGLFETITDSLHMQLGLALASLGVATSLVAQHMYALPSYAFMAKDYVTQAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFFVRDYDPEVNKDNVLARMLQHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYIHNDVCVAFGTPEKQILFEPVFAQFIQAASGKALYGFDVLLSSSTSAASVASSKIWLPGWMEAINSGKNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLAMFWMLNTISWVTFYWHWKHLTVWGGNAAAFNESSTYIMGWLRDYLWLNSSPLINGYNAFGMNAQAVWAWMFLFGHLIWATGFMFLISWRGYWQELIETLVWAHERTPIANLVKWRDKPVALSIVQARLVGLAHFTVGFIFTFAPFVIASTTGKFA

Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8809.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MSHSVRVYDTCIGCTQCVRACPCDVLEMVPWDGCKAGQIASAPRAEDCIGCKRCETACPTDFLSVRVYLGSETTRSLGLTY

Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15898.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MTSDVLNLQIPTPTFGGSTGGWLRAAEIEEKYAITWTSKKEQIFEMPTSGAAIMQKGENLLYLAKKEQCLALSTQLRTLFKISDYKIYRIFPNSEVQYLHPKDGVFPEKLNEGRIGVGNVGYSIGKNPNPVNVKFTGKNTFD

Entity 5 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	13523.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MRSALLLALAAPAAALAPGSMLSSSRVVCRGGAPDMIERGSKVRVLRPESYWFQECGSVATIAKGGDRYPVVVRFEKVNYPGVAPNNFALDELGEVEAPAKKKAAKAAPAAKEGAPAAKAAPAAKEVAAKK

Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	20000.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

MKVLLNWLLVASLFAASPKAAFADVSGLTPCKDSAVFKKRLDGSVKKLQARLANYTEGTPAYLALEQQIDQTKARFAKYGDKGLLCGADGLPHLIADGRPDHAGEFVIPAFGFLYIAGWIGWAGRSYLQFSKKTDKPNENEIIINVPVALGMMSGAFLWPLAAWKELINGQLLVPGDEVTVSPR

Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3971.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

MSASFLPSILTPVVTLVFPGLMFALFFVLIEQEEIA

Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4539.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

MSKDLLKYLSTAPVLLTAWMSLTAGMIIEIQRFFPDSLSF

Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	15488.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	l

MSEFVKPYNNDPFVGNLSTPVTTSTATKLYLGNLPIYRKGLSPLLRGLEIGMAHGYFLIGPFYILGPLRNSPNALLVGLFSAFGLILILTLGLTIYGLASFQGTEGGENLESAKGWRNFTSGFSIGAFGGASVAYVLLDNISFFA

Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3213.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

MITDSQIFFALCIALTAAVLAIGLGRQLYV

Entity 11 polymer

描述 description	PSI-K
分子量 formula_weight	15001.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

EGRALNSQSEARNMKGAVFFCLLGSAAAFAPVAMRPAVMRPTMAAPVQMSLDPVTAADSASHATQLLALALPIPQFNPAKAFIMMFSNILIICTMSIQGKSLARGTPHDEMVESFGITWLLAGTSLGHIVGAGAILGCTAAGFLA

Entity 12 polymer

描述 description	Linker-protein
分子量 formula_weight	12203.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	o

MLALASASYGLTVGVPAAPAAGRAAAPTMAAAESRRNVLAAALLLAPSAANAMTIPGLNAPGLVPATKKPAGAKPSFESYRDTSHFWSSQGIMDSVPKVKGIVTPKTPVGYGAPKAPEPPAAS

Entity 13 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	21992.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MVVGMPSTVVSRSSGVAMAISKPSNAMPFLTAPPCQSSKLPGAETGFDPLYLSEFIDIKWAREAELKHGRICMLATVGYIMQEFFSLPGYPGYTPNPIEAVSSTPPEALAQIVLVLSIIEFNSNKDKWTMDTMFTDPAREPGNLGFDPLKFGENKETRERLAMAELKNGRLAMIAFSGMIHQTFVTGKPLFASLNDIFSSP

Entity 14 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	18812.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSQFAADYPWLAKYGFGPTVKAERWNGRHAMFGWLAILGTGVAKSHGWLPSGDVALTYNEWGGLAQQGFNTYITNERAIIMIAHVHALAVSAAAAFGPQVLGDSLTLLDGEKDEDPYGLFVPLKGTFGLTPAAEMANGRMAMMGIIAVVLTSAISGKDILEVVDIGTGGNLLTHPMF

