9yuz

Structure of the human 20S proteasome in complex with a beta5-selective covalent syringolin analogue inhibitor.

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 O； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Proteasome subunit alpha type-4

Homo sapiens

UniProt P25789

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261 作者链 P； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

Proteasome subunit alpha type-7

Homo sapiens

UniProt O14818

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248 作者链 Q； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248

Proteasome subunit alpha type-5

Homo sapiens

UniProt P28066

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–241； UniProt 1–241 作者链 R； PDB构建体 1–241； UniProt 1–241

Proteasome subunit alpha type-1

Homo sapiens

UniProt P25786

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263 作者链 S； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263

Proteasome subunit alpha type-3

Homo sapiens

UniProt P25788

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255 作者链 T； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

Proteasome subunit alpha type-6

Homo sapiens

UniProt P60900

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 U； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

Proteasome subunit beta type-7

Homo sapiens

UniProt Q99436

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277 作者链 V； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277

Proteasome subunit beta type-3

Homo sapiens

UniProt P49720

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205 作者链 W； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

Proteasome subunit beta type-2

Homo sapiens

UniProt P49721

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201 作者链 X； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201

Proteasome subunit beta type-5

Homo sapiens

UniProt P28074

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263 作者链 Y； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263

Proteasome subunit beta type-1

Homo sapiens

UniProt P20618

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–241； UniProt 1–241 作者链 Z； PDB构建体 1–241； UniProt 1–241

Proteasome subunit beta type-4

Homo sapiens

UniProt P28070

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-6 × 2 （P28072） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264 作者链 a； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

Proteasome subunit beta type-6

Homo sapiens

UniProt P28072

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P25787） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P25789） Proteasome subunit alpha type-7 × 2 （O14818） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P28066） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P25786） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P25788） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P60900） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （Q99436） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P49720） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P49721） Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28074） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P20618） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P28070） ;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ; × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–239； UniProt 1–239 作者链 b； PDB构建体 1–239； UniProt 1–239

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9yuz
沉积日期 deposition_date	2025-10-23
结构标题 title	Structure of the human 20S proteasome in complex with a beta5-selective covalent syringolin analogue inhibitor.
关键词 keywords	Proteasome, 20S, Inhibitor, Covalent, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9yuz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9yuz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9yuz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.52 Å
Rg（电子密度）	59.16 Å
总 Rg	59.26 Å
原子数	46426
残基数	6246
排除体积	829940 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9yuz__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-2
分子量 formula_weight	25927.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,O
原子数 atom_count	46426

MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMGPDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKATAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-4
分子量 formula_weight	29525.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,P

MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGITSDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWKATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKHEEEEAKAEREKKEKEQKEKDK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-7
分子量 formula_weight	27929.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,Q

MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADARIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANAIGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENEKKKQKKAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-5
分子量 formula_weight	26436.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,R

MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-1
分子量 formula_weight	29595.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,S

MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTADARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMSIGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-3
分子量 formula_weight	28469.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,T

MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAGLLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYGYWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYAKESLKEEDESDDDNM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-6
分子量 formula_weight	27432.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,U

MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVMTGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYYCGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLVALAERD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-7
分子量 formula_weight	30000.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,V

MAAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTRLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-3
分子量 formula_weight	22972.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,W

MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGRQIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDPDHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-2
分子量 formula_weight	22864.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,X

MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAAANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELLRKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-5
分子量 formula_weight	28510.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,Y

MALASVLERPLPVNQRGFFGLGGRADLLDLGPGSLSDGLSLAAPGWGVPEEPGIEMLHGTTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAASKLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAIYQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-1
分子量 formula_weight	26522.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Z

MLSSTAMYSAPGRDLGMEPHRAAGPLQLRFSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNNKAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQNVEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-4
分子量 formula_weight	29231.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,a

MEAFLGSRSGLWAGGPAPGQFYRIPSTPDSFMDPASALYRGPITRTQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDGHSYSPRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVLSQTEARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-6
分子量 formula_weight	25377.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,b

MAATLLAARGAGPAPAWGPEAFTPDWESREVSTGTTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAASLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANALALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	;methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8S)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate ;
分子量 formula_weight	625.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	50210

Structure of the human 20S proteasome in complex with a beta5-selective covalent syringolin analogue inhibitor.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体