当前蛋白身份:C1K0Y1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6JTN Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut10m peptide 提交 2019-04-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 26–298(273 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.200
6JTP Crystal structure of HLA-C08 in complex with a tumor mut9m peptide 提交 2019-04-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 26–298(273 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;0.2M ammonium acetate, 0.1M HEPES (pH 7.5), 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.283
6ULI Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–298(274 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
分辨率 1.88 Å R-free 0.226
6ULK Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–298(274 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.05M CaCl2 dihydrate, 30% PEG MME 500
分辨率 1.90 Å R-free 0.270
6ULN Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 25–298(274 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
分辨率 2.01 Å R-free 0.217
6ULR Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 25–298(274 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;22% PEG 3350, 0.1M MOPS pH 7.1 and 0.25M MgSO4
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 25–298(274 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
6UON Molecular basis for tumor infiltrating TCR recognition of hotspot KRAS-G12D mutation 提交 2019-10-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 25–298(274 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;12.5% PEG 4000, 0.1M Na Cacodylate pH 5.8, 0.2M (NH4)2SO4 and 10% glycerol
分辨率 3.50 Å R-free 0.294