当前蛋白身份:A0A6B7JGY6 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7KC0 Structure of the Saccharomyces cerevisiae replicative polymerase delta in complex with a primer/template and the PCNA clamp 提交 2020-10-04 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 E 1–258(258 aa)
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8DR0 Closed state of RFC:PCNA bound to a 3' ss/dsDNA junction 提交 2022-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
链 H 1–258(258 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8DR5 Open state of RFC:PCNA bound to a 3' ss/dsDNA junction (DNA2) with NTD 提交 2022-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
链 H 1–258(258 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8DR7 Open state of RFC:PCNA bound to a nicked dsDNA 提交 2022-07-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
链 H 1–258(258 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8THC Structure of the Saccharomyces cerevisiae clamp unloader Elg1-RFC bound to a cracked PCNA 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
链 H 1–258(258 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.67 Å
8THD Structure of the Saccharomyces cerevisiae clamp unloader Elg1-RFC bound to PCNA 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 F 1–258(258 aa)
链 G 1–258(258 aa)
链 H 1–258(258 aa)
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å