当前蛋白身份：A0A2T1LEK9
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6ORE Release complex 70S 提交 2019-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 436 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6ORL RF1 pre-accommodated 70S complex at 24 ms 提交 2019-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 295 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6OSK RF1 accommodated 70S complex at 60 ms 提交 2019-05-01 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 307 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6OSQ RF1 accommodated state bound Release complex 70S at long incubation time point 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 436 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6OST RF2 pre-accommodated state bound Release complex 70S at 24ms 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6OT3 RF2 accommodated state bound Release complex 70S at 24 ms 提交 2019-05-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6OUO RF2 accommodated state bound 70S complex at long incubation time 提交 2019-05-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYX Escherichia coli transcription-translation complex C4 (TTC-C4) containing mRNA with a 21 nt long spacer, transcription factor NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VZ3 Escherichia coli transcription-translation complex D2 (TTC-D2) containing mRNA with a 27 nt long spacer 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 6VZ7 Escherichia coli transcription-translation complex C1 (TTC-C1) containing a 27 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VZJ Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing mRNA with a 15 nt long spacer, fMet-tRNAs at E-site and P-site, and lacking transcription factor NusG 提交 2020-02-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–119（119 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7M5D Cryo-EM structure of a non-rotated E.coli 70S ribosome in complex with RF3-GTP, RF1 and P-tRNA (state I) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–119（119 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8G2U Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:control-apo-70S at 900ms 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8G31 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:2nd Intermediate 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8G34 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:1st intermediate 提交 2023-02-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8G38 Time-resolved cryo-EM study of the 70S recycling by the HflX:3rd Intermediate 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8T5D Cryo-EM studies of the interplay between uS2 ribosomal protein and leaderless mRNA during bacterial translation initiation 提交 2023-06-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8T5H Cryo-EM studies of the interplay between uS2 ribosomal protein and leaderless mRNA during bacterial translation initiation 提交 2023-06-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8VUP E. coli 70S ribosome with unmodified tRNAPro(GGG) in the e*/E conformation on a slippery CCC-C codon 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–120（120 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 239 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9AX8 70S initiation complex (tRNA-fMet M1, initiation factor 2 + CUG start codon) 提交 2024-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–120（120 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 287 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |