当前蛋白身份:A0A8J1LZU9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 d 32–126(95 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VMJ H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ119-450 提交 2024-01-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 M 31–126(96 aa)
链 S 31–126(96 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VMN H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-13 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:decameric(10) 与全部聚合物一致
链 M 31–126(96 aa)
链 S 31–126(96 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9N6K 2.88 A S.cerevisiae Chd1[L886G/L889G/L891G]-nucleosome 2:1 complex with DNA-binding domain 提交 2025-02-05 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 D 33–126(94 aa)
链 H 33–126(94 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9V2V Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with mono-nucleosome 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 P 32–124(93 aa)
链 T 32–124(93 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9V2W Cryo-EM structure of the histone deacetylase complex Rpd3L in complex with di-nucleosome 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致
链 D 32–124(93 aa)
链 N 32–124(93 aa)
链 P 32–124(93 aa)
链 T 32–124(93 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å