当前蛋白身份：C3SME2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4UY8 Molecular basis for the ribosome functioning as a L-tryptophan sensor - Cryo-EM structure of a TnaC stalled E.coli ribosome 提交 2014-08-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 X
2–78（77 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 143 ZN ZINC ION × 1 TRP TRYPTOPHAN × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 --CRYOGEN- ETHANE,INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV
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分辨率 3.80 Å |
| 4V85 Crystal Structure of Release Factor RF3 Trapped in the GTP State on a Rotated Conformation of the Ribosome. 提交 2011-06-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 B1
1–78（78 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 493 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Tris Ac PH.7.0, 25-35 mM KCL, 6.1% PEG 20000, 1% glycerol, 50mM sucrose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.250 |
| 8AKN Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the terminating ribosome 提交 2022-07-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–78（78 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 305 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.30 Å |
| 8AM9 Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the elongating ribosome 提交 2022-08-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–78（78 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 293 SPM SPERMINE × 1 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.80 Å |
| 8ANA Cryo-EM structure of the proline-rich antimicrobial peptide drosocin bound to the 50S ribosomal subunit 提交 2022-08-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric（32） 与全部聚合物一致 |
链 w
1–78（78 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 A2G 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 216 SPM SPERMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.10 Å |