当前蛋白身份：A0A5B9AW69
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8G00 Cryo-EM structure of 3DVA component 0 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-01-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–235（235 aa）
链 H
1–239（239 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT
IN A CHAMBER WITH THE
TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES
CELSIUS.
|
分辨率 3.40 Å |
| 8G1S Cryo-EM structure of 3DVA component 1 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-02-02 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–235（235 aa）
链 H
1–235（235 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM TRIS-HCl, pH 7.5; 100 mM potassium chloride, 1mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in a chamber with the temperature set to 4 C.
|
分辨率 3.70 Å |
| 8G2W Cryo-EM structure of 3DVA component 2 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-02-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–234（234 aa）
链 H
1–234（234 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT
IN A CHAMBER WITH THE
TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES
CELSIUS.
|
分辨率 3.70 Å |
| 8G4W Cryo-EM consensus structure of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase plus preQ1 ligand 提交 2023-02-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–234（234 aa）
链 H
1–234（234 aa）
|
未记录 | PRF 7-DEAZA-7-AMINOMETHYL-GUANINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT
IN A CHAMBER WITH THE
TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES
CELSIUS.
|
分辨率 3.80 Å |
| 8G7E Cryo-EM structure of 3DVA component 0 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase plus preQ1 ligand 提交 2023-02-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–234（234 aa）
链 H
1–234（234 aa）
|
未记录 | PRF 7-DEAZA-7-AMINOMETHYL-GUANINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT
IN A CHAMBER WITH THE
TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES
CELSIUS.
|
分辨率 3.90 Å |
| 8G8Z Cryo-EM structure of 3DVA component 1 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase plus preQ1 ligand 提交 2023-02-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–234（234 aa）
链 H
1–234（234 aa）
|
未记录 | PRF 7-DEAZA-7-AMINOMETHYL-GUANINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in a chamber with the temperature set to 4 C.
|
分辨率 4.30 Å |
| 8PBL E. coli RNA polymerase elongation complex stalled at thymine dimer lesion 提交 2023-06-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–235（235 aa）
链 E
1–235（235 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å |
| 8T00 Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: closed duplex DNA (rPTCc) 提交 2023-05-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 G
4–237（234 aa）
链 H
4–237（234 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.69 Å |
| 9N07 Mfd-bound E.coli RNA polymerase elongation complex + ADP-BeF3 - L1 state 提交 2025-01-23 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
4–237（234 aa）
链 H
4–237（234 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.48 Å |
| 9N11 Mfd-bound E.coli RNA polymerase elongation complex + ADP-BeF3 - L1.5 state 提交 2025-01-24 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
4–237（234 aa）
链 H
4–237（234 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.29 Å |