9ooa

Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 7

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 80.6 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase KAT8

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 174–449	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 A1CD4 N-(cyclohexylsulfamoyl)-2-hydroxy-6-methoxy-4-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]benzene-1-carboximidamide × 1 A1CD3 N-cyclohexyl-N'-{4-methoxy-6-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]-1,2-benzoxazol-3-yl}sulfuric diamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5, 0.2 M Li2SO4, 9% PEG3350	分辨率 1.39 Å R-free 0.204

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9OOA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
22TG Crystal Structure of MYST histone acetyltransferase KAT6A in complex with Compound 20 提交 2026-01-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）片段：BD1 domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1MDU 2,6-dimethoxy-~{N}-[4-(pyrazol-1-ylmethyl)-2,3-dihydrofuro[2,3-e][1,2]benzoxazol-8-yl]benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298.15 K；0.2 M Sod. Malonate, pH 6.0, 20% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.372
22TG Crystal Structure of MYST histone acetyltransferase KAT6A in complex with Compound 20 提交 2026-01-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 174–449（276 aa）片段：BD1 domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1MDU 2,6-dimethoxy-~{N}-[4-(pyrazol-1-ylmethyl)-2,3-dihydrofuro[2,3-e][1,2]benzoxazol-8-yl]benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298.15 K；0.2 M Sod. Malonate, pH 6.0, 20% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.372
25VX Crystal Structure of MYST histone acetyltransferase KAT6A in complex with inhibitor Compound 9 提交 2026-04-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–446（271 aa）	突变：Y579H,A645S,L648M,T649I,K660R,I702N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1MGC 2,6-dimethoxy-~{N}-(5-phenyl-3,4-dihydro-2~{H}-pyrano[2,3-e][1,2]benzoxazol-9-yl)benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Sod. Malonate, pH 6.0, 20% PEG 3350	分辨率 2.29 Å R-free 0.266
2PQ8 MYST histone acetyltransferase 1 提交 2007-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）片段：Residues 174-449	突变：K274R	ZN ZINC ION × 1 COA COENZYME A × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；24% PEG3350, 0.2 M Ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.45 Å R-free 0.231
2Y0M CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN DOSAGE COMPENSATION FACTORS MSL1 AND MOF 提交 2010-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 174–458（285 aa）片段：HAT DOMAIN, RESIDUES 174-458	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 4 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；0.1 M SODIUM ACETATE (PH 5), 1.0 M SODIUM FORMATE.	分辨率 2.70 Å R-free 0.256
3QAH Crystal structure of apo-form human MOF catalytic domain 提交 2011-01-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）片段：apo-form human MOF catalytic domain, UNP residues 174-449	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris, 0.2M MgCl2, 25% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
3TOA Human MOF crystal structure with active site lysine partially acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–458（282 aa）片段：UNP residues 177-447	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.265
3TOB Human MOF E350Q crystal structure with active site lysine partially acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–458（282 aa）片段：UNP residues 177-447	突变：E350Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% PEG3350, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.253
4DNC Crystal structure of human MOF in complex with MSL1 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 170–458（289 aa）片段：HAT domain (UNP residues 170-458)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.6 M Li2SO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
4DNC Crystal structure of human MOF in complex with MSL1 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 170–458（289 aa）片段：HAT domain (UNP residues 170-458)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.6 M Li2SO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
4DNC Crystal structure of human MOF in complex with MSL1 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 170–458（289 aa）片段：HAT domain (UNP residues 170-458) 链 B 170–458（289 aa）片段：HAT domain (UNP residues 170-458)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.6 M Li2SO4, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.246
5H43 Structural and mechanistical studies of the nuclear import by Importin-alpha 提交 2016-10-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 140–149（10 aa）片段：UNP residues 140-149 链 C 128–142（15 aa）片段：UNP residues 128-142	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；3%(v/v) Tacsimate pH5.0, 0.1M Sodium citrate tribasic dehydrate pH5.6, 16%(w/v) PEG 3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.243
5J8C Human MOF C316S, E350Q crystal structure 提交 2016-04-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–458（282 aa）片段：UNP residues 177-458	突变：C316S E350Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Ammonium Chloride 28% PEG 3350 0.1M BisTris-HCL pH 6.5	分辨率 2.17 Å R-free 0.234
5J8F Human MOF K274P crystal structure 提交 2016-04-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–458（282 aa）片段：UNP residues 177-458	突变：K274P	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.28M Ammonium Chloride 26%PEG 3350 0.1M BisTris-HCl pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
5WCI Human MYST histone acetyltransferase 1 提交 2017-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）片段：residues 174-449	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 1VU propionyl Coenzyme A × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Na malonate pH5.0	分辨率 1.78 Å R-free 0.218
6BA2 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 提交 2017-10-11	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 NA SODIUM ION × 1 7KM 4-fluoro-5-methyl-N'-(phenylsulfonyl)[1,1'-biphenyl]-3-carbohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.0, 0.22 M MgCl2	分辨率 1.85 Å R-free 0.228
6BA4 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with Acetyl-CoA cofactor 提交 2017-10-12	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 3 ACO ACETYL COENZYME A × 1 7L1* S-{(3S,5R,9R)-1-[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3-hydroxy-4-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5-dioxido-10,14-dioxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} ethanethioate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 7.0, 0.22 M MgCl2	分辨率 1.95 Å R-free 0.213
6CT2 MYST histone acetyltransferase KAT6A/B in complex with WM-1119 提交 2018-03-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FCV 3-fluoro-N'-[(2-fluorophenyl)sulfonyl]-5-(pyridin-2-yl)benzohydrazide × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.196 M MgCl2, 19.5 % PEG 3350, and 0.1 M bis-tris chloride at pH 5.5	分辨率 2.13 Å R-free 0.235
6OIN Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor CTX-124143 提交 2019-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）片段：residues 176-448	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 MQJ 2-fluoro-N'-[(naphthalen-2-yl)sulfonyl]benzohydrazide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；292 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.220
6OIO Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 60 提交 2019-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）片段：residues 176-448	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ML7 N'-(phenylsulfonyl)[1,1'-biphenyl]-3-carbohydrazide × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.221
6OIP Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 34 提交 2019-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）片段：residues 177-448	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 MLS 2-fluoro-3-methyl-N'-[(naphthalen-2-yl)sulfonyl]benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；20% PEG 3350, 0.2 M K/Na Tartrate	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
6OIQ Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 63 提交 2019-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）片段：residues 176-448	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 MLV 2-fluoro-N'-(phenylsulfonyl)[1,1'-biphenyl]-3-carbohydrazide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6OIR Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 62 提交 2019-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）片段：residues 176-448	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 MNJ 4-fluoro-N'-(phenylsulfonyl)[1,1'-biphenyl]-3-carbohydrazide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 2.03 Å R-free 0.221
6OWH Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 92 提交 2019-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 NBJ N'-[(2-fluorophenyl)sulfonyl]-3-iodobenzohydrazide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
6OWI Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 85 提交 2019-05-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 176–448（273 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NB7 N'-[(2-fluorophenyl)sulfonyl]benzohydrazide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG3350, 2% Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6PD8 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 39 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 O9D 5-ethoxy-2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.245
6PD9 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 60 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 O9G 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-(1H-pyrazol-1-yl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
6PDA Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 74 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9J 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-(pyridin-2-yl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.45 Å R-free 0.226
6PDB Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 80 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9M 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-(pyrimidin-2-yl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.42 Å R-free 0.221
6PDC Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 42 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9P 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-[(prop-2-en-1-yl)oxy]benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 1.96 Å R-free 0.205
6PDD Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 41 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 O9S 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-[(propan-2-yl)oxy]benzohydrazide × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.212
6PDE Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 40 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9V 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-propoxybenzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.22 Å R-free 0.209
6PDF Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 55 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9Y 2-fluoro-3-methyl-N'-(phenylsulfonyl)-5-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 2.22 Å R-free 0.202
6PDG Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 83 提交 2019-06-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 177–448（272 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, W204S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 O9A 5-ethoxy-2-fluoro-3-methyl-N'-[(naphthalen-2-yl)sulfonyl]benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；27% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris pH 6.5	分辨率 1.92 Å R-free 0.213
7CMR The Crystal Structure of human MYST1 from Biortus. 提交 2020-07-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–458（458 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M LiCl, 0.1M Hepes pH7, 20% PEG6,000	分辨率 2.20 Å R-free 0.263
8W13 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with N-(1-(5-bromo-2-methoxyphenyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl)-2-methoxybenzenesulfonamide 提交 2024-02-15	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1AEW N-[(1M)-1-(5-bromo-2-methoxyphenyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 7 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；291 K；0.1M tris pH7.0,2M NaCl,0.22M MgCl2	分辨率 1.81 Å R-free 0.204
9OO9 Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 6 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	R7L 2,6-dimethoxy-N-{4-methoxy-6-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]-1,2-benzoxazol-3-yl}benzene-1-sulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.25 M Potassium/Sodium Tartrate, 20% PEG3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
9OOB Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 8 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1CDK 6-(azetidin-1-yl)-N-(2-ethoxy-6-methoxybenzene-1-sulfonyl)-4-fluoro-1-benzofuran-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.25 M MgCl2, 8% PEG8K	分辨率 1.83 Å R-free 0.208
9OOC Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 10a 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 A1CDJ 4-fluoro-N'-[3-(methoxymethyl)benzene-1-sulfonyl]-5-methyl[1,1'-biphenyl]-3-carbohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
9OOD Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 10c 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 A1CDI 5-ethoxy-2-fluoro-N'-(1H-indole-6-sulfonyl)-3-methylbenzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.250
9OOE Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 10d 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 A1CDH N'-(1-benzothiophene-2-sulfonyl)-5-ethoxy-2-fluoro-3-methylbenzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
9OOF Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 10e 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 A1CDG (5P)-3-fluoro-N'-(3-fluorothiophene-2-sulfonyl)-5-(pyridin-2-yl)benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 1.68 Å R-free 0.199
9OOH Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 10b 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 A1CDF 5-ethoxy-2-fluoro-N'-[3-(2-hydroxyethoxy)benzene-1-sulfonyl]benzohydrazide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 2.05 Å R-free 0.247
9OOJ Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 18c 提交 2025-05-15	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 174–449（276 aa）	突变：A142S, L145M, T146I, K157R, S204W 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 A1CDE N-[(2S)-2-(1,3-oxazol-2-yl)-2-phenylethyl]-1,1-dioxo-1,2-dihydro-1lambda~6~-thieno[3,2-e][1,2,4]thiadiazine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M HEPES pH7.5, 0.2-0.3 M NaCl, 12.5-15% PEG3350	分辨率 1.82 Å R-free 0.224

