当前蛋白身份:A0A6B7JGY6
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7KC0 Structure of the Saccharomyces cerevisiae replicative polymerase delta in complex with a primer/template and the PCNA clamp 提交 2020-10-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致 |
链 E
1–258(258 aa)
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8DR0 Closed state of RFC:PCNA bound to a 3' ss/dsDNA junction 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致 |
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
链 H
1–258(258 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 8DR5 Open state of RFC:PCNA bound to a 3' ss/dsDNA junction (DNA2) with NTD 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
链 H
1–258(258 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 8DR7 Open state of RFC:PCNA bound to a nicked dsDNA 提交 2022-07-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致 |
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
链 H
1–258(258 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8THC Structure of the Saccharomyces cerevisiae clamp unloader Elg1-RFC bound to a cracked PCNA 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
链 H
1–258(258 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 8THD Structure of the Saccharomyces cerevisiae clamp unloader Elg1-RFC bound to PCNA 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 F
1–258(258 aa)
链 G
1–258(258 aa)
链 H
1–258(258 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |