9zrz

Cryo-EM structure of SHIV-elicited CI93-1365 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 145.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope gp120

Human immunodeficiency virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 8 其他聚合物 37 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 30–497 链 c； UniProt 502–654 链 d； UniProt 30–497 链 e； UniProt 502–654 链 f； UniProt 30–497 链 g； UniProt 502–654	未记录	CI93-1365 heavy chain × 1 CI93-1365 light chain × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 3 ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9ZRZ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4YDI Crystal structure of broad and potently neutralizing VRC01-class antibody Z258-VRC27.01, isolated from human donor Z258, in complex with HIV-1 gp120 from clade A strain Q23.17 提交 2015-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 43–122（80 aa）片段：UNP residues 43-122, 191-293, 315-482 链 G 191–293（103 aa）片段：UNP residues 43-122, 191-293, 315-482 链 G 315–482（168 aa）片段：UNP residues 43-122, 191-293, 315-482	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；4% PEG 400, 1.9 M (NH4)2SO4, 0.1M Tris-HCl, pH 8.5	分辨率 3.45 Å R-free 0.276
7LLK Cryo-EM structure of Q23.17_DS-SOSIP in complex with Glycan276-Dependent Broadly Neutralizing Antibody 179NC75 Fab 提交 2021-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 31–498（468 aa）链 E 31–498（468 aa）链 I 31–498（468 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 2.5 S before plunging	分辨率 4.80 Å
9BNL Cryo-EM structure of rhesus antibody 6070-a.01 in complex with HIV-1 Env trimer Q23.17 MD39 提交 2024-05-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 32–495（464 aa）链 B 510–651（142 aa）链 C 32–495（464 aa）链 E 32–495（464 aa）链 F 510–651（142 aa）链 G 510–651（142 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9BTV Cryo-EM structure of rhesus antibody T646-a.01 in complex with HIV-1 Env trimer Q23.17 MD39 提交 2024-05-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 30–498（469 aa）链 B 502–654（153 aa）链 C 30–498（469 aa）链 E 30–498（469 aa）链 F 502–654（153 aa）链 G 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
9DHW Q23.MD39 in Complex with Fabs from antibodies CH01 iGL and 35O22 提交 2024-09-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 31–497（467 aa）链 B 502–654（153 aa）链 C 31–497（467 aa）链 D 502–654（153 aa）链 G 31–497（467 aa）链 I 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；1X PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9DIM Q23.MD39 in Complex with Fab from antibody 35O22 提交 2024-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 31–497（467 aa）链 B 502–654（153 aa）链 C 31–497（467 aa）链 D 502–654（153 aa）链 G 31–497（467 aa）链 I 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 19	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；1X PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9NVV Cryo-EM structure of V2 apex germline-targeting HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 b 30–584（555 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–584（555 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–584（555 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9NVW Cryo-EM structure of rhesus antibody CH35-Apex1.08 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9NVX Cryo-EM structure of rhesus antibody CI91-Apex1.01 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9NVY Cryo-EM structure of rhesus antibody CH70-Apex2.01 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 32	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9NVZ Cryo-EM structure of rhesus antibody CH70-Apex1.01 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9NW0 Cryo-EM structure of rhesus antibody CH42-Apex1.01 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9NW1 Cryo-EM structure of rhesus antibody CH42-Apex2.01 in complex with HIV Env trimer Q23-APEX-GT2 提交 2025-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–507（478 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–507（478 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–507（478 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9Z9L Q23.MD39 in Complex with Fabs from antibodies CH01 and 35O22 提交 2025-11-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 31–497（467 aa）链 B 502–654（153 aa）链 C 31–497（467 aa）链 D 502–654（153 aa）链 G 31–497（467 aa）链 I 502–654（153 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；1X PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
9ZRX Cryo-EM structure of SHIV-elicited CE79-1571 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27 提交 2025-12-21	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–497（468 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–497（468 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–497（468 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å
9ZRY Cryo-EM structure of SHIV-elicited CN81-2029 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27 提交 2025-12-21	当前字段一致	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 b 30–497（468 aa）链 c 502–654（153 aa）链 d 30–497（468 aa）链 e 502–654（153 aa）链 f 30–497（468 aa）链 g 502–654（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.90 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O55774_HV1
Isoform	—
PDB实体	3, 4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 36–503； UniProt 30–497 作者链 d； PDB构建体 36–503； UniProt 30–497 作者链 f； PDB构建体 36–503； UniProt 30–497 作者链 c； PDB构建体 1–153； UniProt 502–654 作者链 e； PDB构建体 1–153； UniProt 502–654 作者链 g； PDB构建体 1–153； UniProt 502–654