共 41 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KAT8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 20–295； UniProt 174–449

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ooa
沉积日期 deposition_date	2025-05-15
结构标题 title	Crystal structure of MYST acetyltransferase domain in complex with inhibitor 7
关键词 keywords	Acetyltransferase, Inhibitor, Complex, TRANSFERASE, TRANSFERASE-INHIBITOR complex; TRANSFERASE/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.21 Å
零角强度 I(0) i0	31286700.00
分子量 molecular_weight	29461.0 kDa
排除体积 excluded_volume	28866 Å³
包络体积 envelope_volume	46335 Å³
水化壳体积 shell_volume	19885 Å³
包络直径 envelope_diameter	81.8 Å
壳层 Rg shell_rg	26.16 Å
包络 Rg envelope_rg	20.67 Å
形状 Rg shape_rg	20.20 Å
总 Rg total_rg	20.85 Å
总原子数 total_atoms	2224
残基数 n_residues	264
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	80.6 Å
Rg (实空间) rg_real	20.91 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.68 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.1290e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.4840e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.90 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	31290000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7086
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.527
峰度 Kurtosis kurtosis	0.031
角度范围 angular_range	— – 0.3800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6641000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.476; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.778; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase KAT8
分子量 formula_weight	34433.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48
突变 mutation	A142S, L145M, T146I, K157R, S204W
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2549

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSTKVKYVDKIHIGNYEIDAWYFSPFPEDYGKQPKLWLCEYCLKYMKYEKSYRFHLGQCQWRQPPGKEIYRKSNISVHEVDGKDHKIYCQNLCLLAKLFLDHKTLYFDVEPFVFYILTEVDRQGAHIVGYFSKEKESPDGNNVSCIMILPPYQRRGYGRFLIAFSYELSKLESTVGSPEKPLSDLGKLSYRSYWSSVLLENLRDFRGTLSIKDLSQMTSITQNDIISTLQSLNMVKYWKGQHVICVTPKLVEEHLKSAQYKKPPITVDSVCLKWAPPK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	N-(cyclohexylsulfamoyl)-2-hydroxy-6-methoxy-4-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]benzene-1-carboximidamide
分子量 formula_weight	407.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	;N-cyclohexyl-N'-{4-methoxy-6-[(1H-pyrazol-1-yl)methyl]-1,2-benzoxazol-3-yl}sulfuric diamide ;
分子量 formula_weight	405.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	286

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	46.502 Å
晶胞边长 b length_b	57.450 Å
晶胞边长 c length_c	121.546 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.389 Å
最低分辨率 resolution_low	36.931 Å
R 因子 r_factor	0.1864
R_work r_work	0.1854
R_free r_free	0.2044

fit	/app/data/saxs_computation/oo/9ooa/9ooa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/oo/9ooa/9ooa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/oo/9ooa/9ooa.dat