9sdq

Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana 40S ribosomal subunit (Head)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small ribosomal subunit protein uS3z

物种未注明

UniProt Q9SIP7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS3A_ARATH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 BD; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250

Small ribosomal subunit protein uS7z

物种未注明

UniProt Q9ZUT9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS51_ARATH
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 BF; PDB构建体 1–207; UniProt 1–207

Small ribosomal subunit protein uS19x

物种未注明

UniProt Q9FY64

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS154_ARATH
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 BP; PDB构建体 1–152; UniProt 1–152

Small ribosomal subunit protein uS9z

物种未注明

UniProt Q9SK22

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS161_ARATH
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 BQ; PDB构建体 1–146; UniProt 1–146

Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x

物种未注明

UniProt P34788

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS18_ARATH
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 BS; PDB构建体 1–152; UniProt 1–152

Small ribosomal subunit protein eS19x

物种未注明

UniProt Q9FNP8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS193_ARATH
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 BT; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142

Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x

物种未注明

UniProt P49200

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS201_ARATH
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 BU; PDB构建体 1–124; UniProt 1–124

Small ribosomal subunit protein eS28x

物种未注明

UniProt P34789

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS282_ARATH
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Bc; PDB构建体 1–64; UniProt 1–64

Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x

物种未注明

UniProt Q680P8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS29_ARATH
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–56; UniProt 1–56

Small ribosomal subunit protein eS25y

物种未注明

UniProt Q9SIK2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS252_ARATH
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108

Small ribosomal subunit protein eS10x

物种未注明

UniProt Q9LTF2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS17w × 1 (Q9LZ17) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS103_ARATH
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 BK; PDB构建体 1–179; UniProt 1–179

Small ribosomal subunit protein eS17w

物种未注明

UniProt Q9LZ17

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 12 RNA 1 RNA (500-MER) × 1 Small ribosomal subunit protein uS3z × 1 (Q9SIP7) Small ribosomal subunit protein uS7z × 1 (Q9ZUT9) Small ribosomal subunit protein uS19x × 1 (Q9FY64) Small ribosomal subunit protein uS9z × 1 (Q9SK22) Small ribosomal subunit protein uS13z/uS13y/uS13x × 1 (P34788) Small ribosomal subunit protein eS19x × 1 (Q9FNP8) Small ribosomal subunit protein uS10z/uS10x × 1 (P49200) Small ribosomal subunit protein eS28x × 1 (P34789) Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x × 1 (Q680P8) Small ribosomal subunit protein eS25y × 1 (Q9SIK2) Small ribosomal subunit protein eS10x × 1 (Q9LTF2) POTASSIUM ION × 3 MAGNESIUM ION × 1 ZINC ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS174_ARATH
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 BR; PDB构建体 1–141; UniProt 1–141

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9sdq
沉积日期 deposition_date2025-08-14
结构标题 titleCryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana 40S ribosomal subunit (Head)
关键词 keywordsRibosomal 40S subunit -Head region, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9sdq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9sdq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9sdq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)42.80 Å
Rg(电子密度)43.05 Å
总 Rg43.26 Å
原子数38198
残基数1850
排除体积345850 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9sdq__assembly_1__model_1 13-meric (13) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

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7. 引用文献 (1)