当前蛋白身份:C1K0Y1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6JTN Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut10m peptide 提交 2019-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
26–298(273 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.200 |
| 6JTP Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut9m peptide 提交 2019-04-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
26–298(273 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.283 |
| 6ULI Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
25–298(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.226 |
| 6ULK Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
25–298(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 6ULN Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
25–298(274 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
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分辨率 2.01 Å R-free 0.217 |
| 6ULR Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
25–298(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.262 |
| 6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 D
25–298(274 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
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分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |
| 6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
25–298(274 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
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分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |