当前蛋白身份：A0A5Q2GFB5
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6VYQ Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing an 15 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYR Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing an 18 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6VYS Escherichia coli transcription-translation complex A1 (TTC-A1) containing a 21 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYT Escherichia coli transcription-translation complex A2 (TTC-A2) containing a 15 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：64-meric（64） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 14.00 Å |
| 6VYU Escherichia coli transcription-translation complex C2 (TTC-C2) containing a 27 nt long mRNA spacer 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VYW Escherichia coli transcription-translation complex C3 (TTC-C3) containing mRNA with a 27 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6VYX Escherichia coli transcription-translation complex C4 (TTC-C4) containing mRNA with a 21 nt long spacer, transcription factor NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VYY Escherichia coli transcription-translation complex C5 (TTC-C5) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VYZ Escherichia coli transcription-translation complex C6 (TTC-C6) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusA, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.90 Å |
| 6VZ2 Escherichia coli transcription-translation complex D1 (TTC-D1) containing mRNA with a 27 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 6VZ5 Escherichia coli transcription-translation complex D3 (TTC-D3) containing mRNA with a 21 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 6X7F Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B2 (TTC-B2) containing an mRNA with a 24 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-05-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6X7K Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 24 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-05-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6X9Q Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 27 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-06-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6XDQ Cryo-EM structure of an Escherichia coli coupled transcription-translation complex B3 (TTC-B3) containing an mRNA with a 30 nt long spacer, transcription factors NusA and NusG, and fMet-tRNAs at P-site and E-site 提交 2020-06-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6XGF Escherichia coli transcription-translation complex B (TTC-B) containing an 30 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric（67） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 6XII Escherichia coli transcription-translation complex B (TTC-B) containing an 24 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric（67） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6XIJ Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing an 24 nt long mRNA spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-06-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 6YSR Structure of the P+9 stalled ribosome complex 提交 2020-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 332 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM HEPES, 30 mM KCl, 7 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.10 Å |
| 6YSS Structure of the P+9 ArfB-ribosome complex in the post-hydrolysis state 提交 2020-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 387 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM HEPES, 30 mM KCl, 7 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 2.60 Å |
| 6YST Structure of the P+9 ArfB-ribosome complex with P/E hybrid tRNA in the post-hydrolysis state 提交 2020-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 253 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM HEPES, 30 mM KCl, 7 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.20 Å |
| 6YSU Structure of the P+0 ArfB-ribosome complex in the post-hydrolysis state 提交 2020-04-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 356 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM HEPES, 30 mM KCl, 7 mM MgCl2, 0.1 % w/v DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7AF3 Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state M (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 51 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 7AF5 Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state I (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 52 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 7AF8 Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state E (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 51 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 7AFA Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state F (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 25 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 7AFD Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state A (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 22 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.44 Å |
| 7AFH Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state C (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 7AFK Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state D (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 7AFN Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state B (head domain) 提交 2020-09-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 11 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 7CPJ ycbZ-stalled 70S ribosome 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–179（179 aa）
|
未记录 | ILE ISOLEUCINE × 1 PRO PROLINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7K00 Structure of the Bacterial Ribosome at 2 Angstrom Resolution 提交 2020-09-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | PAR PAROMOMYCIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 309 SPD SPERMIDINE × 16 SPM SPERMINE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.98 Å |
| 7NAX Complete Bacterial 30S ribosomal subunit assembly complex state I (Consensus Refinement) 提交 2021-01-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–179（179 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 181 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |