SAXSdb — 9r78

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-protein VI

Human adenovirus D10

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Hexon protein × 720 （K7ZJY8） Penton protein × 60 （K7ZQ23） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （K7ZMX4） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （K7ZJY9） Hexon-interlacing protein × 240 （K7ZLM2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZRR7_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 2； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 3； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 4； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 5； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 6； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 7； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 8； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Hexon protein

Human adenovirus D10

UniProt K7ZJY8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Pre-protein VI × 480 （K7ZRR7） Penton protein × 60 （K7ZQ23） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （K7ZMX4） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （K7ZJY9） Hexon-interlacing protein × 240 （K7ZLM2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZJY8_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 B； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 C； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 D； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 E； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 F； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 G； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 H； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 I； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 J； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 K； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946 作者链 L； PDB构建体 1–941； UniProt 6–946

Penton protein

Human adenovirus D10

UniProt K7ZQ23

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Pre-protein VI × 480 （K7ZRR7） Hexon protein × 720 （K7ZJY8） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （K7ZMX4） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （K7ZJY9） Hexon-interlacing protein × 240 （K7ZLM2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZQ23_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–519； UniProt 1–519

Pre-hexon-linking protein IIIa

Human adenovirus D10

UniProt K7ZMX4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Pre-protein VI × 480 （K7ZRR7） Hexon protein × 720 （K7ZJY8） Penton protein × 60 （K7ZQ23） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （K7ZJY9） Hexon-interlacing protein × 240 （K7ZLM2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZMX4_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–559； UniProt 1–559

Pre-hexon-linking protein VIII

Human adenovirus D10

UniProt K7ZJY9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Pre-protein VI × 480 （K7ZRR7） Hexon protein × 720 （K7ZJY8） Penton protein × 60 （K7ZQ23） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （K7ZMX4） Hexon-interlacing protein × 240 （K7ZLM2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZJY9_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227 作者链 P； PDB构建体 1–227； UniProt 1–227

Hexon-interlacing protein

Human adenovirus D10

UniProt K7ZLM2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 1680	Pre-protein VI × 480 （K7ZRR7） Hexon protein × 720 （K7ZJY8） Penton protein × 60 （K7ZQ23） Pre-hexon-linking protein IIIa × 60 （K7ZMX4） Pre-hexon-linking protein VIII × 120 （K7ZJY9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	K7ZLM2_9ADEN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134 作者链 R； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134 作者链 S； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134 作者链 T； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9r78
沉积日期 deposition_date	2025-05-14
结构标题 title	Human Adenovirus D 10 Capsid Structure
关键词 keywords	virus, adenovirus, capsid, conjunctivitis; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9r78__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9r78__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9r78__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	385.70 Å
总 Rg	385.70 Å
原子数	11885760
残基数	764220
排除体积	107060000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9r78__assembly_1__model_1`	1680-meric （1680）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Pre-protein VI
分子量 formula_weight	25546.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1,2,3,4,5,6,7,8
原子数 atom_count	198096

MEDINFASLAPRHGTRPFMGTWNEIGTSQLNGGAFNWSSVWSGLKNFGSTLRTYGNKAWNSSTGQLLREKLKDQNFQQKVVDGLASGINGVVDIANQAVQREINSRLDPRPPTVVEMEDATLPPPKGEKRPRPDAEETILQVDEPPSYEEAVKAGMPTTRIIAPLATGVMKPATLDLPPPPAPAPPKATPVVQAPPVATAVRRVPARRQAQNWQSTLHSIVGLGVKSLKRRRCY

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Hexon protein
分子量 formula_weight	106268.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L

MMPQWAYMHIAGQDASEYLSPGLVQFARATDTYFSLGNKFRNPTVAPTHDVTTDRSQRLTLRFVPVDREDTTYSYKARFTLAVGDNRVLDMASTYFDIRGVLDRGPSFKPYSGTAYNSLAPKSAPNPSQWTANEKQTGGQPKSVTQTFGSAPMGGSNITIEGLVIGTKEEEGNATEEIFADKTFQPEPQVGEENWQETEAFYGGRALKKDTKMKPCYGSFARPTNEKGGQAKLKLNDQGQPTKDYDIDLAFFDTPGGTPPTGSGQQEEYKADIVMYTENVNLETPDTHVVYKPGKEDESSETNLTQQSMPNRPNYIGFRDNFVGLMYYNSTGNMGVLAGQASQLNAVVDLQDRNTELSYQLLLDSLGDRTRYFSMWNSAVDSYDPDVRIIENHGVEDELPNYCFPLNGTGTNSTYQGVKVKTGQDGAEETEWDKDETVARQNQIAKGNVYAMEINLQANLWKSFLYSNVALYLPDSYKYTPANVTLPANTNTYEYMNGRVVAPSLVDAYINIGARWSLDPMDNVNPFNHHRNAGLRYRSMLLGNGRYVPFHIQVPQKFFAIKNLLLLPGSYTYEWNFRKDVNMILQSSLGNDLRVDGASVRFDSVNLYATFFPMAHNTASTLEAMLRNDTNDQSFNDYLSAANMLYPIPAKATNVPISIPSRNWAAFRGWSFTRLKTKETPSLGSGFDPYFVYSGSIPYLDGTFYLNHTFKKVSIMFDSSVSWPGNDRLLTPNEFEIKRSVDGEGYNVAQCNMTKDWFLVQMLSHYNIGYQGFHVPEGYKDRMYSFFRNFQPMSRQVVDEINYKDYKAVTLPFQHNNSGFTGYLAPTMRQGQPYPANFPYPLIGQTAVPSVTQKKFLCDRVMWRIPFSSNFMSMGALTDLGQNMLYANSAHALDMTFEVDPMDEPTLLYLLFEVFDVVRVHQPHRGVIEAVYLRTPFSAGN