Entity 15 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	24673.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

IRRGAAPHRPPAPLPSRPDLPASAQMLSLVGSPLSLAGASAPGVAMRAGTPAMAVERSASIPFLKKPPALDGSMVGDVGFDPLGISTTIIELGGDLRYVREAELMHGRQAMLATVGFVFPKLFGKLPVDWAKDISLNPLEAQYQIPPVALGQIAISIAIAEGLRSRIVFSNDPDYVVGDHGFGAGMLKGKSEAQVKDMKMKELAHCRLAMVAITGMFFQTAITGSLYPLVDKF

Entity 16 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	24534.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MLVAALTSSPALVAPAVAPLFAKPKLALAPHSDALRFARMEEAAAAPATEEAEEAEESLGPVGALVGDVGFDPLGFTEILPLAWLREAEIKHCRTAMLATFGFAFTDFWHFPGFDYTTLEAHDAVIAQGGMSQLLLWIGLLEVFSAISIDQMLRGSGREPGDYGFDPLGFASDPAKKADLQMKELANGRLAMFAFGGFVTQSVLTGNTFPYLFDYQTAGDIVAIAAQGASP

Entity 17 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22394.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MLALSSTAALSFAGPGLAGVSSRAGGAAMVAKSKAIPFLDAPPALDGTMAGDKGFDPLLLSNVVPIQWAREAELKHARICMLAVVGWVTVDLGFTVPYAPQVSSLAAHDAAVDKGVFLGLLIPIALVEVLAGIPKCFQIMNEPDASPGGDYKFDPLGIGASAEMQEKEISNGRLAMLAFSGIVTQAALTQGPFPYTYNGVEDLVPPMQSVQGALSIL

Entity 18 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	25430.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MLSVVAPQLSLSTAHVVGARRAPAVQMAAGPMYDQPLAPSTMGREFINSARKPLSEYVGASQELAAFPGGGGKEGAAPVPWDPLQLSELWKVSANNPDVAWLREAELKHGRMSMLAITGVMVQSAGIHLPGNADISFANADWAMAPTTLPPAAWGQVLFFIGLAEGQTSAGLFDLWLGNTEKREPGNLGWGTQFLSKDKKAADKMRLKELKNGRLAMLAIMGVAFNHVIPGALPGCMYN

Entity 19 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22109.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MLALTSCSGPSFAAPLAPATRAARGAASPTMGVETELGATGPLGYWDPFGFSVRNPERFNRYRAVELKHGRIAMAATTGYMVQSFLRWPGYLSTSANIKFADLPNGIAAFKAIPPAGLFQILLFIGAMEAFTWRYYEGPWPGKVPEGKAPGDVAGDLWVRYTDPEEKAFKLNAEINNGRAAMMGSLGMLMHDHILGTWVPPGFE

Entity 20 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22349.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

FLRLILLRAADMLSLTVNSLSLNAGLPAVRAGRSPAPAMGVKSQALPFMDAPAPLDGSMAGDKGFDPLNLSGSFDIKWMREAELKHGRVCMLAWVGYVAVDNGFYVPFAPHVSSLAAHDAAVKAGPMLGLLLAVGAIEAISYNAIAEMMSGETDRRPGDFYLDPFNLCSTPEKLESMLEKEISHCRLAMFAFSGVVTQSALTGGAFPYTS

Entity 21 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	26404.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MQQLGCFSPPPMLAFASSPLSFSAPALARPAAALRGAASMGLAPPVEKSQALPFAERPAKLDGTLVGDVGFDPLGLSNILPIEWMREAELKHGRVCMLAVVGYIVVDKGLRAPGAEKLVAATSSFTAHDAAVQSGHMWALLLACGLFEIVGAGAIASTLNGGDRKPGEFALTGGFDRDAAKLERFKLAEIKHSRLAMMAFSGLVTQEVSQTLPRLFPATSQTPHRHLLDSSQTLPTLPSHLPATSQPPPSH

