当前蛋白身份:A1Z1Q3 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4IQY Crystal structure of the human protein-proximal ADP-ribosyl-hydrolase MacroD2 提交 2013-01-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–243(237 aa) 片段:macrodomain (UNP residues 7-243)
未记录 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;18% PEG3350, 0.1M HEPES, 0.1M MgFormate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.187
4IQY Crystal structure of the human protein-proximal ADP-ribosyl-hydrolase MacroD2 提交 2013-01-14 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 7–243(237 aa) 片段:macrodomain (UNP residues 7-243)
未记录 AR6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINOPURIN-9-YL)-3,4-DIHYDROXY-OXOLAN-2-YL]METHYL[HYDROXY-[[(2R,3S,4R,5S)-3,4,5-TRIHYDROXYOXOLAN-2-YL]METHOXY]PHOSPHORYL] HYDROGEN PHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;18% PEG3350, 0.1M HEPES, 0.1M MgFormate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.55 Å R-free 0.187
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 7–243(237 aa)
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24 Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24 Assembly 4 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 7–243(237 aa)
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 7–243(237 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 7–243(237 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 7–243(237 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 D 7–243(237 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 E 7–243(237 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 F 7–243(237 aa)
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 7 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 G 7–243(237 aa)
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6Y73 The crystal structure of human MACROD2 in space group P43 提交 2020-02-28 Assembly 8 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 H 7–243(237 aa)
未记录 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.7;293 K;0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.203