SAXSdb — 9wph

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1 of capsid protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 360	VP2 of capsid protein × 60 （J9PGT1） VP3 of capsid protein × 60 （A0A1C6ZW66） VP4 of capsid protein × 60 （J9PGT1） pO18-10 VH × 60 pO18-10 VL × 60	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A1P8DYS7_9PICO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

VP2 of capsid protein

物种未注明

UniProt J9PGT1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 360	VP1 of capsid protein × 60 （A0A1P8DYS7） VP3 of capsid protein × 60 （A0A1C6ZW66） pO18-10 VH × 60 pO18-10 VL × 60	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	J9PGT1_9PICO
Isoform	—
PDB实体	2, 4
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–218； UniProt 287–504 作者链 4； PDB构建体 1–85； UniProt 202–286

VP3 of capsid protein

物种未注明

UniProt A0A1C6ZW66

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 360	VP1 of capsid protein × 60 （A0A1P8DYS7） VP2 of capsid protein × 60 （J9PGT1） VP4 of capsid protein × 60 （J9PGT1） pO18-10 VH × 60 pO18-10 VL × 60	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A1C6ZW66_9PICO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–220； UniProt 304–523

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9wph
沉积日期 deposition_date	2025-09-09
结构标题 title	Complex of FMDV O/18074 and porcine-derived neutralizing monoclonal antibody pO18-10
关键词 keywords	Foot-and-mouth disease virus O, Sus scrofa, VIRUS/IMMUNE SYSTEM, VIRUS, VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9wph__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9wph__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9wph__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	140.60 Å
总 Rg	140.80 Å
原子数	413340
残基数	53460
排除体积	7322200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9wph__assembly_1__model_1`	360-meric （360）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	VP1 of capsid protein
分子量 formula_weight	23686.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1
原子数 atom_count	6889

TTSAGESADPVTTTVENYGGETQAQRRQHTDVTFILDRFVKVKPQEEINVLDLMQIPAHTLVGALLRTATYYFSDLELAVKHEGDLTWVPNGAPEAALDNTTNPTAYHKEPLTRLALPYTAPHRVLATVYNGSNKYGDTSTNNVRGDLHVLAKNAERTLPTSFNYGAIKATRVTELLYRMKRAETYCPRPLLAIQPSTARHKQKIVAPVKQLL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	VP2 of capsid protein
分子量 formula_weight	24350.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

DKKTEETTLLEDRILTTRNGHTTSTTQSSVGVTYGYATAEDFVSGPNTSGLETRVVQAERFFKTHLFDWGTNDSFGRCHLLELPTDHKGVYGSLTDSYAYMRNGWDVEVTAVGNQFNGGCLLVAMVPELCSITKRELYQLTLFPHQFINPRTNMTAHITVPYLGVNRYDQYKVHKPWTLVVTVVAPLTVKNEGAPQIKVYANIAPTNVYVAGELPSKE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	VP3 of capsid protein
分子量 formula_weight	23886.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

GIFPVACSDGYGGLVTTDPKTADPVYGKVFNPPRNLLPGRFTNLLDVAEACPTFLRFDSDVPYVTTKTDSDRKLVQFDLSLAAKHMSNTFLAGLAQYYTQYSGTINLHFMFTGPTDAKARYMVAYAPPGMEPPTTPEAAAHCIHAEWDTGLNSKFTFSIPYLSAADYAYTASDVAETTNVQGWVCLFQITHGKADGDALVVLASAGKDFDLRLPVDARAQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	VP4 of capsid protein
分子量 formula_weight	8862.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

GAGQSSPTTGSQNQSGNTGSIINNYYMQQYQNSMDTQLGDNAISGGSNEGSTDTTSTHTNNTQNNDWFSKLANTAFSGLFGALLA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	pO18-10 VH
分子量 formula_weight	14042.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

EEKLLVESGGGLVQPGGSLRLSCVGSGFLFSRSEISWVRQAPGKGLEWLAVIYSSGEITYYADSVKGRFTISRDDSQNTAYLQMNSLRTEDTARYYCARDYTYGTECSDKWDGMDLWGPGVEVVVSS

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	pO18-10 VL
分子量 formula_weight	11446.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

QTVIQEPAMSVSPGGTVTLTCAFSSGSVTTSNYPSWYQQTPGQPPRQLIYQTNRRPTGVPSRFSGAISGNKATLTITGAQAEDEADYFCGLYKSCTNIFGGGTHLTVL

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.270 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.27 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	29102

Complex of FMDV O/18074 and porcine-derived neutralizing monoclonal antibody pO18-10

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP2 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

VP3 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wph__assembly_1__model_1

9wph__assembly_1__model_1 | I(q)

9wph__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Complex of FMDV O/18074 and porcine-derived neutralizing monoclonal antibody pO18-10

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

VP1 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP2 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

VP3 of capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wph__assembly_1__model_1

9wph__assembly_1__model_1 | I(q)

9wph__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)