当前蛋白身份：A6NED2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6F4R Human JMJD5 (N308C) in complex with Mn(II), NOG and RCCD1 (139-143) (complex-3) 提交 2017-11-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
139–143（5 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；298 K；0.1M Bis-Tris pH 5.8, 25 % PEG3350, 0.002 M MnCl2, 300 nl sitting drops (sample:well, 1:1 ratio)
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分辨率 1.30 Å R-free 0.162 |
| 6F4S Human JMJD5 (N308C) in complex with Mn(II), 2OG and RCCD1 (139-143) (complex-4) 提交 2017-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
139–143（5 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 29 % PEG3350, 0.002 M MnCl2, 300 nl sitting drops (sample:well, 1:2 ratio)
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分辨率 1.46 Å R-free 0.152 |
| 6F4T Human JMJD5 (W414C) in complex with Mn(II), NOG and RCCD1 (139-143) (complex-5) 提交 2017-11-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
139–143（5 aa）
片段：UNP residues 139-143
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 17.1 % PEG3350, 0.002 M MnCl2, 300 nl sitting drops (sample:well, 1:1 ratio)
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分辨率 1.22 Å R-free 0.154 |