Entity 22 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	20761.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MLSLASPTACGFAAPLAPRSAVRSASPSMLAVTDLVGASTEVSNKVWDPLKLSENMDESNLKLVRAAELKHCRVAMLATVGWLWTATGTHFEGMLSTSSGVSFADVAAAGPLLGAAKVPAAGIWQMIAAIGALEVYWENKYPAAECGGDFGVPRVTQDPAKFKEIQLAELKNGRLAMIGIISFACAEAIPGSVPFYPF

Entity 23 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	26276.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MLAAAVSTPLSFAGAAAAPLARASAPAMSALPELSKKLNPVLGYWDPLNLAELNFWGAGDDATVGFLRHAEIKHGRVAMAAFVGYCVQSNVHFPWAPFNSIPTNIAPAEQWAQLPEAAKWQIILFVGFLEVYSEHSFILEKYGQKHYMKGGKPGFFPDFDTMVHPVPLNLWDPLKAYKGASAERKADGLLKEVNNGRLAMIGIMGFCAEARVPGAVPALSNIAHYAGDPMAPFAANFHLPGFAS

Entity 24 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	23617.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,P,W

MAMMLSSLAAPALLAPVAPIARAPAAASAKMALVDSMEGVGEETGGQIWDPLGISEAVSDEAVMWFRASELKHGRVAMLASVGYLVGAAKISFPGELAKGVTFASVAANGPYQAWDAVPQAGKLQILSIILALEWATEAKKPHYMRGGVPGKIEQLPFDGIQGLWAPKIKFWDPLNFTGALSAEQKARKRKAELKNGRLAMIGIISFITGHNLPGSVPALDSSF

Entity 25 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22875.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

Entity 26 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	27669.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MLATASTLSLSYAAPAAPAGASLRHARPAAAPPLMETKADLEALAKDLNPAVGFWDPLALSDYSFWGTSQEATIGFLREAEIKHGRIAMAGFVGYIVHSNDIRWTFDKVAASVPTGLPAPAVWDAIPDIAKWQIILFVGVMESWRENKVVLEAEGQKHYMSGGKPGYFPSFDLLPHPVPFPLFDPFGISKRATEEKKAKGRLAEINNGRLAMIGLFGFLSEATVPGSVPFLKGVVPAYTGEVMAPFTQNIFTAPTAL

Entity 27 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22601.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,V,X,5

MLSLTVNSVSFNGPALAPRVAPAAAAGVRMGVSDMEGTGPETGGKVFDPMGLSKIASAETLAWYRAAELKHSRVAMAAVTGWAWVSSGGPLFPGYLSVEQGVTFESLGRDGYAAWAAVPEAGKFQILGVIGILEILSESAVKPHYMAGGTPGKVPLLWDPLGFTAKLSPETLARKRLAELKNGRLAMIGVMSLVSAHFIPNSVPLLPGSVXXXXXXXXX

Entity 28 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	27307.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,4,7,x,y,z

MLALTSSSLSFAPAVAPRAAVSGPVMSAKADLEAFAKECNPVVGYWDPLGLADLPLWGQDQDAVIGWLRHSEIKHGRIAMAGFVGYIAHANGFRFGGIGPQNVVPEGASAPEVWDSIPFLAKLQIIGAIGVLEHISEDKNFLAADGMKHYMRGGKPGYFPTFSANVHPMPLNLFDPFKWSKNASPEKKAKGLVTETNNGRLAMLGLFGFLSESKIPGSVPALSGIIPSYDGDYMQPFLPTGPDTSLWTIGNLWAN

Entity 29 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22478.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MRGVVRSGLAPRMGVETMEGVGPETGNKVFDPVGFATLGGDETLAFFRHAEIKHGRVAMAAMVGFLFHINHIHFPGYLSPTAGVTFEQLSAVGPFEAWNRIPLLGQWKIFWTIPGLEHGSECLDPAGPYTKGGPPGNPKFLKNFWDPPGFPKKLIEAQKGEKLFSNLKNGRLAMIGIASVCAATAVPGSVPLLANAPALTGPGFALPFGTF

Entity 30 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	21708.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MLSLALSPLSLSGLAPRSAVSSSRVAAPQMVQSKSMPMMEAPEHLQGMVGNVDFDPLGLSSPNNIKWMREAELKHGRMSMLAWTGYVAVDLGLRFPGARYAELNSFNAHDVVAKKELFLLLLWVGTFETIGASQIYDMSIDQSERKPGDFGFDPLRLLKSPEAPKYYEAELVHGRAAMLAFSAVVTQSALGNTAFPYF

Entity 31 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	27517.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0

MLLAGSSALSLSYVAPAAPAAAVRGGAVRMESLSDLKTLATGLNPVVGYWDPLKLGEAEFWDNTNEETIGWLRHAEIKHGRVAMAGFVGFIVQANGIKFPWAPFNAITSTSPPEQWDQLPDAAKWQIILGVGFLEWWSEIRVDGTPHYMKGGKPGYVPDFDATPDQLPHWVGLNLYDPLKWSKGASAEKKQKGLLTELNNGRLAMLGIMGFVSEAKVPGSVPLLKGLVAPYTGEVMAPFATDIDWSSWAYIPGA

Entity 32 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	27282.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MLSASVALSAGSAAITAPVAAPGRGAVRAAAPALMDKSGLEGFAKELNPVVGYWDPLNLSNGEFWGDSNSATIGFLRESEIKHGRVAMAGFVGYIVHANDIRFPWDKVAMAAPKGLSPQELWDVTPEAAKWQIILTIAFLEFWRENSYILSKEGEQHYMRGGKPGYFPTFSELPHPVPFNLFDPFGFSKNASPEKKAKGLLAEVNNGRLAMIGLMGFLSEAKVPGSVPALANVGIRPYAGEVMAPFDANFHLF

Entity 33 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	28328.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MLSLASASTLSLAPAALMRAPAVRTAAPVMESKAELESLAGKLNPVIGYWDPLNLADYDQWSQGQEAAIGFLRHAEIKHGRVAMAAFVGYIVQSNGICWPWALTGGPNGVMHSDILAAGGPADQWDALPTASKLQILLFVGGLELWSENSYVLGLSGEKHYMRGGKPGFFPSIKKGGIPHPVPFDLFDPFGLSKNASPEKKAKGLLAEINNGRLAMLGIMAFVSESKVPGSVPALAGKIAPYSGEVMAPFAASDNLPFVADMLKSPLF

Entity 34 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	26786.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8,6

Entity 35 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	26548.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	9

MALLSLAPSCLGLATPLRAAPPLASSRAAAVSMDYSKEELATALNPVVGYFDPLGLATADFWSQGNEATWGWLRHAEIKHGRVAMFAFVGYIAQYNGLHFGFPLSLPESPSYAAGLTPPEQWDALPLLAKAQIFTFIGFLEFWSELGMETHYMKGGRPGDYPDFPKAGVIPVTPVKVFNLYDPFGFAGKRSEEQKAKGLLAEINNGRAAMIGIMAFLAEQKIPGSVPWGPHLKPYAGEVMAPFMS

Entity 36 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	22288.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

GGIAPSCTSLTEEMLAAASSLPLALVQSGAALRAPQLQPLSAQLKVNGMVGDCKPLGYFDPLGFSKDASPETMAKFREAELKHGRVAMLACAGMITADKFHPLFGGKLSSNPLLAITQVPKLGLLQILLFIGFMEVFGILNSRRPDYEPGNFLGTSQWETTPTWDAYQLRELNNGRLAMFGAIGMLTHAYITGKGPLELLDAGNGGIVF

Entity 37 polymer

描述 description	PsaR
分子量 formula_weight	13621.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

MKGALAFLCLLGSAAAFAPAALRPAVMQRSVAAAPAAAGAVMVDRSEAADTWWGDKDYPPSIVLGIGKDVPSSIFGVTSGLAFAIGVYCVAQSNLVNILSGSTVNGFYVAGALLVPYSWGLHVAAWIQKQNGK

Entity 38 polymer

描述 description	Light harvesting protein
分子量 formula_weight	28110.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合体 Polymer

聚合体类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,Z,2

MSFADEFTFDSKPWSSSEIKDKAGLEALAKKLNPTVGLWDPLGIAETSPETIGWFRHAEIKHGRVAMAAFVGYCVQSNGIHFPWNIQGWQGTPVVSFADIAAAGGPADQWDALSTPAKLQILGVIGFLEMWSETSVVLKADGQEHYVRGGKPGYFPKLSRSDEMAFPHPVPLNLWDPFGFTSKMTPERKEKALLAEVNNGRLAMIGIFGMISASKGLQVPGLDTVGIKPYAGEVMAPFAAGDASLPFVSGMLEKIGTYGY

