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9yi6

Cryo-EM structure of yeast Mgm101 bound to 83-mer ssDNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitochondrial genome maintenance protein MGM101

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32787

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 × 19 DNA 1 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 23–269 链 B； UniProt 23–269 链 C； UniProt 23–269 链 D； UniProt 23–269 链 E； UniProt 23–269 链 F； UniProt 23–269 链 G； UniProt 23–269 链 H； UniProt 23–269 链 I； UniProt 23–269 链 J； UniProt 23–269 链 K； UniProt 23–269 链 L； UniProt 23–269 链 M； UniProt 23–269 链 N； UniProt 23–269 链 O； UniProt 23–269 链 P； UniProt 23–269 链 Q； UniProt 23–269 链 R； UniProt 23–269 链 S； UniProt 23–269 未记录 ssDNA (83-) × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.54 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9YI6 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
9YI7 Cryo-EM structure of yeast Mgm101 bound to duplex DNA annealing intermediate 提交 2025-10-01 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 A 23–269（247 aa）
链 B 23–269（247 aa）
链 C 23–269（247 aa）
链 D 23–269（247 aa）
链 E 23–269（247 aa）
链 F 23–269（247 aa）
链 G 23–269（247 aa）
链 H 23–269（247 aa）
链 I 23–269（247 aa）
链 J 23–269（247 aa）
链 K 23–269（247 aa）
链 L 23–269（247 aa）
链 M 23–269（247 aa）
链 N 23–269（247 aa）
链 O 23–269（247 aa）
链 P 23–269（247 aa）
链 Q 23–269（247 aa）
链 R 23–269（247 aa）
链 S 23–269（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
9YI8 Cryo-EM structure of yeast Mgm101 bound to apparent B-form DNA 提交 2025-10-01 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 A 23–269（247 aa）
链 B 23–269（247 aa）
链 C 23–269（247 aa）
链 D 23–269（247 aa）
链 E 23–269（247 aa）
链 F 23–269（247 aa）
链 G 23–269（247 aa）
链 H 23–269（247 aa）
链 I 23–269（247 aa）
链 J 23–269（247 aa）
链 K 23–269（247 aa）
链 L 23–269（247 aa）
链 M 23–269（247 aa）
链 N 23–269（247 aa）
链 O 23–269（247 aa）
链 P 23–269（247 aa）
链 Q 23–269（247 aa）
链 R 23–269（247 aa）
链 S 23–269（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
9YI9 Cryo-EM structure of yeast Mgm101 in the lock-washer apo state 提交 2025-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric
链 A 23–269（247 aa）
链 B 23–269（247 aa）
链 C 23–269（247 aa）
链 D 23–269（247 aa）
链 E 23–269（247 aa）
链 F 23–269（247 aa）
链 G 23–269（247 aa）
链 H 23–269（247 aa）
链 I 23–269（247 aa）
链 J 23–269（247 aa）
链 K 23–269（247 aa）
链 L 23–269（247 aa）
链 M 23–269（247 aa）
链 N 23–269（247 aa）
链 O 23–269（247 aa）
链 P 23–269（247 aa）
链 R 23–269（247 aa）
链 S 23–269（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9YIA Cryo-EM structure of yeast Mgm101 in the ring apo state 提交 2025-10-01 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 A 23–269（247 aa）
链 B 23–269（247 aa）
链 C 23–269（247 aa）
链 D 23–269（247 aa）
链 E 23–269（247 aa）
链 F 23–269（247 aa）
链 G 23–269（247 aa）
链 H 23–269（247 aa）
链 I 23–269（247 aa）
链 J 23–269（247 aa）
链 K 23–269（247 aa）
链 L 23–269（247 aa）
链 M 23–269（247 aa）
链 N 23–269（247 aa）
链 O 23–269（247 aa）
链 P 23–269（247 aa）
链 Q 23–269（247 aa）
链 R 23–269（247 aa）
链 S 23–269（247 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MG101_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 B； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 C； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 D； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 E； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 F； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 G； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 H； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 I； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 J； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 K； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 L； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 M； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 N； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 O； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 P； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 Q； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 R； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269 作者链 S； PDB构建体 10–256； UniProt 23–269

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9yi6
沉积日期 deposition_date2025-10-01
结构标题 titleCryo-EM structure of yeast Mgm101 bound to 83-mer ssDNA
关键词 keywordsSingle strand annealing protein, SSAP, annealase, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (0)