9zb5

Cryo-EM structure of the parainfluenza virus hemagglutinin-neuraminidase protein in complex with the human antibodies PIV3HN-05 and PIV3HN-13

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin-neuraminidase

Human respirovirus 3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 10 其他聚合物 2	PIV3HN-05 heavy chain × 2 PIV3HN-05 light chain × 2 PIV3HN-13 heavy chain × 2 PIV3HN-13 light chain × 2 ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(5-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2 alpha-L-fucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q81080_9MONO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 14–461； UniProt 125–572 作者链 J； PDB构建体 14–461； UniProt 125–572

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9zb5
沉积日期 deposition_date	2025-11-20
结构标题 title	Cryo-EM structure of the parainfluenza virus hemagglutinin-neuraminidase protein in complex with the human antibodies PIV3HN-05 and PIV3HN-13
关键词 keywords	antibody, viral protein, complex, ANTIVIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9zb5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9zb5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9zb5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	40.51 Å
Rg（电子密度）	39.94 Å
总 Rg	40.24 Å
原子数	13658
残基数	1800
排除体积	241480 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9zb5__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PIV3HN-05 heavy chain
分子量 formula_weight	26359.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D
原子数 atom_count	13658

EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCVASGLSLSPNWMHWVRQAPGKGLVWVSRISDNGDTTNYAGSVMGRFTISRDNAKNTLYLQMNNLRADDTAVYFCVRESAVISSPSWGLYDTAYHFDPWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PIV3HN-05 light chain
分子量 formula_weight	22877.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,H

QSVLTQPPSASGTPGQGVTISCSGSNSNIGTNAVDWYQQFPGTAPRLLIFNDNQRPSGVPDRFSGSRSGTSASLAISGLQSEDEAVYYCATWDDSLNGPVVFGGGTKLTVLRQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPTECS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Hemagglutinin-neuraminidase
分子量 formula_weight	51625.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,J

HHHHHHSLVPRGSISEITIRNDNQEVLPQRITHDVGIKPLNPDDFWRCTSGLPSLMKTPKIRLMPGPGLLAMPTTVDGCVRTPSLVINDLIYAYTSNLITRGCQDIGKSYQVLQIGIITVNSDLVPDLNPRISHTFNINDNRKSCSLALLNTDVYQLCSTPKVDERSDYASSGIEDIVLDIVNYDGSISTTRFKNNNISFDQPYAALYPSVGPGIYYKGKIIFLGYGGLEHPINENVICNTTGCPGKTQRDCNQASHSPWFSDRRMVNSIIVADKGLNSIPKLKVWTISMRQNYWGSEGRLLLLGNKIYIYTRSTSWHSKLQLGIIDITDYSDIRIKWTWHNVLSRPGNNECPWGHSCPDGCITGVYTDAYPLNPTGSIVSSVILDSQKSRVNPVITYSTATERVNELAILNRTLSAGYTTTSCITHYNKGYCFHIVEINHKSLNTFQPMLFKTEIPKSCS

来源 Source

来源生物 organism	Human respirovirus 3
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11216
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PIV3HN-13 heavy chain
分子量 formula_weight	25321.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,M

EVQLLESGGALVQPGGSLRVSCAASGFSFSSYAMSWLRQTPGKGLEWVSAIGGSGHSTYYADSVQGRFTVSRDNSKDTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKFFRSDGVFHFDYWGPGNPGSPSPASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PIV3HN-13 light chain
分子量 formula_weight	23785.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,N

DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLRHSDGNNYLDWYLQKPGQSPQLLIYLGSNRASGVPDRFSGSGSGSDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQALQTPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(5-6)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	773.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	alpha-L-fucopyranose
分子量 formula_weight	164.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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分辨率 resolution	3.29 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	343

Cryo-EM structure of the parainfluenza virus hemagglutinin-neuraminidase protein in complex with the human antibodies PIV3HN-05 and PIV3HN-13

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin-neuraminidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9zb5__assembly_1__model_1

9zb5__assembly_1__model_1 | I(q)

9zb5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the parainfluenza virus hemagglutinin-neuraminidase protein in complex with the human antibodies PIV3HN-05 and PIV3HN-13

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin-neuraminidase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9zb5__assembly_1__model_1

9zb5__assembly_1__model_1 | I(q)

9zb5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)