当前蛋白身份:A0A0C4DGV4 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6B9X Crystal structure of Ragulator 提交 2017-10-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–173(173 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292 K;0.1 M CHES pH 9.0, 40% PEG 600
分辨率 1.42 Å R-free 0.237
6NZD Cryo-EM Structure of the Lysosomal Folliculin Complex (FLCN-FNIP2-RagA-RagC-Ragulator) 提交 2019-02-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 E 1–173(173 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Whatman 597
分辨率 3.60 Å
6WJ2 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the pre-GAP state 提交 2020-04-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–173(173 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 L8S 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(thiophosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-L-arabinofuranosyl}-3,9-dihydro-1H-purine-2,6-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6WJ3 CryoEM structure of the SLC38A9-RagA-RagC-Ragulator complex in the post-GAP state 提交 2020-04-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 1–173(173 aa)
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 U3J xanthosine diphosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 G 1–173(173 aa)
未记录 CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å