9t2p

E. coli 70S ribosome from delta-9 strain, PTC class 6

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Large ribosomal subunit protein uL2

物种未注明

UniProt P60422

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL2_ECOLI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–273; UniProt 1–273

Large ribosomal subunit protein uL3

物种未注明

UniProt P60438

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL3_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–209; UniProt 1–209

Large ribosomal subunit protein uL4

物种未注明

UniProt P60723

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL4_ECOLI
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–201; UniProt 1–201

Large ribosomal subunit protein uL13

物种未注明

UniProt A7ZSC5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL13_ECO24
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 i; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142

Large ribosomal subunit protein uL15

物种未注明

UniProt P02413

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL15_ECOLI
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–144; UniProt 1–144

Large ribosomal subunit protein uL16

物种未注明

UniProt A7ZSK2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL16_ECO24
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 l; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

Large ribosomal subunit protein bL21

物种未注明

UniProt A7ZS83

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL21_ECO24
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 q; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

Large ribosomal subunit protein uL22

物种未注明

UniProt P61175

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL22_ECOLI
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 r; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

Large ribosomal subunit protein bL27

物种未注明

UniProt P0A7L8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL32 × 1 (P0A7N4) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL27_ECOLI
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 v; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85

Large ribosomal subunit protein bL32

物种未注明

UniProt P0A7N4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 10 RNA 4 tRNA(fMet) × 1 23S rRNA × 1 5S rRNA × 1 Large ribosomal subunit protein uL2 × 1 (P60422) Large ribosomal subunit protein uL3 × 1 (P60438) Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 (P60723) Large ribosomal subunit protein uL13 × 1 (A7ZSC5) Large ribosomal subunit protein uL15 × 1 (P02413) Large ribosomal subunit protein uL16 × 1 (A7ZSK2) Large ribosomal subunit protein bL21 × 1 (A7ZS83) Large ribosomal subunit protein uL22 × 1 (P61175) Large ribosomal subunit protein bL27 × 1 (P0A7L8) tRNA(Phe) × 1 N~1~-(3-azaniumylpropyl)butane-1,4-diaminium × 2 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 MAGNESIUM ION × 101 POTASSIUM ION × 36 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL32_ECOLI
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 z; PDB构建体 1–57; UniProt 1–57

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9t2p
沉积日期 deposition_date2025-10-23
结构标题 titleE. coli 70S ribosome from delta-9 strain, PTC class 6
关键词 keywordsRNA modifications, ribosome biogenesis, maturation, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9t2p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9t2p__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9t2p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.99 Å
Rg(电子密度)35.39 Å
总 Rg35.77 Å
原子数15164
残基数814
排除体积222970 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9t2p__assembly_1__model_1 14-meric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

▶

7. 引用文献 (1)