SAXSdb — 9vj4

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol phosphorylceramide synthase catalytic subunit AUR1

Saccharomyces cerevisiae S288C

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Inositol phosphorylceramide synthase regulatory subunit KEI1 × 1 （Q06346） ~{N}-[(~{Z},2~{S},3~{R})-1,3-bis(oxidanyl)heptadec-4-en-2-yl]dodecanamide × 1 TETRADECANE × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl tetradecanoate × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AUR1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401

Inositol phosphorylceramide synthase regulatory subunit KEI1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q06346

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Inositol phosphorylceramide synthase catalytic subunit AUR1 × 1 （P36107） ~{N}-[(~{Z},2~{S},3~{R})-1,3-bis(oxidanyl)heptadec-4-en-2-yl]dodecanamide × 1 TETRADECANE × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl tetradecanoate × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KEI1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–221； UniProt 1–221

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9vj4
沉积日期 deposition_date	2025-06-19
结构标题 title	Structure of a membrane-bound inositol phosphorylceramide synthase and ceramide complex
关键词 keywords	membrane protein, inositol phosphorylceramide synthase, LIPID BINDING PROTEIN; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9vj4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9vj4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9vj4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.53 Å
Rg（电子密度）	23.60 Å
总 Rg	24.66 Å
原子数	3735
残基数	445
排除体积	69156 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9vj4__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Inositol phosphorylceramide synthase catalytic subunit AUR1
分子量 formula_weight	45223.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.1.227
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3735

MANPFSRWFLSERPPNCHVADLETSLDPHQTLLKVQKYKPALSDWVHYIFLGSIMLFVFITNPAPWIFKILFYCFLGTLFIIPATSQFFFNALPILTWVALYFTSSYFPDDRRPPITVKVLPAVETILYGDNLSDILATSTNSFLDILAWLPYGLFHFGAPFVVAAILFVFGPPTVLQGYAFAFGYMNLFGVIMQNVFPAAPPWYKILYGLQSANYDMHGSPGGLARIDKLLGINMYTTAFSNSSVIFGAFPSLHSGCATMEALFFCYCFPKLKPLFIAYVCWLWWSTMYLTHHYFVDLMAGSVLSYVIFQYTKYTHLPIVDTSLFCRWSYTSIEKYDISKSDPLAADSNDIESVPLSNLELDFDLNMTDEPSVSPSLFDGSTSVSRSSATSITSLGVKRA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Inositol phosphorylceramide synthase regulatory subunit KEI1
分子量 formula_weight	25505.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MRSSLLTLPKSFLGFMPLYLAVEIVLGISILNKCSGAYGILALFTGHPLDFMQWIAYLWSVFTLIVFSQGLYLIHKPNLLVFSQICVLYTIDTISTCFFTLWFTTQWFTLEDTANIDGNNALQSNPISTGKLTERGIDISKQSATESYEYTMTILITLVSLIFRFYFNFILASFVQELLHHPKYLVDRDDVEQNLKNKPIWKRLWAKSQKGCYKLCKNLLE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	~{N}-[(~{Z},2~{S},3~{R})-1,3-bis(oxidanyl)heptadec-4-en-2-yl]dodecanamide
分子量 formula_weight	467.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRADECANE
分子量 formula_weight	198.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	(2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl tetradecanoate
分子量 formula_weight	635.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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分辨率 resolution	3.500 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	162123

Structure of a membrane-bound inositol phosphorylceramide synthase and ceramide complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol phosphorylceramide synthase catalytic subunit AUR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Inositol phosphorylceramide synthase regulatory subunit KEI1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9vj4__assembly_1__model_1

9vj4__assembly_1__model_1 | I(q)

9vj4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of a membrane-bound inositol phosphorylceramide synthase and ceramide complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inositol phosphorylceramide synthase catalytic subunit AUR1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Inositol phosphorylceramide synthase regulatory subunit KEI1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9vj4__assembly_1__model_1

9vj4__assembly_1__model_1 | I(q)

9vj4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)