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Penton protein
分子量 formula_weight	58631.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MRRAVVSSSPPPSYESVMAQATLEVPFVPPRYMAPTEGRNSIRYSELAPQYDTTRVYLVDNKSADIASLNYQNDHSNFLTTVVQNNDFTPAEASTQTINFDERSRWGGDLKTILHTNMPNVNEYMFTSKFKARVMVARKHPEGVVETDLSQDKLEYEWFEFTLPEGNFSETMTIDLMNNAILENYLQVGRQNGVLESDIGVKFDSRNFKLGWDPVTKLVMPGVYTYEAFHPDVVLLPGCGVDFTESRLSNLLGIRKKQPFQEGFRIMYEDLEGGNIPALLDVPKYLESKKKVEDETKNAAAATADTTTRGDTFATPAQETAADKKVEVLPIEKDESGRSYNLIQGTHDTLYRSWYLSYTYGDPEKGVQSWTLLTTPDVTCGAEQVYWSLPDLMQDPVTFRSTQQVSNYPVVGAELMPFRAKSFYNDLAVYSQLIRSYTSLTHVFNRFPDNQILCRPPAPTITTVSENVPALTDHGTLPLRSSIRGVQRVTVTDARRRTCPYVYKALGIVAPRVLSSRTF

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Pre-hexon-linking protein IIIa
分子量 formula_weight	62170.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MQQAPDPAIRAALQSQPSGIASDDWEAAMQRIMALTTRNPESFRQQPQANRLSAILEAVVPSRTNPTHEKVLAIVNALAENKAIRPDEAGLVYNALLERVGRYNSTNVQSNLDRLVTDVREAVAQRERFKNEGLGSLVALNAFLATQPANVPRGQDDYTNFISALRLMVTEVPQSEVYQSGPDYFFQTSRQGLQTVNLSQAFKNLRGLWGVQAPVGDRSTVSSLLTPNSRLLLLLIAPFTDSGSVNRNSYLGHLLTLYREAIGQAQVDEQTFQEITSVSRALGQNDTDSLRATLNFLLTNRQQKIPAQYALSAEEERILRYVQQSVGLFLMQEGATPSAALDMTARNMEPSMYAANRPFINKLMDYLHRAAVMNTDYFTNAILNPHWLPPPGFYTGEYDMPDPNDGFLWDDVDSVVFSPTFQKRQEAPPSEGAVGRSPFPSLGSLHSLPGSVNSGRVSRPRLLGEDEYLNDSLLQPPRAKNAMANNGIESLVDKLNRWKTYAQDHRDAPAPRRQRHDRQRGLVWDDEDSADDSSVLDLGGSGGVNPFAHLQPKLGRRMF

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Pre-hexon-linking protein VIII
分子量 formula_weight	24660.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P

MSKEIPTPYMWSYQPQMGLAAGASQDYSTRMNWLSAGPSMISRVNGVRNHRNQILLEQAAVTSTPRAKLNPRNWPSTLVYQEIPGPTTVLLPRDALAEVRMTNSGVQLAGGASRCPLRPQSGIKTLVIRGRGTQLNDELVSSSIGLRPDGVFQLAGAGRSSFTPNQAYLTLQSSSSEPRSGGIGTLQFVEEFVPSVYFNPFSGSPGLYPDEFIPNFDAVREAVDGYD

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Hexon-interlacing protein
分子量 formula_weight	13773.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,R,S,T

MNGTGGAFEGGLFSPYLTTRLPGWAGVRQNVMGSTVDGRPVLPANSSTMTYATVGSSSLDSTAAAAAAAAAMTATRLASSYMPSSGSSPSVPSSIIAEEKLLALLAELEALSRQLAALTQQVSELREQQQQQNK

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus D10
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	28275
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	5524

Human Adenovirus D 10 Capsid Structure

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-protein VI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hexon protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Penton protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-hexon-linking protein IIIa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-hexon-linking protein VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Hexon-interlacing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9r78__assembly_1__model_1

9r78__assembly_1__model_1 | I(q)

9r78__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (2)