当前蛋白身份：B7MJ81
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5KOF Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabB, and Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2016-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–78（78 aa）
链 D
1–78（78 aa）
|
未记录 | 6W5 [(3~{S})-2,2-dimethyl-3-oxidanyl-4-oxidanylidene-4-[[3-oxidanylidene-3-[2-(prop-2-enoylamino)ethylamino]propyl]amino]butyl] dihydrogen phosphate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；298 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate pH 5.4, 20% PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.229 |
| 5VCB Crystal structure of holo-(acyl-carrier-protein) synthase:holo(acyl-carrier-protein) complex from Escherichia Coli. 提交 2017-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 d
2–78（77 aa）
链 e
2–78（77 aa）
链 f
2–78（77 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0
18-22% PEG 6k or 18-22% PEG 10k
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5VCB Crystal structure of holo-(acyl-carrier-protein) synthase:holo(acyl-carrier-protein) complex from Escherichia Coli. 提交 2017-03-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 J
2–78（77 aa）
链 K
2–78（77 aa）
链 L
2–78（77 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0
18-22% PEG 6k or 18-22% PEG 10k
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5VCB Crystal structure of holo-(acyl-carrier-protein) synthase:holo(acyl-carrier-protein) complex from Escherichia Coli. 提交 2017-03-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
2–78（77 aa）
链 Q
2–78（77 aa）
链 R
2–78（77 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0
18-22% PEG 6k or 18-22% PEG 10k
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5VCB Crystal structure of holo-(acyl-carrier-protein) synthase:holo(acyl-carrier-protein) complex from Escherichia Coli. 提交 2017-03-31 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
2–78（77 aa）
链 E
2–78（77 aa）
链 F
2–78（77 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0
18-22% PEG 6k or 18-22% PEG 10k
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5VCB Crystal structure of holo-(acyl-carrier-protein) synthase:holo(acyl-carrier-protein) complex from Escherichia Coli. 提交 2017-03-31 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 V
2–78（77 aa）
链 W
2–78（77 aa）
链 X
2–78（77 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 7.0
18-22% PEG 6k or 18-22% PEG 10k
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.297 |
| 5WGB Crystal Structure of the Human mitochondrial Cysteine Desulfurase in complex with ISD11 and E. coli ACP1 protein at 2.75A 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；285 K；0.1 M MES pH 6.5
0.3 M Ammonium Acetate
20 mM Calcium Acetate
20 mM CaCl2
19 % isopropanol
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.255 |
| 5WKP Crystal Structure of the Human mitochondrial Cysteine Desulfurase in complex with ISD11 and Iron-Sulfur Cluster Scaffold Protein ISCU1, and E. coli ACP1 protein at 3.15A 提交 2017-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
链 G
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；285 K；0.1 M MES pH 7
15 % PEG 3350
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.242 |
| 5WLW Crystal Structure of the Human Mitochondrial Cysteine Desulfurase with active Cysteine Loop within ISCU1 active site, coordinating Zn ion. Complexed with human ISD11 and E. coli ACP1 at 3.3A. 提交 2017-07-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
链 G
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M MES pH 7.0
15 % PEG 3350
|
分辨率 3.32 Å R-free 0.255 |
| 6DFL WaaP in complex with acyl carrier protein 提交 2018-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–74（72 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | G9S S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] hexadecanethioate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM HEPES pH 7.4, 5% Jeffamine M-600
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.269 |
| 6N3P Crosslinked AcpP=FabZ complex from E. coli Type II FAS 提交 2018-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 G
2–78（77 aa）
链 H
2–78（77 aa）
链 I
2–78（77 aa）
链 J
2–78（77 aa）
链 K
2–78（77 aa）
链 L
2–78（77 aa）
|
未记录 | XLN N~3~-{(2R)-4-[(dihydroxyphosphanyl)oxy]-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl}-N-(3-{[(1Z)-pent-1-en-1-yl]sulfonyl}propyl)-beta-alaninamide × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.5, 200 mM MgCl2, 19% PEG 3350, 1:1 mix of 9.5 mg/mL protein and reservoir solution.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 6UXE Structure of the human mitochondrial desulfurase complex Nfs1-ISCU2(M140I)-ISD11 with E.coli ACP1 at 1.57 A resolution showing flexibility of N terminal end of ISCU2 提交 2019-11-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 100 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 22 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 4 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 6 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；288 K；0.1 M MES pH 6.0-6.5, 22% PEG400
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.180 |
| 6W1D Structure of human mitochondrial complex Nfs1-ISCU2 (WT)-ISD11 with E.coli ACP1 at 1.8 A resolution (NIAU)2 提交 2020-03-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 96 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 22 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 4 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 6 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；288 K；0.1 M MES pH 6.0-6.5
22 % PEG 400
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.189 |
| 6WI2 Structure of human mitochondrial complex Nfs1-ISCU2-ISD11 with E.coli ACP1 at 1.95 A resolution (NIAU)2. N-terminal mutation of ISCU2 (L35) traps Nfs1 Cys loop in the active site of ISCU2 without metal present. 提交 2020-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 36 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 10 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；288 K；0.1 M MES pH 5.5
22.5 % PEG 400
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.185 |
| 6WIH N-terminal mutation of ISCU2 (L35H36) traps Nfs1 Cys loop in the active site of ISCU2 without metal present. Structure of human mitochondrial complex Nfs1-ISCU2(L35H36)-ISD11 with E.coli ACP1 at 1.9 A resolution (NIAU)2. 提交 2020-04-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 GOL GLYCEROL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 38 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 1 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；288 K；0.1 M MES pH 5.5
22.5 % PEG 400
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.186 |
| 7RTK Structure of the (NIAU)2 complex with N-terminal mutation of ISCU2 Y35D at 2.5 A resolution 提交 2021-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 58 GOL GLYCEROL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 16 P15 2,5,8,11,14,17-HEXAOXANONADECAN-19-OL × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 6 EDT {[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID × 2 8Q1 S-[2-({N-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] dodecanethioate × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；288 K；0.1 M MES pH 5.5
22.5 % PEG 400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.214 |
| 7SQI Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabB, and C14-crypto Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2021-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–78（78 aa）
链 D
1–78（78 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 A7V N-{2-[(2Z)-3-chlorotetradec-2-enamido]ethyl}-N~3~-[(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；281 K；20% PEG 8000, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M sodium cacodylate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.205 |
| 7SZ9 Crosslinked Crystal Structure of Type II Fatty Acid Synthase Ketosynthase, FabB, and C16:1-crypto Acyl Carrier Protein, AcpP 提交 2021-11-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–78（77 aa）
链 D
2–78（77 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 DJ5 N~3~-{(2R)-4-[(dihydroxyphosphanyl)oxy]-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl}-N-(2-{[(9Z)-hexadec-9-enoyl]amino}ethyl)-beta-alaninamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；281 K；20% PEG 8000, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M sodium cacodylate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.255 |
| 8DLE Crosslinked Crystal Structure of the 8-amino-7-oxonanoate synthase, BioF, and Benzene Sulfonyl Fluoride-crypto Acyl Carrier Protein, BSF-ACP 提交 2022-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–78（78 aa）
|
未记录 | PLP PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 SWC N-{(2R)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-[(trihydroxy-lambda~5~-phosphanyl)oxy]butanoyl}-beta-alanyl-N-(2-{4-[fluoro(dihydroxy)-lambda~4~-sulfanyl]phenyl}ethyl)-beta-alaninamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289.15 K；1.5 M ammonium sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.246 |