当前蛋白身份:A0A0H3UK16 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6MZN Zebrafish betaglycan orphan domain structure from tetragonal crystal form 提交 2018-11-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–359(331 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;8% v/v PEG 5K mono methyl ether, 4% w/v PEG 20K, 0.1M MES pH 6.5
分辨率 2.38 Å R-free 0.229
6MZP Zebrafish betaglycan orphan domain structure from orthorhombic crystal form 提交 2018-11-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–359(331 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;9.2% v/v PEG 5K mono methyl ether, 4.6% w/v PEG 20K, 0.1M MES pH 6.2
分辨率 2.10 Å R-free 0.258
6MZP Zebrafish betaglycan orphan domain structure from orthorhombic crystal form 提交 2018-11-05 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 29–359(331 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;9.2% v/v PEG 5K mono methyl ether, 4.6% w/v PEG 20K, 0.1M MES pH 6.2
分辨率 2.10 Å R-free 0.258
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 29–359(331 aa)
突变:C150G,C277G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 29–359(331 aa)
突变:C150G,C277G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 29–359(331 aa)
突变:C150G,C277G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9FKP Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-06-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 C 29–359(331 aa)
突变:C150G,C277G 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å