当前蛋白身份:B2RXS4 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5E6P PlexinB2 cytoplasmic region/PDZ-RhoGEF PDZ domain complex 提交 2015-10-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1226–1842(617 aa) 片段:UNP residues 1226-1842
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.3;293 K;0.2 M K/Na tartrate, 0.1 M Na citrate pH 5.3, 1.4 M ammonium sulfate
分辨率 3.21 Å R-free 0.297
7KDC The complex between RhoD and the Plexin B2 RBD 提交 2020-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1463–1565(103 aa)
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M MgCl2, 22 % (w/v) PEG 3350, and 100 mM MIB (pH 6.8, sodium malonate, imidazole, and boric acid mixed at 2:3:3 molar ratio).
分辨率 3.10 Å R-free 0.266
7KDC The complex between RhoD and the Plexin B2 RBD 提交 2020-10-08 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1463–1565(103 aa)
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M MgCl2, 22 % (w/v) PEG 3350, and 100 mM MIB (pH 6.8, sodium malonate, imidazole, and boric acid mixed at 2:3:3 molar ratio).
分辨率 3.10 Å R-free 0.266