SAXSdb — 9ztc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,3-beta-glucan synthase component FKS1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–1876	突变：S643P	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9ZTC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7XE4 structure of a membrane-bound glycosyltransferase 提交 2022-03-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–1876（1876 aa）	未记录	DD9 nonane × 7 D10 DECANE × 6 C14 TETRADECANE × 1 HP6 HEPTANE × 7 D12 DODECANE × 3 XKP (11R,14S)-17-amino-14-hydroxy-8,14-dioxo-9,13,15-trioxa-14lambda~5~-phosphaheptadecan-11-yl decanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7YUY Structure of a mutated membrane-bound glycosyltransferase 提交 2022-08-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–1876（1876 aa）	突变：S643P	DD9 nonane × 7 D10 DECANE × 6 C14 TETRADECANE × 1 HP6 HEPTANE × 7 D12 DODECANE × 3 XKP (11R,14S)-17-amino-14-hydroxy-8,14-dioxo-9,13,15-trioxa-14lambda~5~-phosphaheptadecan-11-yl decanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8JZN Structure of a fungal 1,3-beta-glucan synthase 提交 2023-07-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 2 AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 2 ERG ERGOSTEROL × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.47 Å
8WL6 Structure of 1,3-beta-glucan synthase component FKS1 提交 2023-09-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
8WLA Cryo-EM structure of the beta-1,3-glucan synthase FKS1-Rho1 complex 提交 2023-09-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–1876（1876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9PE1 Structure of beta-1,3-glucan synthase in complex with caspofungin, Rho1 and long glucan 提交 2025-07-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 29 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 A1CHR (10R,12S)-10,12-dimethyltetradecanoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
9PE2 Structure of beta-1,3-glucan synthase from Saccharomyces cerevisiae (ScFks1) in complex with short glucan 提交 2025-07-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 29 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
9PE3 Structure of beta-1,3-glucan synthase from Saccharomyces cerevisiae (ScFks1) at the catalytically relevant ground state 提交 2025-07-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 22 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
9PE4 Structure of beta-1,3-glucan synthase from Saccharomyces cerevisiae (ScFks1) at the catalytically less relevant L2 state 提交 2025-07-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 7 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 LMN Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
9PE5 Structure of beta-1,3-glucan synthase from Saccharomyces cerevisiae (ScFks1) at the catalytically less relevant L1 state 提交 2025-07-01	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 7 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 LMN Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9UTU Structure of Fks1 in complex with YMR295C 提交 2025-05-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–1876（1876 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
9UTW Structure of dimeric FKS1 in complex with tRNA 提交 2025-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 1–1876（1876 aa）链 H 1–1876（1876 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 DD9 nonane × 8 D10 DECANE × 2 HP6 HEPTANE × 6 XKP (11R,14S)-17-amino-14-hydroxy-8,14-dioxo-9,13,15-trioxa-14lambda~5~-phosphaheptadecan-11-yl decanoate × 2 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 2 PLM PALMITIC ACID × 16 DCR icosanoic acid × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å
9WY1 Cryo-EM structure of Fks1 in apo state 提交 2025-09-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 AV0 Lauryl Maltose Neopentyl Glycol × 2 ERG ERGOSTEROL × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9WZU Cryo-EM structure of Fks1 in complex with enfumafungin 提交 2025-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	ERG ERGOSTEROL × 9 A1E06 Enfumafungin × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
9WZV Cryo-EM structure of Fks1 with intact active site 提交 2025-09-29	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1876（1876 aa）	未记录	ERG ERGOSTEROL × 21 A1E06 Enfumafungin × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
9WZX Cryo-EM structure of Fks1 in open state 提交 2025-09-29	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–1876（1876 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.72 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FKS1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1876； UniProt 1–1876

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ztc
沉积日期 deposition_date	2025-12-23
结构标题 title	Beta-1,3-glucan synthase Fks1 S643P from Saccharomyces Cerevisiae
关键词 keywords	Enzyme, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.07 Å
零角强度 I(0) i0	290811000.00
分子量 molecular_weight	143520.0 kDa
排除体积 excluded_volume	181390 Å³
包络体积 envelope_volume	247300 Å³
水化壳体积 shell_volume	55257 Å³
包络直径 envelope_diameter	124.8 Å
壳层 Rg shell_rg	43.66 Å
包络 Rg envelope_rg	36.44 Å
形状 Rg shape_rg	37.05 Å
总 Rg total_rg	37.59 Å
总原子数 total_atoms	19414
残基数 n_residues	1350
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	123.9 Å
Rg (实空间) rg_real	37.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.9080e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.3420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.82 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	290800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8952
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	44.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.277
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.491
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	43110000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.912; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.898

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	1,3-beta-glucan synthase component FKS1
分子量 formula_weight	221262.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.4.1.34
突变 mutation	S643P
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	19414