Entity 39 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	411

Entity 40 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 41 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

Entity 42 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

Entity 43 non-polymer

描述 description	(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol
分子量 formula_weight	582.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	58

Entity 44 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

Entity 45 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

Entity 46 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

Entity 47 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

Entity 48 non-polymer

描述 description	;(3S,3'S,5R,5'R,6S,6'R,8'R)-3,5'-dihydroxy-8-oxo-6',7'-didehydro-5,5',6,6',7,8-hexahydro-5,6-epoxy-beta,beta-caroten-3'- yl acetate ;
分子量 formula_weight	658.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	100

Entity 49 non-polymer

描述 description	Chlorophyll c2
分子量 formula_weight	608.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	113

Entity 50 non-polymer

描述 description	;[(2~{Z},4~{E},6~{E},8~{E},10~{E},12~{E},14~{E})-2-[2-[(4~{S},6~{R})-4-acetyloxy-2,2,6-trimethyl-6-oxidanyl-cyclohexylidene]ethenyl]-6,11,15-trimethyl-16-oxidanylidene-17-[(1~{S},4~{S},6~{R})-2,2,6-trimethyl-4-oxidanyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptan-1-yl]heptadeca-2,4,6,8,10,12,14-heptaenyl] hexanoate ;
分子量 formula_weight	773.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	67

Entity 51 non-polymer

描述 description	Chlorophyll C3
分子量 formula_weight	652.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	39

Entity 52 non-polymer

描述 description	;[(2~{Z},4~{E},6~{E},8~{E},10~{E},12~{E},14~{E})-17-[(4~{S},6~{R})-4-acetyloxy-2,2,6-trimethyl-6-oxidanyl-cyclohexylidene]-6,11,15-trimethyl-2-[2-[(1~{R},4~{S},6~{R})-2,2,6-trimethyl-4-oxidanyl-7-oxabicyclo[4.1.0]heptan-1-yl]ethynyl]heptadeca-2,4,6,8,10,12,14,16-octaenyl] dodecanoate ;
分子量 formula_weight	839.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	11

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7. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.79 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	70606

fit	/app/data/saxs_computation/jj/9jj8/9jj8.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jj/9jj8/9jj8.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jj/9jj8/9jj8.dat

Structural insights into the PSI-FCPI supercomplex from the coccolithophore Emiliania huxleyi

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合体信息 (52)

Entity 1 polymer

聚合体 Polymer

Entity 2 polymer

聚合体 Polymer

Entity 3 polymer

聚合体 Polymer

Entity 4 polymer

聚合体 Polymer

Entity 5 polymer

聚合体 Polymer

Entity 6 polymer

聚合体 Polymer

Entity 7 polymer

聚合体 Polymer

Entity 8 polymer

聚合体 Polymer

Entity 9 polymer

聚合体 Polymer

Entity 10 polymer

聚合体 Polymer

Entity 11 polymer

聚合体 Polymer

Entity 12 polymer

聚合体 Polymer

Entity 13 polymer

聚合体 Polymer

Entity 14 polymer

聚合体 Polymer

Entity 15 polymer

聚合体 Polymer

Entity 16 polymer

聚合体 Polymer

Entity 17 polymer

聚合体 Polymer

Entity 18 polymer

聚合体 Polymer

Entity 19 polymer

聚合体 Polymer

Entity 20 polymer

聚合体 Polymer

Entity 21 polymer

聚合体 Polymer

Entity 22 polymer

聚合体 Polymer

Entity 23 polymer

聚合体 Polymer

Entity 24 polymer

聚合体 Polymer

Entity 25 polymer

聚合体 Polymer

Entity 26 polymer

聚合体 Polymer

Entity 27 polymer

聚合体 Polymer

Entity 28 polymer

聚合体 Polymer

Entity 29 polymer

聚合体 Polymer

Entity 30 polymer

聚合体 Polymer

Entity 31 polymer

聚合体 Polymer

Entity 32 polymer

聚合体 Polymer

Entity 33 polymer

聚合体 Polymer

Entity 34 polymer

聚合体 Polymer

Entity 35 polymer