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9zrz
沉积日期 deposition_date	2025-12-21
结构标题 title	Cryo-EM structure of SHIV-elicited CI93-1365 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27
关键词 keywords	immune complex, neutralization, SHIV, HIV V2 apex, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.85 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.15 Å
零角强度 I(0) i0	922085000.00
分子量 molecular_weight	245760.0 kDa
排除体积 excluded_volume	305600 Å³
包络体积 envelope_volume	438730 Å³
水化壳体积 shell_volume	80485 Å³
包络直径 envelope_diameter	160.9 Å
壳层 Rg shell_rg	51.05 Å
包络 Rg envelope_rg	43.58 Å
形状 Rg shape_rg	44.15 Å
总 Rg total_rg	44.42 Å
总原子数 total_atoms	17204
残基数 n_residues	1952
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	145.8 Å
Rg (实空间) rg_real	44.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.27 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.2210e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8570e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.85 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	922300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8778
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	62.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.168
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.335
角度范围 angular_range	— – 0.1750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	117400000.0000
实空间数据点数 n_real_points	36
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.854; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.849

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CI93-1365 heavy chain
分子量 formula_weight	26700.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	17204

EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNYGIYWVRQASGKGLEWIGRVRSKANSYETGYAASLGGRFTISREDSRDTSYLQMNSLKTDDTAVYYCATGPQEDYYADDYGDYYTENYGLDSWGQGVVVTVSSASTKGPSVFPLAPSSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGSLTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYVCNVNHKPSNTKVDKRVEIKTCGGHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Macaca mulatta
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9544
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CI93-1365 light chain
分子量 formula_weight	23142.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTVTCRASQGIGDSVNWYQQKPGKAPKRLIHAASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYHCLQYNSDPLTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSEDQVKSGTVSVVCLLNNFYPREASVKWKVDGALKTGNSQESVTEQDSKDNTYSLSSTLTLSSTEYQSHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Macaca mulatta
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9544
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Envelope gp120
分子量 formula_weight	56731.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,d,f

MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSPSQEIHARFRRGARAENLWVTVYYGVPVWRDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLDNVTEKFNMWKNNMVEQMHTDIISLWDQSLKPCVKLTPLCVTLHCTNVTSVNTTGDREELKNCSFNMTTELRDKRQKVYSLFYRLDIVPINENQGSEYRLINCNTSACTQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDEGFNGTGLCKNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEKNITIRSENITNNAKIIIVQLVQPVTIKCIRPNNYTRKSIRIGPGQAFYAMGDIIGDIRQAHCNVSRSRWNKTLQEVAEKLRTYFGNKTIIFANSSGGDLEITTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWYVNSTWNDTDSTQESNDTITLPCRIKQIINMWQRAGQCMYAPPIPGVIKCESNITGLLLTRDGGKDNNVNETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVEIEPLGVAPTRCKRRVVE

来源 Source

来源生物 organism	Human immunodeficiency virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12721
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Envelope gp41 ectodomain
分子量 formula_weight	17205.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,e,g

AVGIGAVRRGFLGAAGSTMGAASITLTVQARQLLSGIVQPQNNLLRAPEAQQHLLKLGVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQLLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNKSLDEIWNNMTWLQWDKEIGNYTQLIYRLIEESQNQQEKNEKELLALD

来源 Source

来源生物 organism	Human immunodeficiency virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12721
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	29

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 7 Entity 7 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	910.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 branched

描述 description	;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1397.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	32

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.90 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	132734

fit	/app/data/saxs_computation/zr/9zrz/9zrz.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zr/9zrz/9zrz.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zr/9zrz/9zrz.dat

Cryo-EM structure of SHIV-elicited CI93-1365 Fab in complex with HIV Env trimer Q23-SCT27

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope gp120

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 branched

实体 8 Entity 8 branched

实体 9 Entity 9 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)