MNTDQQPYQGQTDYTQGPGNGQSQEQDYDQYGQPLYPSQADGYYDPNVAAGTEADMYGQQPPNESYDQDYTNGEYYGQPPNMAAQDGENFSDFSSYGPPGTPGYDSYGGQYTASQMSYGEPNSSGTSTPIYGNYDPNAIAMALPNEPYPAWTADSQSPVSIEQIEDIFIDLTNRLGFQRDSMRNMFDHFMVLLDSRSSRMSPDQALLSLHADYIGGDTANYKKWYFAAQLDMDDEIGFRNMSLGKLSRKARKAKKKNKKAMEEANPEDTEETLNKIEGDNSLEAADFRWKAKMNQLSPLERVRHIALYLLCWGEANQVRFTAECLCFIYKCALDYLDSPLCQQRQEPMPEGDFLNRVITPIYHFIRNQVYEIVDGRFVKRERDHNKIVGYDDLNQLFWYPEGIAKIVLEDGTKLIELPLEERYLRLGDVVWDDVFFKTYKETRTWLHLVTNFNRIWVMHISIFWMYFAYNSPTFYTHNYQQLVDNQPLAAYKWASCALGGTVASLIQIVATLCEWSFVPRKWAGAQHLSRRFWFLCIIFGINLGPIIFVFAYDKDTVYSTAAHVVAAVMFFVAVATIIFFSIMPLGGLFTSYMKKSTRRYVASQTFTAAFAPLHGLDRWMSYLVWVTVFAAKYSESYYFLVLPLRDPIRILSTTAMRCTGEYWWGAVLCKVQPKIVLGLVIATDFILFFLDTYLWYIIVNTIFSVGKSFYLGISILTPWRNIFTRLPKRIYSKILATTDMEIKYKPKVLISQVWNAIIISMYREHLLAIDHVQKLLYHQVPSEIEGKRTLRAPTFFVSQDDNNFETEFFPRDSEAERRISFFAQSLSTPIPEPLPVDNMPTFTVLTPHYAERILLSLREIIREDDQFSRVTLLEYLKQLHPVEWECFVKDTKILAEETAAYEGNENEAEKEDALKSQIDDLPFYCIGFKSAAPEYTLRTRIWASLRSQTLYRTISGFMNYSRAIKLLYRVENPEIVQMFGGNAEGLERELEKMARRKFKFLVSMQRLAKFKPHELENAEFLLRAYPDLQIAYLDEEPPLTEGEEPRIYSALIDGHCEILDNGRRRPKFRVQLSGNPILGDGKSDNQNHALIFYRGEYIQLIDANQDNYLEECLKIRSVLAEFEELNVEQVNPYAPGLRYEEQTTNHPVAIVGAREYIFSENSGVLGDVAAGKEQTFGTLFARTLSQIGGKLHYGHPDFINATFMTTRGGVSKAQKGLHLNEDIYAGMNAMLRGGRIKHCEYYQCGKGRDLGFGTILNFTTKIGAGMGEQMLSREYYYLGTQLPVDRFLTFYYAHPGFHLNNLFIQLSLQMFMLTLVNLSSLAHESIMCIYDRNKPKTDVLVPIGCYNFQPAVDWVRRYTLSIFIVFWIAFVPIVVQELIERGLWKATQRFFCHLLSLSPMFEVFAGQIYSSALLSDLAIGGARYISTGRGFATSRIPFSILYSRFAGSAIYMGARSMLMLLFGTVAHWQAPLLWFWASLSSLIFAPFVFNPHQFAWEDFFLDYRDYIRWLSRGNNQYHRNSWIGYVRMSRARITGFKRKLVGDESEKAAGDASRAHRTNLIMAEIIPCAIYAAGCFIAFTFINAQTGVKTTDDDRVNSVLRIIICTLAPIAVNLGVLFFCMGMSCCSGPLFGMCCKKTGSVMAGIAHGVAVIVHIAFFIVMWVLESFNFVRMLIGVVTCIQCQRLIFHCMTALMLTREFKNDHANTAFWTGKWYGKGMGYMAWTQPSRELTAKVIELSEFAADFVLGHVILICQLPLIIIPKIDKFHSIMLFWLKPSRQIRPPIYSLKQTRLRKRMVKKYCSLYFLVLAIFAGCIIGPAVASAKIHKHIGDSLDGVVHNLFQPINTTNNDTGSQMSTYQSHYYTHTPSLKTWSTIKLEVLFQGPAAAGSAGSAAGSGEFDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDKHHHHHHHHHH

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子量 formula_weight	486.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.500 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	194636

fit	/app/data/saxs_computation/zt/9ztc/9ztc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zt/9ztc/9ztc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zt/9ztc/9ztc.dat

Beta-1,3-glucan synthase Fks1 S643P from Saccharomyces Cerevisiae

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,3-beta-glucan synthase component FKS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)