SAXSdb — 9wt1

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pvc16 N-terminal domain-containing protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Putative phage tail sheath protein FI × 12 （A3HTC2） Phage tail protein × 12 （A3HTC1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC4_9BACT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 B； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 C； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 D； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 E； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196 作者链 F； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

Putative phage tail sheath protein FI

物种未注明

UniProt A3HTC2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Pvc16 N-terminal domain-containing protein × 6 （A3HTC4） Phage tail protein × 12 （A3HTC1）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC2_9BACT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1A； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 1B； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 1C； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 1D； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 1E； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 1F； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2A； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2B； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2C； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2D； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2E； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692 作者链 2F； PDB构建体 1–692； UniProt 1–692

Phage tail protein

物种未注明

UniProt A3HTC1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Pvc16 N-terminal domain-containing protein × 6 （A3HTC4） Putative phage tail sheath protein FI × 12 （A3HTC2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A3HTC1_9BACT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 1a； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1b； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1c； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1d； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1e； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 1f； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2a； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2b； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2c； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2d； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2e； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 2f； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9wt1
沉积日期 deposition_date	2025-09-15
结构标题 title	CryoEM structure of cap module in the contracted AlgoCIS
关键词 keywords	Contractile injection system, CryoEM, marine bacterium, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9wt1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9wt1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9wt1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	97.51 Å
Rg（电子密度）	95.34 Å
总 Rg	94.30 Å
原子数	80766
残基数	11088
排除体积	1415000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9wt1__assembly_1__model_1`	30-meric （30）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Pvc16 N-terminal domain-containing protein
分子量 formula_weight	22868.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	80766

MIFEVLKILTDEVNQNFKGLEMEDSEVVLNNVALIDSQQDVATELQNKVILSMINLREEVTMKNFPNNVLEGTKVTYKNPKNNINLFLIFCANRTGYKKSLSDLSRILEFFQHKSVFTQSNTSFDRDLEEMENVKNFRFTMELFTPTFEELNYIWGTLGGRQYPSVFYKLNLIVIDRDATTSEEGVITNIHRNYET

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Putative phage tail sheath protein FI
分子量 formula_weight	76319.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1A,2A,1B,2B,1C,2C,1D,2D,1E,2E,1F,2F

MATYKTPGVYIEEITKFPPSVAQVETAIPAFIGYTQFARTKPSVDSDDLILKPKRISSLLDFTTYYGGAQNEQGITVKLTDTLIEGAENRTINVPEPTFKSPYLMFYSLQMYFANGGGPCYIVSTGVYDDWSDSETPPTINFSDLESGLAVIRKEDEPTLLLFPDATNLPTDDEFYSLYNSALMQCNDLQDRFTILDTYSDQTYNDGVEDLDPIPALRNGINLTKDYLKYGAAYYPFVQTILNYQYSADEIVIQHLSYNPNAIATALDNLNAVNGPTFIDAILDDLRDLSLPDISGEISDAVGFMYDDVDGFDIDGTFTTNSVKVANFASLVESVLSTLNELIDAKEEINKDVNSAIASSEEDNAIKTAISDALDVFNEDFEGADKIESVAKNLSDLLIKIKQADTNTKVENVLSINALNFSAEFEKLLTYDVNTGLTASVTLDLFANIGTRLDDIIAAVSAAEPIDVNNGKLNGRLLSDIEPLDNATYNTILLEINSHKVTLPPSSSMAGAYARVDNDRGVWKSPANIGLNYVSKPSVTVSHEEQESMNVHGTGKSVNAIRSFVGKGTLVWGARTLAGNDNEWRYISVRRFFNMAEESIKKATEQFVFEPNDGNTWVRVRAMIENFLILQWRAGALAGAKPEHAFYVKVGLGQTMTAQDILEGNMNVEIGLAVVRPAEFIILKFSHKMQES

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Phage tail protein
分子量 formula_weight	16375.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1a,2a,1b,2b,1c,2c,1d,2d,1e,2e,1f,2f

MSYPLSKFHFSVEWGGTKIGFTEVSGLDLETEIIEYRHGASPEYSKIKMPGMQKFSNITLKRGTFKSDNEYFQWYNTINLNKVERRDLTISLLNEEHEPVVTWKVKNAWPLKVQSTDLKGDGNEVAIESMELAHEGLVIQNE

▶

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	12926

CryoEM structure of cap module in the contracted AlgoCIS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pvc16 N-terminal domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Putative phage tail sheath protein FI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Phage tail protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wt1__assembly_1__model_1

9wt1__assembly_1__model_1 | I(q)

9wt1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

CryoEM structure of cap module in the contracted AlgoCIS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pvc16 N-terminal domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Putative phage tail sheath protein FI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Phage tail protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9wt1__assembly_1__model_1

9wt1__assembly_1__model_1 | I(q)

9wt1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)