当前蛋白身份：B2J981
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5HJF The apo form of Dps4 from Nostoc punctiforme 提交 2016-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–182（182 aa）
链 B
1–182（182 aa）
链 C
1–182（182 aa）
链 D
1–182（182 aa）
|
突变：S2A 突变：S2A 突变：S2A 突变：S2A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25% SOKALAN HP 66, 0.1 M HEPES pH 7.0 and 0.2 M NaOAc
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.146 |
| 5HJH Dps4 from Nostoc punctiforme in complex with Fe ions 提交 2016-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
5–182（178 aa）
链 B
5–182（178 aa）
链 C
5–182（178 aa）
链 D
5–182（178 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 24 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；25% SOKALAN HP 66, 0.1 M HEPES pH 7.0 and 0.2 M NaOAc
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.193 |
| 5I4J Dps4 from Nostoc punctiforme in complex with Zn ions 提交 2016-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
6–182（177 aa）
链 B
6–182（177 aa）
链 C
6–182（177 aa）
链 D
6–182（177 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% SOKALAN HP 66, 0.1M HEPES pH 7.0 and 0.2M NaOAc,
|
分辨率 2.39 Å R-free 0.214 |
| 7RZQ Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.09 Å |
| 7RZR Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with D936Y mutation 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
突变：D936Y 突变：D936Y 突变：D936Y | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.27 Å |
| 7RZS Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with L938F mutation 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
突变：L938F 突变：L938F 突变：L938F | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.52 Å |
| 7RZT Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with S940F mutation 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
突变：S940F 突变：S940F 突变：S940F | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.35 Å |
| 7RZU Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with A942S mutation 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
突变：A942S 突变：A942S 突变：A942S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 7RZV Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with V1176F mutation 提交 2021-08-27 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.11 Å |
| 7TIK Structure of the SARS-CoV-2 Omicron spike post-fusion bundle 提交 2022-01-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
4–178（175 aa）
链 B
4–178（175 aa）
链 C
4–178（175 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8CZI Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with extended HR2 提交 2022-05-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.22 Å |
| 8FA1 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 HR1HR2 fusion core complex with N969K mutation 提交 2022-11-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
4–178（175 aa）
链 B
4–178（175 aa）
链 C
4–178（175 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.51 Å |
| 8FA2 Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 Omicron HR1-42G complex 提交 2022-11-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
5–178（174 aa）
链 B
5–178（174 aa）
链 C
5–178（174 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |