Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ;(4~{a}~{S})-8-azanyl-3-methyl-~{N}-[1-[4-(oxan-4-ylamino)naphthalen-1-yl]cyclopropyl]-2,4,4~{a},5-tetrahydro-1~{H}-pyrazino[2,1-c][1,4]benzoxazine-9-carboxamide ; × 2 ZINC ION × 16 CHLORIDE ION × 12 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | R1AB_SARS2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–312； UniProt 1564–1875 |
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| 条目编号 entry_id | 9u7d |
| 沉积日期 deposition_date | 2025-03-24 |
| 最后修订 last_revision | 2025-12-24 |
| 结构标题 title | Crystal structure of SARS-CoV-2 papain-like protease (Cys111Ser) in complex with YL1004 |
| 关键词 keywords | Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, papain-like protease, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 28.92 Å |
| Rg（电子密度） | 28.03 Å |
| 总 Rg | 29.04 Å |
| 原子数 | 4990 |
| 残基数 | 614 |
| 排除体积 | 88898 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |